MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 24295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016911	TAA	2	6	151292	151297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723532
3002	NC_016911	AGA	2	6	151370	151375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723532
3003	NC_016911	G	6	6	154238	154243	0 %	0 %	100 %	0 %	378723533
3004	NC_016911	AGA	2	6	154254	154259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723533
3005	NC_016911	T	6	6	154260	154265	0 %	100 %	0 %	0 %	378723533
3006	NC_016911	AAAG	2	8	154271	154278	75 %	0 %	25 %	0 %	378723533
3007	NC_016911	ATA	2	6	154306	154311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723533
3008	NC_016911	ATG	2	6	154327	154332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723533
3009	NC_016911	GAA	2	6	154337	154342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723533
3010	NC_016911	GCA	3	9	154391	154399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723534
3011	NC_016911	AGC	2	6	154425	154430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723534
3012	NC_016911	TAAA	2	8	154797	154804	75 %	25 %	0 %	0 %	378723535
3013	NC_016911	TTA	2	6	154824	154829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723535
3014	NC_016911	TGA	3	9	154867	154875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723535
3015	NC_016911	GGT	2	6	154886	154891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378723535
3016	NC_016911	A	6	6	155026	155031	100 %	0 %	0 %	0 %	378723535
3017	NC_016911	CGG	2	6	155134	155139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378723535
3018	NC_016911	ACT	2	6	155179	155184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723535
3019	NC_016911	TCT	2	6	155216	155221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723535
3020	NC_016911	GAA	2	6	155231	155236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723535
3021	NC_016911	GGGC	2	8	155251	155258	0 %	0 %	75 %	25 %	378723535
3022	NC_016911	TA	3	6	155271	155276	50 %	50 %	0 %	0 %	378723535
3023	NC_016911	TAAT	2	8	155340	155347	50 %	50 %	0 %	0 %	378723535
3024	NC_016911	A	6	6	155354	155359	100 %	0 %	0 %	0 %	378723535
3025	NC_016911	A	6	6	155429	155434	100 %	0 %	0 %	0 %	378723536
3026	NC_016911	ATT	2	6	155440	155445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723536
3027	NC_016911	A	7	7	155488	155494	100 %	0 %	0 %	0 %	378723536
3028	NC_016911	TTG	2	6	155540	155545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723536
3029	NC_016911	TCTT	2	8	155644	155651	0 %	75 %	0 %	25 %	378723536
3030	NC_016911	GTA	2	6	155728	155733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723536
3031	NC_016911	AGT	2	6	155742	155747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723536
3032	NC_016911	TCG	2	6	155748	155753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723536
3033	NC_016911	TAT	2	6	155764	155769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723536
3034	NC_016911	AG	3	6	155805	155810	50 %	0 %	50 %	0 %	378723536
3035	NC_016911	GCA	2	6	155836	155841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723536
3036	NC_016911	TTTATC	2	12	156074	156085	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	378723537
3037	NC_016911	GAA	2	6	156138	156143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723537
3038	NC_016911	CTT	2	6	156166	156171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723537
3039	NC_016911	TA	3	6	156215	156220	50 %	50 %	0 %	0 %	378723537
3040	NC_016911	TAC	2	6	156242	156247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723537
3041	NC_016911	AAT	2	6	156325	156330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723538
3042	NC_016911	TAA	2	6	156358	156363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723538
3043	NC_016911	GATTTT	2	12	156368	156379	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	378723538
3044	NC_016911	A	6	6	156389	156394	100 %	0 %	0 %	0 %	378723538
3045	NC_016911	GTTA	2	8	156395	156402	25 %	50 %	25 %	0 %	378723538
3046	NC_016911	ATT	2	6	156413	156418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723538
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3048	NC_016911	AATTT	2	10	156456	156465	40 %	60 %	0 %	0 %	378723538
3049	NC_016911	CGG	2	6	156481	156486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378723538
3050	NC_016911	AGGTG	2	10	156562	156571	20 %	20 %	60 %	0 %	378723538
3051	NC_016911	GTA	2	6	156618	156623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723538
3052	NC_016911	GAA	2	6	156629	156634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723538
3053	NC_016911	TTAA	2	8	156656	156663	50 %	50 %	0 %	0 %	378723538
3054	NC_016911	TCTT	2	8	156776	156783	0 %	75 %	0 %	25 %	378723538
3055	NC_016911	TTTTGG	2	12	156823	156834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723538
3056	NC_016911	TGC	2	6	156919	156924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723538
3057	NC_016911	TAT	2	6	156934	156939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723538
3058	NC_016911	GTA	2	6	156962	156967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723538
3059	NC_016911	AT	3	6	156968	156973	50 %	50 %	0 %	0 %	378723538
3060	NC_016911	A	8	8	157007	157014	100 %	0 %	0 %	0 %	378723538
3061	NC_016911	T	6	6	157151	157156	0 %	100 %	0 %	0 %	378723538
3062	NC_016911	ATA	2	6	157160	157165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723538
3063	NC_016911	TGTT	2	8	157212	157219	0 %	75 %	25 %	0 %	378723538
3064	NC_016911	TAA	2	6	157231	157236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723538
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3071	NC_016911	CGA	2	6	157668	157673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723539
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3090	NC_016911	CATG	2	8	158436	158443	25 %	25 %	25 %	25 %	378723539
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3104	NC_016911	A	7	7	159256	159262	100 %	0 %	0 %	0 %	378723540
3105	NC_016911	TA	3	6	159286	159291	50 %	50 %	0 %	0 %	378723540
3106	NC_016911	TA	4	8	159384	159391	50 %	50 %	0 %	0 %	378723540
3107	NC_016911	GATA	2	8	159394	159401	50 %	25 %	25 %	0 %	378723540
3108	NC_016911	T	6	6	159416	159421	0 %	100 %	0 %	0 %	378723540
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3119	NC_016911	TA	3	6	159960	159965	50 %	50 %	0 %	0 %	378723541
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3493	NC_016911	ATGA	2	8	175622	175629	50 %	25 %	25 %	0 %	378723559
3494	NC_016911	AT	3	6	175661	175666	50 %	50 %	0 %	0 %	378723559
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3498	NC_016911	ATGC	2	8	175745	175752	25 %	25 %	25 %	25 %	378723559
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