MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 24295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_016911	AGCA	2	8	200576	200583	50 %	0 %	25 %	25 %	378723576
4003	NC_016911	CAG	2	6	200587	200592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723576
4004	NC_016911	T	6	6	200609	200614	0 %	100 %	0 %	0 %	378723576
4005	NC_016911	ATC	2	6	200651	200656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723576
4006	NC_016911	CTT	2	6	200671	200676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723576
4007	NC_016911	TAT	2	6	200809	200814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723576
4008	NC_016911	TAAT	3	12	200826	200837	50 %	50 %	0 %	0 %	378723576
4009	NC_016911	GAT	2	6	200867	200872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723576
4010	NC_016911	ATC	2	6	200903	200908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723576
4011	NC_016911	ATT	2	6	200912	200917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723576
4012	NC_016911	TGC	2	6	200933	200938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723576
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4015	NC_016911	TATT	2	8	201365	201372	25 %	75 %	0 %	0 %	378723577
4016	NC_016911	AAG	2	6	201410	201415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723577
4017	NC_016911	TTA	2	6	201421	201426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723577
4018	NC_016911	TTA	2	6	201452	201457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723577
4019	NC_016911	TTA	2	6	201472	201477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723577
4020	NC_016911	TTA	2	6	201505	201510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723577
4021	NC_016911	T	6	6	201584	201589	0 %	100 %	0 %	0 %	378723577
4022	NC_016911	TTA	2	6	201616	201621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723577
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4031	NC_016911	T	6	6	201941	201946	0 %	100 %	0 %	0 %	378723578
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4033	NC_016911	TTC	2	6	201995	202000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723578
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4035	NC_016911	CTA	2	6	202099	202104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723578
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4037	NC_016911	TA	3	6	202150	202155	50 %	50 %	0 %	0 %	378723578
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4041	NC_016911	ATA	2	6	202338	202343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723578
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4054	NC_016911	TTTA	2	8	203113	203120	25 %	75 %	0 %	0 %	378723579
4055	NC_016911	AAT	2	6	203129	203134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723579
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4057	NC_016911	TGC	2	6	203179	203184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723579
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4094	NC_016911	AAT	2	6	204855	204860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723580
4095	NC_016911	CAT	2	6	204981	204986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723580
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4105	NC_016911	ATT	2	6	205687	205692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723581
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4107	NC_016911	CTT	2	6	205723	205728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723581
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4109	NC_016911	A	6	6	205910	205915	100 %	0 %	0 %	0 %	378723581
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4112	NC_016911	AT	3	6	206297	206302	50 %	50 %	0 %	0 %	378723582
4113	NC_016911	CTT	2	6	206344	206349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723582
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4118	NC_016911	CTAA	2	8	206451	206458	50 %	25 %	0 %	25 %	378723582
4119	NC_016911	ATTTT	2	10	206466	206475	20 %	80 %	0 %	0 %	378723582
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4123	NC_016911	ATC	2	6	206845	206850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723583
4124	NC_016911	ATG	2	6	206881	206886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723583
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4127	NC_016911	CCGT	2	8	207059	207066	0 %	25 %	25 %	50 %	378723583
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4145	NC_016911	T	6	6	208324	208329	0 %	100 %	0 %	0 %	378723584
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4157	NC_016911	TAA	3	9	208653	208661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723585
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4159	NC_016911	AATTT	2	10	208681	208690	40 %	60 %	0 %	0 %	378723585
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4232	NC_016911	TATG	2	8	213055	213062	25 %	50 %	25 %	0 %	378723590
4233	NC_016911	TA	3	6	213098	213103	50 %	50 %	0 %	0 %	378723590
4234	NC_016911	TG	3	6	213135	213140	0 %	50 %	50 %	0 %	378723590
4235	NC_016911	TAT	2	6	213175	213180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723590
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4239	NC_016911	TACT	2	8	213508	213515	25 %	50 %	0 %	25 %	378723590
4240	NC_016911	AAGA	2	8	213564	213571	75 %	0 %	25 %	0 %	378723590
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4243	NC_016911	TCA	2	6	213639	213644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723590
4244	NC_016911	CAT	2	6	213658	213663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723590
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4246	NC_016911	AGCTA	2	10	213686	213695	40 %	20 %	20 %	20 %	378723590
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4493	NC_016911	AAAT	2	8	224082	224089	75 %	25 %	0 %	0 %	378723600
4494	NC_016911	ACT	2	6	224101	224106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723600
4495	NC_016911	TGC	2	6	224166	224171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723600
4496	NC_016911	TTCT	2	8	224219	224226	0 %	75 %	0 %	25 %	378723600
4497	NC_016911	AAT	2	6	224403	224408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723600
4498	NC_016911	TTC	2	6	224418	224423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723600
4499	NC_016911	ATT	2	6	224460	224465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723600
4500	NC_016911	CTG	2	6	224486	224491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723600

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