MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 24304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3503	NC_016914	A	6	6	176074	176079	100 %	0 %	0 %	0 %	379017347
3504	NC_016914	AGC	2	6	176102	176107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017347
3505	NC_016914	CAT	2	6	176116	176121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017347
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3511	NC_016914	ATC	2	6	176421	176426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017347
3512	NC_016914	GTGCC	2	10	176431	176440	0 %	20 %	40 %	40 %	379017347
3513	NC_016914	AT	3	6	176447	176452	50 %	50 %	0 %	0 %	379017347
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3603	NC_016914	TAG	2	6	181780	181785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017354
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3605	NC_016914	A	7	7	181813	181819	100 %	0 %	0 %	0 %	379017354
3606	NC_016914	GAAA	2	8	181863	181870	75 %	0 %	25 %	0 %	379017354
3607	NC_016914	A	6	6	181868	181873	100 %	0 %	0 %	0 %	379017354
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3991	NC_016914	TA	3	6	200284	200289	50 %	50 %	0 %	0 %	379017363
3992	NC_016914	T	6	6	200331	200336	0 %	100 %	0 %	0 %	379017363
3993	NC_016914	GGC	2	6	200339	200344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379017363
3994	NC_016914	ATTA	2	8	200440	200447	50 %	50 %	0 %	0 %	379017364
3995	NC_016914	ATT	2	6	200566	200571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017364
3996	NC_016914	CCA	2	6	200617	200622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379017364
3997	NC_016914	CTT	2	6	200653	200658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017364
3998	NC_016914	T	6	6	200694	200699	0 %	100 %	0 %	0 %	379017364
3999	NC_016914	AGCA	2	8	200715	200722	50 %	0 %	25 %	25 %	379017364
4000	NC_016914	CAG	2	6	200726	200731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017364

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