MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 24185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016913	GATT	2	8	215652	215659	25 %	50 %	25 %	0 %	379016047
4002	NC_016913	CTT	2	6	215660	215665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016047
4003	NC_016913	AAT	2	6	215679	215684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016047
4004	NC_016913	ATCAAA	2	12	215769	215780	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	379016047
4005	NC_016913	TTA	2	6	215794	215799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016047
4006	NC_016913	TTA	2	6	215818	215823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016047
4007	NC_016913	ACT	2	6	215838	215843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016047
4008	NC_016913	ATC	2	6	215853	215858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016047
4009	NC_016913	TAG	2	6	215921	215926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016047
4010	NC_016913	T	6	6	216069	216074	0 %	100 %	0 %	0 %	379016047
4011	NC_016913	ATT	2	6	216151	216156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016047
4012	NC_016913	AT	3	6	216159	216164	50 %	50 %	0 %	0 %	379016048
4013	NC_016913	TAT	3	9	216162	216170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016048
4014	NC_016913	TAA	2	6	216183	216188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016048
4015	NC_016913	CTA	2	6	216203	216208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016048
4016	NC_016913	TAT	2	6	216216	216221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016048
4017	NC_016913	T	6	6	216232	216237	0 %	100 %	0 %	0 %	379016048
4018	NC_016913	TA	3	6	216250	216255	50 %	50 %	0 %	0 %	379016048
4019	NC_016913	AT	3	6	216385	216390	50 %	50 %	0 %	0 %	379016048
4020	NC_016913	AT	3	6	216421	216426	50 %	50 %	0 %	0 %	379016048
4021	NC_016913	TAT	2	6	216608	216613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016049
4022	NC_016913	CCA	2	6	216678	216683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379016049
4023	NC_016913	T	8	8	216756	216763	0 %	100 %	0 %	0 %	379016049
4024	NC_016913	TAG	2	6	216795	216800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016049
4025	NC_016913	T	6	6	216860	216865	0 %	100 %	0 %	0 %	379016049
4026	NC_016913	T	6	6	216876	216881	0 %	100 %	0 %	0 %	379016049
4027	NC_016913	GATA	2	8	216886	216893	50 %	25 %	25 %	0 %	379016049
4028	NC_016913	CTTG	2	8	217024	217031	0 %	50 %	25 %	25 %	379016049
4029	NC_016913	ATT	2	6	217044	217049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016049
4030	NC_016913	ATT	2	6	217063	217068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016049
4031	NC_016913	AAT	2	6	217198	217203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016049
4032	NC_016913	A	6	6	217228	217233	100 %	0 %	0 %	0 %	379016049
4033	NC_016913	TGTT	2	8	217292	217299	0 %	75 %	25 %	0 %	379016049
4034	NC_016913	TCT	2	6	217308	217313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016050
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4036	NC_016913	TAC	2	6	217432	217437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016050
4037	NC_016913	TAA	2	6	217448	217453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016050
4038	NC_016913	GCAC	2	8	217957	217964	25 %	0 %	25 %	50 %	379016051
4039	NC_016913	T	6	6	218003	218008	0 %	100 %	0 %	0 %	379016051
4040	NC_016913	GCA	2	6	218014	218019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016051
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4042	NC_016913	A	6	6	218035	218040	100 %	0 %	0 %	0 %	379016051
4043	NC_016913	TAT	2	6	218153	218158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016051
4044	NC_016913	GATA	2	8	218170	218177	50 %	25 %	25 %	0 %	379016051
4045	NC_016913	ATT	2	6	218215	218220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016051
4046	NC_016913	CTTT	2	8	218236	218243	0 %	75 %	0 %	25 %	379016051
4047	NC_016913	TGC	2	6	218329	218334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016051
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4049	NC_016913	TA	3	6	218343	218348	50 %	50 %	0 %	0 %	379016051
4050	NC_016913	GA	4	8	218351	218358	50 %	0 %	50 %	0 %	379016051
4051	NC_016913	TTAA	2	8	218404	218411	50 %	50 %	0 %	0 %	379016051
4052	NC_016913	TAT	2	6	218420	218425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016051
4053	NC_016913	AAT	2	6	218428	218433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016051
4054	NC_016913	T	6	6	218435	218440	0 %	100 %	0 %	0 %	379016051
4055	NC_016913	TAT	2	6	218456	218461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016051
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4058	NC_016913	ATA	2	6	218575	218580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016051
4059	NC_016913	GCA	2	6	218599	218604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016051
4060	NC_016913	TCT	2	6	218638	218643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016051
4061	NC_016913	TTTA	2	8	218682	218689	25 %	75 %	0 %	0 %	379016051
4062	NC_016913	ATT	2	6	218770	218775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016051
4063	NC_016913	AAT	2	6	218808	218813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016051
4064	NC_016913	TAA	2	6	218819	218824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016051
4065	NC_016913	TTA	2	6	218890	218895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016051
4066	NC_016913	GCA	2	6	218942	218947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016051
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4070	NC_016913	TTA	2	6	219581	219586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016052
4071	NC_016913	ATA	2	6	219589	219594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016052
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4073	NC_016913	TATT	2	8	219736	219743	25 %	75 %	0 %	0 %	379016052
4074	NC_016913	ATA	2	6	219829	219834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016052
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4093	NC_016913	ATT	2	6	220565	220570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016052
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4105	NC_016913	A	7	7	221066	221072	100 %	0 %	0 %	0 %	379016052
4106	NC_016913	ATTG	2	8	221101	221108	25 %	50 %	25 %	0 %	379016052
4107	NC_016913	AGA	2	6	221160	221165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016052
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4110	NC_016913	TGA	2	6	221229	221234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016052
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4113	NC_016913	ATT	2	6	221408	221413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016052
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4122	NC_016913	AAT	2	6	221993	221998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016053
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4124	NC_016913	AAG	2	6	222108	222113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016053
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4252	NC_016913	AT	3	6	230403	230408	50 %	50 %	0 %	0 %	379016060
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