MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 24177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_016915	ATG	2	6	282345	282350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018777
5503	NC_016915	GATA	2	8	282434	282441	50 %	25 %	25 %	0 %	379018777
5504	NC_016915	AT	4	8	282442	282449	50 %	50 %	0 %	0 %	379018777
5505	NC_016915	TAA	2	6	282619	282624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018778
5506	NC_016915	TTG	2	6	282664	282669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018778
5507	NC_016915	ATG	2	6	282832	282837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018779
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5509	NC_016915	TTA	2	6	282875	282880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018779
5510	NC_016915	GTA	2	6	282886	282891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018779
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5515	NC_016915	CTT	2	6	283109	283114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018780
5516	NC_016915	T	6	6	283119	283124	0 %	100 %	0 %	0 %	379018780
5517	NC_016915	TAA	2	6	283173	283178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018780
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5519	NC_016915	TTC	2	6	283216	283221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018781
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5521	NC_016915	TTC	2	6	283237	283242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018781
5522	NC_016915	ATT	3	9	283259	283267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018781
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5529	NC_016915	GTA	2	6	283951	283956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018782
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5537	NC_016915	GTT	2	6	284235	284240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018783
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5544	NC_016915	AT	3	6	284425	284430	50 %	50 %	0 %	0 %	379018783
5545	NC_016915	TGA	2	6	284431	284436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018783
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5549	NC_016915	CGGAG	2	10	284501	284510	20 %	0 %	60 %	20 %	379018783
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5553	NC_016915	AAT	2	6	284702	284707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018783
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5557	NC_016915	AG	3	6	284828	284833	50 %	0 %	50 %	0 %	379018783
5558	NC_016915	A	6	6	284835	284840	100 %	0 %	0 %	0 %	379018783
5559	NC_016915	AGA	2	6	284852	284857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018783
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5611	NC_016915	TCA	2	6	292142	292147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018787
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5994	NC_016915	TAC	2	6	311043	311048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018809
5995	NC_016915	ATA	2	6	311077	311082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018809
5996	NC_016915	ACT	3	9	311091	311099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018809
5997	NC_016915	GAGG	2	8	311127	311134	25 %	0 %	75 %	0 %	379018809
5998	NC_016915	GGGA	2	8	311239	311246	25 %	0 %	75 %	0 %	379018809
5999	NC_016915	AGC	2	6	311252	311257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018809
6000	NC_016915	TTG	2	6	311269	311274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018809

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