MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 24185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016913	AGAACA	2	12	80461	80472	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	379015912
1502	NC_016913	ATT	2	6	80587	80592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015912
1503	NC_016913	TAC	3	9	80598	80606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015912
1504	NC_016913	ATA	2	6	80612	80617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015912
1505	NC_016913	TCA	2	6	80740	80745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015912
1506	NC_016913	CGT	2	6	80789	80794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015912
1507	NC_016913	ACT	2	6	80815	80820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015912
1508	NC_016913	GTA	2	6	80864	80869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015912
1509	NC_016913	TGA	2	6	80871	80876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015912
1510	NC_016913	ATAG	2	8	80887	80894	50 %	25 %	25 %	0 %	379015912
1511	NC_016913	TCT	2	6	80900	80905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015912
1512	NC_016913	ATG	2	6	80921	80926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015912
1513	NC_016913	GGT	2	6	80944	80949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379015912
1514	NC_016913	ATT	2	6	80997	81002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015912
1515	NC_016913	A	6	6	81017	81022	100 %	0 %	0 %	0 %	379015912
1516	NC_016913	CAA	2	6	81025	81030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015912
1517	NC_016913	ATT	2	6	81080	81085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015912
1518	NC_016913	TCA	2	6	81093	81098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015912
1519	NC_016913	TAT	2	6	81111	81116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015912
1520	NC_016913	AGA	2	6	81144	81149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015912
1521	NC_016913	AGT	2	6	81156	81161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015912
1522	NC_016913	CTGCT	2	10	81186	81195	0 %	40 %	20 %	40 %	379015912
1523	NC_016913	GCTT	2	8	81207	81214	0 %	50 %	25 %	25 %	379015912
1524	NC_016913	A	7	7	81243	81249	100 %	0 %	0 %	0 %	379015912
1525	NC_016913	CTA	2	6	81259	81264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015912
1526	NC_016913	CATT	2	8	81302	81309	25 %	50 %	0 %	25 %	379015912
1527	NC_016913	TTA	2	6	81330	81335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015913
1528	NC_016913	CTA	3	9	81352	81360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015913
1529	NC_016913	CT	3	6	81449	81454	0 %	50 %	0 %	50 %	379015913
1530	NC_016913	TAC	2	6	81496	81501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015913
1531	NC_016913	TA	4	8	81527	81534	50 %	50 %	0 %	0 %	379015913
1532	NC_016913	TATG	2	8	81827	81834	25 %	50 %	25 %	0 %	379015914
1533	NC_016913	ACA	2	6	81850	81855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015914
1534	NC_016913	GAA	2	6	81895	81900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015914
1535	NC_016913	AAG	2	6	81986	81991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015914
1536	NC_016913	AG	3	6	81996	82001	50 %	0 %	50 %	0 %	379015914
1537	NC_016913	TTAGGT	2	12	82087	82098	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379015914
1538	NC_016913	AGA	2	6	82102	82107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015914
1539	NC_016913	GCA	3	9	82108	82116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379015914
1540	NC_016913	A	6	6	82120	82125	100 %	0 %	0 %	0 %	379015914
1541	NC_016913	ATG	2	6	82195	82200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015914
1542	NC_016913	GAA	2	6	82210	82215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015914
1543	NC_016913	TAT	2	6	82748	82753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015915
1544	NC_016913	ATT	2	6	82754	82759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015915
1545	NC_016913	ATTA	2	8	82775	82782	50 %	50 %	0 %	0 %	379015915
1546	NC_016913	T	9	9	82838	82846	0 %	100 %	0 %	0 %	379015915
1547	NC_016913	CTTAT	2	10	82851	82860	20 %	60 %	0 %	20 %	379015915
1548	NC_016913	ATTA	2	8	82895	82902	50 %	50 %	0 %	0 %	379015915
1549	NC_016913	T	6	6	82920	82925	0 %	100 %	0 %	0 %	379015915
1550	NC_016913	A	6	6	82940	82945	100 %	0 %	0 %	0 %	379015915
1551	NC_016913	TTA	2	6	83088	83093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015915
1552	NC_016913	ACTA	2	8	83102	83109	50 %	25 %	0 %	25 %	379015915
1553	NC_016913	A	6	6	83109	83114	100 %	0 %	0 %	0 %	379015915
1554	NC_016913	TGAG	2	8	83119	83126	25 %	25 %	50 %	0 %	379015915
1555	NC_016913	TTA	2	6	83148	83153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015915
1556	NC_016913	T	6	6	83154	83159	0 %	100 %	0 %	0 %	379015915
1557	NC_016913	ATG	2	6	83170	83175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015915
1558	NC_016913	TTA	2	6	83200	83205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015915
1559	NC_016913	A	6	6	83217	83222	100 %	0 %	0 %	0 %	379015915
1560	NC_016913	ATA	2	6	83227	83232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015915
1561	NC_016913	TTG	2	6	83245	83250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015915
1562	NC_016913	ATA	2	6	83254	83259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015915
1563	NC_016913	T	6	6	83264	83269	0 %	100 %	0 %	0 %	379015915
1564	NC_016913	TAT	2	6	83294	83299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015915
1565	NC_016913	AAAAT	2	10	83302	83311	80 %	20 %	0 %	0 %	379015915
1566	NC_016913	AGA	2	6	83345	83350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015915
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1568	NC_016913	TAAA	2	8	83407	83414	75 %	25 %	0 %	0 %	379015915
1569	NC_016913	ATTA	2	8	83456	83463	50 %	50 %	0 %	0 %	379015915
1570	NC_016913	ATT	2	6	83468	83473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015915
1571	NC_016913	ATTA	2	8	83493	83500	50 %	50 %	0 %	0 %	379015915
1572	NC_016913	TAT	2	6	83508	83513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015915
1573	NC_016913	ATT	2	6	83522	83527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015915
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1584	NC_016913	TAT	2	6	83750	83755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015915
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1588	NC_016913	A	7	7	84113	84119	100 %	0 %	0 %	0 %	379015916
1589	NC_016913	CTTATG	2	12	84136	84147	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379015916
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1591	NC_016913	TTA	2	6	84262	84267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015916
1592	NC_016913	TCG	2	6	84281	84286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015916
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1605	NC_016913	AT	3	6	84578	84583	50 %	50 %	0 %	0 %	379015916
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1607	NC_016913	ATTTA	2	10	84703	84712	40 %	60 %	0 %	0 %	379015916
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1610	NC_016913	GGC	3	9	84867	84875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379015916
1611	NC_016913	ATT	2	6	84878	84883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015916
1612	NC_016913	GAT	2	6	84939	84944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015916
1613	NC_016913	CT	3	6	84948	84953	0 %	50 %	0 %	50 %	379015916
1614	NC_016913	TG	3	6	84954	84959	0 %	50 %	50 %	0 %	379015916
1615	NC_016913	A	6	6	85054	85059	100 %	0 %	0 %	0 %	379015917
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1621	NC_016913	T	6	6	85151	85156	0 %	100 %	0 %	0 %	379015917
1622	NC_016913	A	7	7	85166	85172	100 %	0 %	0 %	0 %	379015917
1623	NC_016913	GTA	2	6	85200	85205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015917
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1625	NC_016913	AT	3	6	85246	85251	50 %	50 %	0 %	0 %	379015917
1626	NC_016913	A	6	6	85297	85302	100 %	0 %	0 %	0 %	379015917
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