MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 24304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23502	NC_016914	AGC	2	6	1230727	1230732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018451
23503	NC_016914	A	7	7	1230743	1230749	100 %	0 %	0 %	0 %	379018451
23504	NC_016914	GAT	2	6	1230764	1230769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018451
23505	NC_016914	CAT	2	6	1230772	1230777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018451
23506	NC_016914	AAAC	2	8	1230786	1230793	75 %	0 %	0 %	25 %	379018451
23507	NC_016914	T	6	6	1230846	1230851	0 %	100 %	0 %	0 %	379018451
23508	NC_016914	AT	3	6	1230869	1230874	50 %	50 %	0 %	0 %	379018451
23509	NC_016914	AAC	2	6	1231046	1231051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018451
23510	NC_016914	ATTT	2	8	1231065	1231072	25 %	75 %	0 %	0 %	379018451
23511	NC_016914	TAAT	2	8	1231080	1231087	50 %	50 %	0 %	0 %	379018451
23512	NC_016914	CGC	2	6	1231229	1231234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379018451
23513	NC_016914	TTG	2	6	1231311	1231316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018451
23514	NC_016914	AAG	2	6	1231383	1231388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018451
23515	NC_016914	CTT	2	6	1231427	1231432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018451
23516	NC_016914	GAA	2	6	1231436	1231441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018451
23517	NC_016914	TAA	2	6	1231462	1231467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018451
23518	NC_016914	A	6	6	1231540	1231545	100 %	0 %	0 %	0 %	379018451
23519	NC_016914	GAA	2	6	1231577	1231582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018451
23520	NC_016914	CTTGG	2	10	1231617	1231626	0 %	40 %	40 %	20 %	379018451
23521	NC_016914	AAT	2	6	1231726	1231731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018451
23522	NC_016914	ATA	2	6	1231746	1231751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018451
23523	NC_016914	GAAGTA	2	12	1231874	1231885	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379018451
23524	NC_016914	TAT	2	6	1231912	1231917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018451
23525	NC_016914	TCA	2	6	1232011	1232016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018451
23526	NC_016914	AT	3	6	1232028	1232033	50 %	50 %	0 %	0 %	379018451
23527	NC_016914	GAA	2	6	1232144	1232149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018451
23528	NC_016914	ATT	2	6	1232180	1232185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018451
23529	NC_016914	ACT	2	6	1232204	1232209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018451
23530	NC_016914	AGT	2	6	1232287	1232292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018451
23531	NC_016914	CTT	2	6	1232307	1232312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018451
23532	NC_016914	GCG	2	6	1232322	1232327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379018451
23533	NC_016914	AGC	2	6	1232389	1232394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379018451
23534	NC_016914	GA	3	6	1232446	1232451	50 %	0 %	50 %	0 %	379018451
23535	NC_016914	TAA	2	6	1232494	1232499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018451
23536	NC_016914	TTA	2	6	1232508	1232513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018451
23537	NC_016914	TAA	2	6	1232521	1232526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018451
23538	NC_016914	A	6	6	1232565	1232570	100 %	0 %	0 %	0 %	379018451
23539	NC_016914	AAGC	2	8	1232612	1232619	50 %	0 %	25 %	25 %	379018451
23540	NC_016914	TAT	2	6	1232643	1232648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018451
23541	NC_016914	A	6	6	1232651	1232656	100 %	0 %	0 %	0 %	379018451
23542	NC_016914	A	7	7	1232707	1232713	100 %	0 %	0 %	0 %	379018451
23543	NC_016914	AGA	2	6	1232716	1232721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379018451
23544	NC_016914	TA	3	6	1232733	1232738	50 %	50 %	0 %	0 %	379018451
23545	NC_016914	A	7	7	1232821	1232827	100 %	0 %	0 %	0 %	379018451
23546	NC_016914	CTTT	2	8	1232828	1232835	0 %	75 %	0 %	25 %	379018451
23547	NC_016914	GCG	2	6	1232850	1232855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379018451
23548	NC_016914	CAAG	2	8	1232864	1232871	50 %	0 %	25 %	25 %	379018451
23549	NC_016914	CTAA	2	8	1232906	1232913	50 %	25 %	0 %	25 %	379018451
23550	NC_016914	GTA	2	6	1232947	1232952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018451
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23552	NC_016914	GCT	2	6	1233157	1233162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018452
23553	NC_016914	CTGC	2	8	1233245	1233252	0 %	25 %	25 %	50 %	379018452
23554	NC_016914	CAA	2	6	1233266	1233271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018452
23555	NC_016914	CAA	2	6	1233284	1233289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379018452
23556	NC_016914	ATG	2	6	1233303	1233308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018452
23557	NC_016914	TCT	2	6	1233349	1233354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018452
23558	NC_016914	TAA	2	6	1233356	1233361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018452
23559	NC_016914	TTGA	2	8	1233395	1233402	25 %	50 %	25 %	0 %	379018452
23560	NC_016914	ATAG	2	8	1233443	1233450	50 %	25 %	25 %	0 %	379018452
23561	NC_016914	TTG	2	6	1233459	1233464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018452
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23565	NC_016914	ATT	2	6	1233591	1233596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379018452
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23567	NC_016914	TCCT	2	8	1233737	1233744	0 %	50 %	0 %	50 %	379018452
23568	NC_016914	CTT	2	6	1233788	1233793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018452
23569	NC_016914	CTG	2	6	1233801	1233806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018452
23570	NC_016914	ATA	2	6	1233886	1233891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018452
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23572	NC_016914	CAC	2	6	1234015	1234020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379018453
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23575	NC_016914	TGT	2	6	1234068	1234073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379018453
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23588	NC_016914	TC	3	6	1234760	1234765	0 %	50 %	0 %	50 %	379018453
23589	NC_016914	T	6	6	1234768	1234773	0 %	100 %	0 %	0 %	379018453
23590	NC_016914	T	6	6	1234790	1234795	0 %	100 %	0 %	0 %	379018453
23591	NC_016914	TA	3	6	1234859	1234864	50 %	50 %	0 %	0 %	379018453
23592	NC_016914	T	6	6	1234901	1234906	0 %	100 %	0 %	0 %	379018453
23593	NC_016914	T	6	6	1234918	1234923	0 %	100 %	0 %	0 %	379018453
23594	NC_016914	TGC	2	6	1234931	1234936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379018453
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23598	NC_016914	ATTA	2	8	1235024	1235031	50 %	50 %	0 %	0 %	379018453
23599	NC_016914	TTC	2	6	1235066	1235071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018453
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23602	NC_016914	T	6	6	1235135	1235140	0 %	100 %	0 %	0 %	379018453
23603	NC_016914	T	6	6	1235183	1235188	0 %	100 %	0 %	0 %	379018453
23604	NC_016914	ATA	2	6	1235241	1235246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379018453
23605	NC_016914	ACT	2	6	1235318	1235323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018453
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23607	NC_016914	GTA	2	6	1235389	1235394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379018453
23608	NC_016914	T	6	6	1235398	1235403	0 %	100 %	0 %	0 %	379018453
23609	NC_016914	CATAC	2	10	1235419	1235428	40 %	20 %	0 %	40 %	379018453
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23611	NC_016914	TCCT	2	8	1235486	1235493	0 %	50 %	0 %	50 %	379018453
23612	NC_016914	C	6	6	1235544	1235549	0 %	0 %	0 %	100 %	379018453
23613	NC_016914	ATC	2	6	1235576	1235581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379018453
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23616	NC_016914	TTC	2	6	1235651	1235656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379018453
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