MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 24185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5003	NC_016913	CAT	2	6	270804	270809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379016115
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5005	NC_016913	TAG	2	6	270837	270842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016115
5006	NC_016913	AAT	2	6	270849	270854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016115
5007	NC_016913	CTG	2	6	271061	271066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016115
5008	NC_016913	GTGCT	2	10	271100	271109	0 %	40 %	40 %	20 %	379016115
5009	NC_016913	TTC	2	6	271126	271131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016115
5010	NC_016913	TAT	2	6	271183	271188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016115
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5012	NC_016913	CCA	2	6	271246	271251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379016115
5013	NC_016913	T	6	6	271285	271290	0 %	100 %	0 %	0 %	379016115
5014	NC_016913	TAA	2	6	271450	271455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016116
5015	NC_016913	TTAATT	2	12	271464	271475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016116
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5017	NC_016913	TAG	2	6	271550	271555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016116
5018	NC_016913	T	6	6	271556	271561	0 %	100 %	0 %	0 %	379016116
5019	NC_016913	TAT	2	6	271577	271582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016116
5020	NC_016913	AT	3	6	271599	271604	50 %	50 %	0 %	0 %	379016116
5021	NC_016913	ATA	2	6	271611	271616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016116
5022	NC_016913	T	6	6	271627	271632	0 %	100 %	0 %	0 %	379016116
5023	NC_016913	T	6	6	271635	271640	0 %	100 %	0 %	0 %	379016116
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5035	NC_016913	TTATCA	2	12	271870	271881	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379016116
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5040	NC_016913	TGC	2	6	272102	272107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379016116
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5043	NC_016913	TGT	2	6	272179	272184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379016116
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5051	NC_016913	GTA	2	6	272832	272837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379016118
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5054	NC_016913	TTC	2	6	272921	272926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379016118
5055	NC_016913	GTT	2	6	272988	272993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379016118
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5057	NC_016913	TAA	2	6	273164	273169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016118
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5059	NC_016913	TTA	2	6	273270	273275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016118
5060	NC_016913	AT	3	6	273322	273327	50 %	50 %	0 %	0 %	379016118
5061	NC_016913	A	6	6	273378	273383	100 %	0 %	0 %	0 %	379016118
5062	NC_016913	TA	3	6	273420	273425	50 %	50 %	0 %	0 %	379016118
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5071	NC_016913	TAA	2	6	273812	273817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379016118
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5103	NC_016913	AAAT	2	8	275206	275213	75 %	25 %	0 %	0 %	379016118
5104	NC_016913	AAAT	2	8	275297	275304	75 %	25 %	0 %	0 %	379016118
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5107	NC_016913	AAACCA	2	12	275378	275389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379016118
5108	NC_016913	AT	3	6	275411	275416	50 %	50 %	0 %	0 %	379016118
5109	NC_016913	TGT	2	6	275418	275423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379016118
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5111	NC_016913	A	6	6	275515	275520	100 %	0 %	0 %	0 %	379016118
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5121	NC_016913	ATT	2	6	275936	275941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379016118
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5497	NC_016913	TTAA	2	8	300837	300844	50 %	50 %	0 %	0 %	379016144
5498	NC_016913	A	6	6	300860	300865	100 %	0 %	0 %	0 %	379016144
5499	NC_016913	T	6	6	300868	300873	0 %	100 %	0 %	0 %	379016144
5500	NC_016913	ACG	3	9	300940	300948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379016144

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