MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 24177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_016915	GAA	2	6	311373	311378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018809
6003	NC_016915	GAA	2	6	311511	311516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018809
6004	NC_016915	AGA	2	6	311598	311603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018810
6005	NC_016915	TAA	2	6	311627	311632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018810
6006	NC_016915	GAAGAT	2	12	311668	311679	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379018810
6007	NC_016915	CTG	2	6	311741	311746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018810
6008	NC_016915	AGGT	2	8	311750	311757	25 %	25 %	50 %	0 %	379018810
6009	NC_016915	ATA	3	9	311804	311812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018810
6010	NC_016915	GAA	2	6	311833	311838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018810
6011	NC_016915	GCTTG	2	10	311872	311881	0 %	40 %	40 %	20 %	379018810
6012	NC_016915	TAG	2	6	311912	311917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018810
6013	NC_016915	GCTA	2	8	311975	311982	25 %	25 %	25 %	25 %	379018811
6014	NC_016915	TTG	2	6	312004	312009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018811
6015	NC_016915	CAA	2	6	312036	312041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018811
6016	NC_016915	TA	3	6	312050	312055	50 %	50 %	0 %	0 %	379018811
6017	NC_016915	GCA	2	6	312117	312122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018811
6018	NC_016915	AAC	2	6	312132	312137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018811
6019	NC_016915	AAAT	2	8	312149	312156	75 %	25 %	0 %	0 %	379018811
6020	NC_016915	TAA	2	6	312161	312166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018811
6021	NC_016915	TAAA	2	8	312179	312186	75 %	25 %	0 %	0 %	379018811
6022	NC_016915	ATT	2	6	312198	312203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018812
6023	NC_016915	T	6	6	312202	312207	0 %	100 %	0 %	0 %	379018812
6024	NC_016915	TAT	2	6	312215	312220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018812
6025	NC_016915	CAT	2	6	312263	312268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018812
6026	NC_016915	T	7	7	312327	312333	0 %	100 %	0 %	0 %	379018812
6027	NC_016915	T	6	6	312349	312354	0 %	100 %	0 %	0 %	379018812
6028	NC_016915	A	6	6	312363	312368	100 %	0 %	0 %	0 %	379018812
6029	NC_016915	AGC	2	6	312408	312413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018812
6030	NC_016915	AAG	2	6	312419	312424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018812
6031	NC_016915	AGCT	2	8	312431	312438	25 %	25 %	25 %	25 %	379018812
6032	NC_016915	AGT	2	6	312547	312552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018812
6033	NC_016915	AT	3	6	312805	312810	50 %	50 %	0 %	0 %	379018812
6034	NC_016915	ACCA	2	8	312813	312820	50 %	0 %	0 %	50 %	379018812
6035	NC_016915	GCC	2	6	312825	312830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379018812
6036	NC_016915	CCT	2	6	312859	312864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379018812
6037	NC_016915	TAA	2	6	312870	312875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018812
6038	NC_016915	GAA	2	6	312880	312885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018812
6039	NC_016915	CTG	2	6	312926	312931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018812
6040	NC_016915	CCG	2	6	312952	312957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379018812
6041	NC_016915	ATA	2	6	312968	312973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018812
6042	NC_016915	ACA	2	6	312991	312996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018812
6043	NC_016915	TTC	2	6	313131	313136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018812
6044	NC_016915	A	7	7	313188	313194	100 %	0 %	0 %	0 %	379018812
6045	NC_016915	CGC	2	6	313208	313213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379018812
6046	NC_016915	GTT	2	6	313222	313227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018812
6047	NC_016915	TAA	3	9	313263	313271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018812
6048	NC_016915	AAT	2	6	313282	313287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018812
6049	NC_016915	ATA	2	6	313340	313345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018812
6050	NC_016915	AAT	2	6	313351	313356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018812
6051	NC_016915	TGA	3	9	313416	313424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018812
6052	NC_016915	AT	3	6	313482	313487	50 %	50 %	0 %	0 %	379018812
6053	NC_016915	AAAG	2	8	313500	313507	75 %	0 %	25 %	0 %	379018812
6054	NC_016915	AGA	2	6	313531	313536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018812
6055	NC_016915	AG	3	6	313545	313550	50 %	0 %	50 %	0 %	379018812
6056	NC_016915	TTA	2	6	313553	313558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018812
6057	NC_016915	ATGATA	2	12	313562	313573	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379018812
6058	NC_016915	TAAA	2	8	313574	313581	75 %	25 %	0 %	0 %	379018812
6059	NC_016915	AAGA	2	8	313582	313589	75 %	0 %	25 %	0 %	379018812
6060	NC_016915	ATCT	2	8	313601	313608	25 %	50 %	0 %	25 %	379018812
6061	NC_016915	TGCG	2	8	313667	313674	0 %	25 %	50 %	25 %	379018812
6062	NC_016915	GTG	2	6	313715	313720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379018812
6063	NC_016915	CTG	2	6	313733	313738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018812
6064	NC_016915	ATG	2	6	313808	313813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018812
6065	NC_016915	AT	3	6	314102	314107	50 %	50 %	0 %	0 %	379018813
6066	NC_016915	AAAGA	2	10	314130	314139	80 %	0 %	20 %	0 %	379018813
6067	NC_016915	ATA	2	6	314155	314160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018813
6068	NC_016915	CAT	2	6	314256	314261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018813
6069	NC_016915	ATC	2	6	314319	314324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018813
6070	NC_016915	CAT	2	6	314337	314342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018813
6071	NC_016915	ATC	2	6	314392	314397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018813
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6077	NC_016915	GAA	2	6	314619	314624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018813
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6079	NC_016915	GAAGTA	2	12	314775	314786	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379018813
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6094	NC_016915	TAA	2	6	315554	315559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018813
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6096	NC_016915	A	6	6	315637	315642	100 %	0 %	0 %	0 %	379018813
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6104	NC_016915	GTAG	2	8	315870	315877	25 %	25 %	50 %	0 %	379018813
6105	NC_016915	ATG	2	6	315897	315902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018813
6106	NC_016915	ACT	2	6	315921	315926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018813
6107	NC_016915	A	6	6	315937	315942	100 %	0 %	0 %	0 %	379018813
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6109	NC_016915	TAG	2	6	315991	315996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018813
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6111	NC_016915	ATTT	2	8	316034	316041	25 %	75 %	0 %	0 %	379018813
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6115	NC_016915	T	6	6	316250	316255	0 %	100 %	0 %	0 %	379018814
6116	NC_016915	AAAAT	2	10	316302	316311	80 %	20 %	0 %	0 %	379018814
6117	NC_016915	AAG	2	6	316341	316346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018814
6118	NC_016915	A	6	6	316392	316397	100 %	0 %	0 %	0 %	379018814
6119	NC_016915	TAT	2	6	316451	316456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018814
6120	NC_016915	AGA	2	6	316471	316476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018814
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6494	NC_016915	GAT	2	6	333603	333608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018837
6495	NC_016915	TAT	2	6	333709	333714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018837
6496	NC_016915	AC	3	6	333735	333740	50 %	0 %	0 %	50 %	379018837
6497	NC_016915	GATA	2	8	333885	333892	50 %	25 %	25 %	0 %	379018838
6498	NC_016915	ATG	2	6	333935	333940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018838
6499	NC_016915	T	6	6	334025	334030	0 %	100 %	0 %	0 %	379018838
6500	NC_016915	AAAG	2	8	334047	334054	75 %	0 %	25 %	0 %	379018838

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