MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 24185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016913	T	6	6	158353	158358	0 %	100 %	0 %	0 %	379016002
3002	NC_016913	A	7	7	158428	158434	100 %	0 %	0 %	0 %	379016002
3003	NC_016913	A	6	6	158486	158491	100 %	0 %	0 %	0 %	379016002
3004	NC_016913	CTT	2	6	158509	158514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016002
3005	NC_016913	TAAT	2	8	158530	158537	50 %	50 %	0 %	0 %	379016002
3006	NC_016913	ACAA	2	8	158771	158778	75 %	0 %	0 %	25 %	379016003
3007	NC_016913	A	7	7	158788	158794	100 %	0 %	0 %	0 %	379016003
3008	NC_016913	TAT	2	6	158795	158800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016003
3009	NC_016913	AGTGA	2	10	158807	158816	40 %	20 %	40 %	0 %	379016003
3010	NC_016913	ATAA	2	8	158891	158898	75 %	25 %	0 %	0 %	379016003
3011	NC_016913	TAAA	2	8	158946	158953	75 %	25 %	0 %	0 %	379016003
3012	NC_016913	AT	3	6	158985	158990	50 %	50 %	0 %	0 %	379016003
3013	NC_016913	A	8	8	159025	159032	100 %	0 %	0 %	0 %	379016003
3014	NC_016913	ATT	2	6	159176	159181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016004
3015	NC_016913	CGT	2	6	159216	159221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016004
3016	NC_016913	AGAA	2	8	159228	159235	75 %	0 %	25 %	0 %	379016004
3017	NC_016913	AAG	2	6	159256	159261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016004
3018	NC_016913	TTA	2	6	159265	159270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016004
3019	NC_016913	AAG	2	6	159289	159294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016004
3020	NC_016913	ATC	2	6	159312	159317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016004
3021	NC_016913	AAG	2	6	159328	159333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016004
3022	NC_016913	GCT	2	6	159381	159386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016004
3023	NC_016913	GA	3	6	159446	159451	50 %	0 %	50 %	0 %	379016004
3024	NC_016913	TGG	2	6	159533	159538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379016004
3025	NC_016913	AGT	2	6	159548	159553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016004
3026	NC_016913	GCT	2	6	159570	159575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016004
3027	NC_016913	AAG	2	6	159589	159594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016004
3028	NC_016913	A	6	6	159657	159662	100 %	0 %	0 %	0 %	379016004
3029	NC_016913	AGA	2	6	159686	159691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016004
3030	NC_016913	ATA	2	6	159739	159744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016004
3031	NC_016913	A	7	7	159812	159818	100 %	0 %	0 %	0 %	379016004
3032	NC_016913	ATA	2	6	159838	159843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016004
3033	NC_016913	ATT	2	6	159861	159866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016004
3034	NC_016913	GTA	2	6	159898	159903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016004
3035	NC_016913	AAG	2	6	159919	159924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016004
3036	NC_016913	GATTT	2	10	160301	160310	20 %	60 %	20 %	0 %	379016005
3037	NC_016913	ATT	2	6	160316	160321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016005
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3039	NC_016913	TAAA	2	8	160341	160348	75 %	25 %	0 %	0 %	379016005
3040	NC_016913	AT	4	8	160367	160374	50 %	50 %	0 %	0 %	379016005
3041	NC_016913	A	6	6	160402	160407	100 %	0 %	0 %	0 %	379016005
3042	NC_016913	AGGA	2	8	160415	160422	50 %	0 %	50 %	0 %	379016005
3043	NC_016913	TA	3	6	160536	160541	50 %	50 %	0 %	0 %	379016005
3044	NC_016913	ATA	2	6	160590	160595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016005
3045	NC_016913	AAG	2	6	160639	160644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016005
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3049	NC_016913	CTG	2	6	160878	160883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016005
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3051	NC_016913	TAG	2	6	161372	161377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016006
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3055	NC_016913	GCT	2	6	161437	161442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016006
3056	NC_016913	TTA	2	6	161513	161518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016006
3057	NC_016913	TGCTAA	2	12	161520	161531	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379016006
3058	NC_016913	TGT	2	6	161576	161581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379016006
3059	NC_016913	CAGTGA	2	12	161603	161614	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379016006
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3070	NC_016913	ATTTA	2	10	161856	161865	40 %	60 %	0 %	0 %	379016006
3071	NC_016913	CTC	2	6	161888	161893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379016006
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3101	NC_016913	TAA	2	6	163289	163294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016006
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3103	NC_016913	ATA	2	6	163327	163332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016006
3104	NC_016913	TGT	2	6	163341	163346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379016006
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3106	NC_016913	AATT	2	8	163410	163417	50 %	50 %	0 %	0 %	379016006
3107	NC_016913	CTA	2	6	163481	163486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016006
3108	NC_016913	TAC	3	9	163491	163499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016006
3109	NC_016913	TAA	2	6	163578	163583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016006
3110	NC_016913	TAC	2	6	163611	163616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016006
3111	NC_016913	GGT	2	6	163687	163692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379016006
3112	NC_016913	TAG	2	6	163736	163741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016006
3113	NC_016913	AAAC	2	8	163776	163783	75 %	0 %	0 %	25 %	379016006
3114	NC_016913	ATC	2	6	163868	163873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016006
3115	NC_016913	CATTC	2	10	163944	163953	20 %	40 %	0 %	40 %	379016006
3116	NC_016913	ATG	2	6	163955	163960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016006
3117	NC_016913	TAA	2	6	164001	164006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016006
3118	NC_016913	GTT	2	6	164038	164043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379016006
3119	NC_016913	ATA	2	6	164093	164098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016006
3120	NC_016913	TAGGTC	2	12	164102	164113	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379016006
3121	NC_016913	CTA	2	6	164144	164149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016006
3122	NC_016913	AAT	2	6	164179	164184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016006
3123	NC_016913	GGT	2	6	164206	164211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379016006
3124	NC_016913	CAAG	2	8	164271	164278	50 %	0 %	25 %	25 %	379016006
3125	NC_016913	TAC	2	6	164286	164291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016006
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3131	NC_016913	TAC	2	6	164475	164480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016006
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3152	NC_016913	TGC	2	6	165546	165551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016006
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3361	NC_016913	GA	3	6	175553	175558	50 %	0 %	50 %	0 %	379016012
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3490	NC_016913	AAT	2	6	182084	182089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016018
3491	NC_016913	GTAT	2	8	182107	182114	25 %	50 %	25 %	0 %	379016018
3492	NC_016913	TA	3	6	182275	182280	50 %	50 %	0 %	0 %	379016019
3493	NC_016913	GGA	2	6	182357	182362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379016019
3494	NC_016913	ATT	2	6	182371	182376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016019
3495	NC_016913	TA	3	6	182409	182414	50 %	50 %	0 %	0 %	379016019
3496	NC_016913	AGA	2	6	182441	182446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379016019
3497	NC_016913	TA	3	6	182479	182484	50 %	50 %	0 %	0 %	379016019
3498	NC_016913	ATA	2	6	182527	182532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016019
3499	NC_016913	TAATA	2	10	182555	182564	60 %	40 %	0 %	0 %	379016019
3500	NC_016913	CAT	2	6	182574	182579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016019

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