MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 2054

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016911	AT	3	6	787	792	50 %	50 %	0 %	0 %	378723378
2	NC_016911	TC	3	6	1521	1526	0 %	50 %	0 %	50 %	378723380
3	NC_016911	AT	3	6	1646	1651	50 %	50 %	0 %	0 %	378723380
4	NC_016911	TA	3	6	1764	1769	50 %	50 %	0 %	0 %	378723380
5	NC_016911	GA	3	6	2332	2337	50 %	0 %	50 %	0 %	378723381
6	NC_016911	TA	3	6	2496	2501	50 %	50 %	0 %	0 %	378723381
7	NC_016911	TG	3	6	2612	2617	0 %	50 %	50 %	0 %	378723381
8	NC_016911	AT	3	6	2756	2761	50 %	50 %	0 %	0 %	378723381
9	NC_016911	TC	3	6	3069	3074	0 %	50 %	0 %	50 %	378723382
10	NC_016911	TG	3	6	3437	3442	0 %	50 %	50 %	0 %	378723382
11	NC_016911	GA	3	6	3544	3549	50 %	0 %	50 %	0 %	378723382
12	NC_016911	AT	3	6	4006	4011	50 %	50 %	0 %	0 %	378723382
13	NC_016911	AT	3	6	4316	4321	50 %	50 %	0 %	0 %	378723382
14	NC_016911	AG	3	6	4335	4340	50 %	0 %	50 %	0 %	378723382
15	NC_016911	TA	3	6	4423	4428	50 %	50 %	0 %	0 %	378723382
16	NC_016911	TA	3	6	4675	4680	50 %	50 %	0 %	0 %	378723382
17	NC_016911	AT	3	6	4867	4872	50 %	50 %	0 %	0 %	378723382
18	NC_016911	AT	3	6	5901	5906	50 %	50 %	0 %	0 %	378723382
19	NC_016911	TA	3	6	6247	6252	50 %	50 %	0 %	0 %	378723383
20	NC_016911	TA	3	6	8519	8524	50 %	50 %	0 %	0 %	378723386
21	NC_016911	GT	3	6	9627	9632	0 %	50 %	50 %	0 %	378723388
22	NC_016911	TA	3	6	9728	9733	50 %	50 %	0 %	0 %	378723388
23	NC_016911	TA	3	6	11523	11528	50 %	50 %	0 %	0 %	378723390
24	NC_016911	AC	3	6	12239	12244	50 %	0 %	0 %	50 %	378723392
25	NC_016911	TA	3	6	12276	12281	50 %	50 %	0 %	0 %	378723392
26	NC_016911	TA	3	6	14117	14122	50 %	50 %	0 %	0 %	378723394
27	NC_016911	AG	3	6	14891	14896	50 %	0 %	50 %	0 %	378723395
28	NC_016911	AT	3	6	15304	15309	50 %	50 %	0 %	0 %	378723396
29	NC_016911	AT	3	6	15718	15723	50 %	50 %	0 %	0 %	378723397
30	NC_016911	TA	3	6	15746	15751	50 %	50 %	0 %	0 %	378723397
31	NC_016911	AT	3	6	17218	17223	50 %	50 %	0 %	0 %	378723398
32	NC_016911	AT	3	6	18968	18973	50 %	50 %	0 %	0 %	378723400
33	NC_016911	AG	3	6	22719	22724	50 %	0 %	50 %	0 %	378723403
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36	NC_016911	TA	3	6	23277	23282	50 %	50 %	0 %	0 %	378723403
37	NC_016911	TA	3	6	23413	23418	50 %	50 %	0 %	0 %	378723403
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39	NC_016911	TA	3	6	24140	24145	50 %	50 %	0 %	0 %	378723403
40	NC_016911	TA	3	6	24239	24244	50 %	50 %	0 %	0 %	378723403
41	NC_016911	TA	3	6	25404	25409	50 %	50 %	0 %	0 %	378723403
42	NC_016911	AT	3	6	25461	25466	50 %	50 %	0 %	0 %	378723403
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49	NC_016911	AT	3	6	31636	31641	50 %	50 %	0 %	0 %	378723414
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53	NC_016911	AT	3	6	33734	33739	50 %	50 %	0 %	0 %	378723416
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104	NC_016911	AT	3	6	71648	71653	50 %	50 %	0 %	0 %	378723457
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111	NC_016911	AT	3	6	76002	76007	50 %	50 %	0 %	0 %	378723464
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113	NC_016911	AT	3	6	77236	77241	50 %	50 %	0 %	0 %	378723464
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