MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 24304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016914	TTC	2	6	24332	24337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017193
502	NC_016914	GAA	2	6	24348	24353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017193
503	NC_016914	TACCT	2	10	24419	24428	20 %	40 %	0 %	40 %	379017193
504	NC_016914	GAA	2	6	24438	24443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017193
505	NC_016914	AAG	2	6	24445	24450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017193
506	NC_016914	AAGT	2	8	24457	24464	50 %	25 %	25 %	0 %	379017193
507	NC_016914	TACCT	2	10	24506	24515	20 %	40 %	0 %	40 %	379017193
508	NC_016914	GAA	2	6	24525	24530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017193
509	NC_016914	AAG	2	6	24532	24537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017193
510	NC_016914	AAGT	2	8	24544	24551	50 %	25 %	25 %	0 %	379017193
511	NC_016914	TACCT	2	10	24593	24602	20 %	40 %	0 %	40 %	379017193
512	NC_016914	GAA	2	6	24612	24617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017193
513	NC_016914	AAG	2	6	24619	24624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017193
514	NC_016914	AAGT	2	8	24631	24638	50 %	25 %	25 %	0 %	379017193
515	NC_016914	GCATTA	2	12	24684	24695	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379017193
516	NC_016914	GAA	2	6	24747	24752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017193
517	NC_016914	GAA	3	9	24777	24785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017193
518	NC_016914	TCCGAT	2	12	24801	24812	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379017193
519	NC_016914	A	7	7	24869	24875	100 %	0 %	0 %	0 %	379017193
520	NC_016914	AAATGC	2	12	24877	24888	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379017193
521	NC_016914	GTT	2	6	24927	24932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017193
522	NC_016914	ATA	2	6	24946	24951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017193
523	NC_016914	TAA	2	6	24983	24988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017193
524	NC_016914	TGA	2	6	25007	25012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017193
525	NC_016914	AGA	2	6	25013	25018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017193
526	NC_016914	TAA	2	6	25064	25069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017193
527	NC_016914	CTA	2	6	25120	25125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017193
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529	NC_016914	TTCA	2	8	25180	25187	25 %	50 %	0 %	25 %	379017193
530	NC_016914	ATTTAA	2	12	25190	25201	50 %	50 %	0 %	0 %	379017193
531	NC_016914	AAT	2	6	25212	25217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017193
532	NC_016914	TTA	2	6	25228	25233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017193
533	NC_016914	GAA	2	6	25274	25279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017193
534	NC_016914	TTA	2	6	25318	25323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017193
535	NC_016914	AAC	2	6	25331	25336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379017193
536	NC_016914	TTA	2	6	25444	25449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017193
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539	NC_016914	AT	3	6	25549	25554	50 %	50 %	0 %	0 %	379017193
540	NC_016914	TAA	2	6	25610	25615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017193
541	NC_016914	AATA	2	8	25673	25680	75 %	25 %	0 %	0 %	379017193
542	NC_016914	GTT	2	6	25683	25688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017193
543	NC_016914	ATA	2	6	25699	25704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017193
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545	NC_016914	TAC	2	6	25787	25792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017193
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552	NC_016914	TTAT	2	8	26672	26679	25 %	75 %	0 %	0 %	379017195
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555	NC_016914	AGCA	2	8	26746	26753	50 %	0 %	25 %	25 %	379017195
556	NC_016914	ACA	2	6	27215	27220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379017196
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559	NC_016914	GAA	2	6	27432	27437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017196
560	NC_016914	ATA	2	6	27441	27446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017196
561	NC_016914	TAT	2	6	27487	27492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017196
562	NC_016914	TAAT	2	8	27547	27554	50 %	50 %	0 %	0 %	379017196
563	NC_016914	TAC	2	6	27584	27589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017196
564	NC_016914	ATA	2	6	27595	27600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017196
565	NC_016914	TGA	2	6	27608	27613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017196
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568	NC_016914	ATATT	2	10	27660	27669	40 %	60 %	0 %	0 %	379017196
569	NC_016914	A	6	6	27683	27688	100 %	0 %	0 %	0 %	379017196
570	NC_016914	AAGA	2	8	27699	27706	75 %	0 %	25 %	0 %	379017196
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599	NC_016914	A	7	7	29229	29235	100 %	0 %	0 %	0 %	379017199
600	NC_016914	ATT	2	6	29280	29285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017199
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609	NC_016914	T	6	6	29499	29504	0 %	100 %	0 %	0 %	379017200
610	NC_016914	TCTA	2	8	29515	29522	25 %	50 %	0 %	25 %	379017200
611	NC_016914	TTTGT	2	10	29531	29540	0 %	80 %	20 %	0 %	379017200
612	NC_016914	ATTT	2	8	29559	29566	25 %	75 %	0 %	0 %	379017200
613	NC_016914	TGTC	2	8	29623	29630	0 %	50 %	25 %	25 %	379017200
614	NC_016914	TAT	2	6	29631	29636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017200
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618	NC_016914	A	6	6	29778	29783	100 %	0 %	0 %	0 %	379017201
619	NC_016914	A	6	6	29808	29813	100 %	0 %	0 %	0 %	379017201
620	NC_016914	AG	3	6	29903	29908	50 %	0 %	50 %	0 %	379017201
621	NC_016914	AT	3	6	29913	29918	50 %	50 %	0 %	0 %	379017201
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627	NC_016914	CAT	2	6	30379	30384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017202
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