MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 2067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016913	TA	3	6	4943	4948	50 %	50 %	0 %	0 %	379015836
2	NC_016913	AT	3	6	5459	5464	50 %	50 %	0 %	0 %	379015836
3	NC_016913	AT	3	6	6125	6130	50 %	50 %	0 %	0 %	379015837
4	NC_016913	AT	3	6	6238	6243	50 %	50 %	0 %	0 %	379015837
5	NC_016913	TA	4	8	8304	8311	50 %	50 %	0 %	0 %	379015840
6	NC_016913	TA	3	6	9460	9465	50 %	50 %	0 %	0 %	379015842
7	NC_016913	TA	3	6	9891	9896	50 %	50 %	0 %	0 %	379015842
8	NC_016913	GA	3	6	10489	10494	50 %	0 %	50 %	0 %	379015843
9	NC_016913	TA	3	6	12412	12417	50 %	50 %	0 %	0 %	379015846
10	NC_016913	AT	3	6	15529	15534	50 %	50 %	0 %	0 %	379015849
11	NC_016913	AT	3	6	15563	15568	50 %	50 %	0 %	0 %	379015849
12	NC_016913	TA	3	6	18359	18364	50 %	50 %	0 %	0 %	379015856
13	NC_016913	TA	3	6	18370	18375	50 %	50 %	0 %	0 %	379015856
14	NC_016913	AT	3	6	20899	20904	50 %	50 %	0 %	0 %	379015859
15	NC_016913	AG	3	6	21354	21359	50 %	0 %	50 %	0 %	379015859
16	NC_016913	TA	3	6	21498	21503	50 %	50 %	0 %	0 %	379015859
17	NC_016913	CT	3	6	22333	22338	0 %	50 %	0 %	50 %	379015861
18	NC_016913	TA	3	6	22379	22384	50 %	50 %	0 %	0 %	379015861
19	NC_016913	TA	3	6	22466	22471	50 %	50 %	0 %	0 %	379015861
20	NC_016913	TA	3	6	22905	22910	50 %	50 %	0 %	0 %	379015862
21	NC_016913	AT	3	6	23034	23039	50 %	50 %	0 %	0 %	379015863
22	NC_016913	AG	3	6	24517	24522	50 %	0 %	50 %	0 %	379015865
23	NC_016913	AG	3	6	25074	25079	50 %	0 %	50 %	0 %	379015865
24	NC_016913	AG	3	6	25458	25463	50 %	0 %	50 %	0 %	379015865
25	NC_016913	TA	3	6	25607	25612	50 %	50 %	0 %	0 %	379015865
26	NC_016913	TA	3	6	25780	25785	50 %	50 %	0 %	0 %	379015866
27	NC_016913	GT	3	6	25907	25912	0 %	50 %	50 %	0 %	379015866
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29	NC_016913	TA	3	6	26419	26424	50 %	50 %	0 %	0 %	379015866
30	NC_016913	CT	3	6	26628	26633	0 %	50 %	0 %	50 %	379015866
31	NC_016913	AT	3	6	27573	27578	50 %	50 %	0 %	0 %	379015866
32	NC_016913	AT	3	6	27999	28004	50 %	50 %	0 %	0 %	379015866
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35	NC_016913	AT	3	6	31168	31173	50 %	50 %	0 %	0 %	379015871
36	NC_016913	AG	3	6	31247	31252	50 %	0 %	50 %	0 %	379015871
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41	NC_016913	AT	3	6	34259	34264	50 %	50 %	0 %	0 %	379015873
42	NC_016913	AG	3	6	34443	34448	50 %	0 %	50 %	0 %	379015873
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51	NC_016913	TA	3	6	40644	40649	50 %	50 %	0 %	0 %	379015877
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61	NC_016913	TA	3	6	43714	43719	50 %	50 %	0 %	0 %	379015880
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73	NC_016913	TA	3	6	48470	48475	50 %	50 %	0 %	0 %	379015884
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125	NC_016913	AT	3	6	71602	71607	50 %	50 %	0 %	0 %	379015900
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