MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 24304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016914	CCG	2	6	224738	224743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379017388
4502	NC_016914	CGA	2	6	224802	224807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017388
4503	NC_016914	ATA	2	6	224982	224987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017388
4504	NC_016914	TAC	2	6	225003	225008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017388
4505	NC_016914	TA	3	6	225034	225039	50 %	50 %	0 %	0 %	379017388
4506	NC_016914	TTGC	2	8	225087	225094	0 %	50 %	25 %	25 %	379017388
4507	NC_016914	AT	3	6	225098	225103	50 %	50 %	0 %	0 %	379017388
4508	NC_016914	A	6	6	225187	225192	100 %	0 %	0 %	0 %	379017388
4509	NC_016914	TAT	2	6	225745	225750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017389
4510	NC_016914	A	8	8	225775	225782	100 %	0 %	0 %	0 %	379017389
4511	NC_016914	GACC	2	8	225811	225818	25 %	0 %	25 %	50 %	379017389
4512	NC_016914	TCATAA	2	12	225823	225834	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379017389
4513	NC_016914	CCA	2	6	225922	225927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379017389
4514	NC_016914	TAATAT	2	12	225928	225939	50 %	50 %	0 %	0 %	379017389
4515	NC_016914	CAT	2	6	225965	225970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017389
4516	NC_016914	GAA	2	6	226053	226058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017389
4517	NC_016914	AAG	2	6	226065	226070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017389
4518	NC_016914	ATA	2	6	226270	226275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017390
4519	NC_016914	AGA	2	6	226334	226339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017390
4520	NC_016914	TA	4	8	226343	226350	50 %	50 %	0 %	0 %	379017390
4521	NC_016914	AAC	2	6	226380	226385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379017390
4522	NC_016914	CTT	2	6	226475	226480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379017390
4523	NC_016914	AAT	2	6	226517	226522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017390
4524	NC_016914	TGC	2	6	226526	226531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379017390
4525	NC_016914	T	7	7	226603	226609	0 %	100 %	0 %	0 %	379017390
4526	NC_016914	TAT	2	6	226631	226636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017390
4527	NC_016914	ATC	2	6	226676	226681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017390
4528	NC_016914	CAT	2	6	226686	226691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017390
4529	NC_016914	TTA	2	6	226753	226758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017390
4530	NC_016914	TAC	2	6	226766	226771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379017390
4531	NC_016914	TAT	3	9	226810	226818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017390
4532	NC_016914	A	6	6	226836	226841	100 %	0 %	0 %	0 %	379017390
4533	NC_016914	TAA	2	6	226889	226894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017390
4534	NC_016914	A	6	6	226943	226948	100 %	0 %	0 %	0 %	379017390
4535	NC_016914	AT	3	6	226953	226958	50 %	50 %	0 %	0 %	379017390
4536	NC_016914	GTG	2	6	227004	227009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379017390
4537	NC_016914	AGG	2	6	227425	227430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379017391
4538	NC_016914	TTA	2	6	227431	227436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379017391
4539	NC_016914	GAT	2	6	227456	227461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017391
4540	NC_016914	GAT	2	6	227483	227488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017391
4541	NC_016914	TAAATT	2	12	227524	227535	50 %	50 %	0 %	0 %	379017391
4542	NC_016914	GCC	2	6	227540	227545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379017391
4543	NC_016914	GCTT	2	8	227603	227610	0 %	50 %	25 %	25 %	379017391
4544	NC_016914	ATG	2	6	227794	227799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017391
4545	NC_016914	GAT	2	6	227843	227848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017391
4546	NC_016914	GGA	2	6	227849	227854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379017391
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4548	NC_016914	AGT	2	6	227930	227935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017391
4549	NC_016914	AGT	2	6	227943	227948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017391
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4551	NC_016914	AT	3	6	228032	228037	50 %	50 %	0 %	0 %	379017391
4552	NC_016914	AGA	2	6	228089	228094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379017391
4553	NC_016914	TTG	2	6	228151	228156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017391
4554	NC_016914	AGC	2	6	228161	228166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379017391
4555	NC_016914	TTG	2	6	228172	228177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379017391
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4557	NC_016914	A	6	6	228193	228198	100 %	0 %	0 %	0 %	379017391
4558	NC_016914	A	6	6	228212	228217	100 %	0 %	0 %	0 %	379017391
4559	NC_016914	A	8	8	228263	228270	100 %	0 %	0 %	0 %	379017391
4560	NC_016914	ATCA	2	8	228334	228341	50 %	25 %	0 %	25 %	379017391
4561	NC_016914	AAT	2	6	228356	228361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379017391
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4573	NC_016914	GGA	2	6	229815	229820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379017393
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4582	NC_016914	AGTC	2	8	230439	230446	25 %	25 %	25 %	25 %	379017394
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4587	NC_016914	T	8	8	231550	231557	0 %	100 %	0 %	0 %	379017395
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4603	NC_016914	ATG	2	6	232326	232331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379017395
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4606	NC_016914	GATT	2	8	232513	232520	25 %	50 %	25 %	0 %	379017395
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4622	NC_016914	AGAA	2	8	233243	233250	75 %	0 %	25 %	0 %	379017398
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