MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 24295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016911	GCA	2	6	53842	53847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723439
1002	NC_016911	A	6	6	53851	53856	100 %	0 %	0 %	0 %	378723439
1003	NC_016911	AGA	2	6	53991	53996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723439
1004	NC_016911	ATA	2	6	54122	54127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723439
1005	NC_016911	TAT	2	6	54171	54176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723439
1006	NC_016911	AAG	2	6	54309	54314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723439
1007	NC_016911	CCGC	2	8	54342	54349	0 %	0 %	25 %	75 %	378723439
1008	NC_016911	GTTC	2	8	54353	54360	0 %	50 %	25 %	25 %	378723439
1009	NC_016911	GACC	2	8	54371	54378	25 %	0 %	25 %	50 %	378723439
1010	NC_016911	TGA	2	6	54426	54431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723439
1011	NC_016911	AT	3	6	54465	54470	50 %	50 %	0 %	0 %	378723439
1012	NC_016911	CTC	2	6	54503	54508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378723439
1013	NC_016911	CGT	2	6	54559	54564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723439
1014	NC_016911	ATT	2	6	54579	54584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723439
1015	NC_016911	TGA	2	6	54585	54590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723439
1016	NC_016911	TGC	2	6	54626	54631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723439
1017	NC_016911	TGA	2	6	54639	54644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723439
1018	NC_016911	TAAAG	2	10	54762	54771	60 %	20 %	20 %	0 %	378723439
1019	NC_016911	ATTAT	2	10	54835	54844	40 %	60 %	0 %	0 %	378723439
1020	NC_016911	TAA	2	6	54861	54866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723439
1021	NC_016911	ATT	2	6	54928	54933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723439
1022	NC_016911	TGA	2	6	54942	54947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723439
1023	NC_016911	ATT	2	6	54959	54964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723439
1024	NC_016911	AAT	2	6	55036	55041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723439
1025	NC_016911	AAAT	2	8	55091	55098	75 %	25 %	0 %	0 %	378723439
1026	NC_016911	TAA	2	6	55366	55371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723440
1027	NC_016911	TAA	2	6	55407	55412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723440
1028	NC_016911	TAA	2	6	55417	55422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723440
1029	NC_016911	ACT	2	6	55425	55430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723440
1030	NC_016911	ATA	2	6	55457	55462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723440
1031	NC_016911	TCT	2	6	55471	55476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723440
1032	NC_016911	TAAG	2	8	55491	55498	50 %	25 %	25 %	0 %	378723440
1033	NC_016911	GTT	3	9	55534	55542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723440
1034	NC_016911	T	6	6	55596	55601	0 %	100 %	0 %	0 %	378723440
1035	NC_016911	AT	3	6	55650	55655	50 %	50 %	0 %	0 %	378723440
1036	NC_016911	A	6	6	55712	55717	100 %	0 %	0 %	0 %	378723440
1037	NC_016911	AGT	2	6	55731	55736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723440
1038	NC_016911	TTA	2	6	55741	55746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723440
1039	NC_016911	A	6	6	55765	55770	100 %	0 %	0 %	0 %	378723440
1040	NC_016911	ATTGCT	2	12	55842	55853	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378723440
1041	NC_016911	GA	3	6	56021	56026	50 %	0 %	50 %	0 %	378723441
1042	NC_016911	TTA	2	6	56047	56052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723441
1043	NC_016911	GCA	2	6	56086	56091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723441
1044	NC_016911	ATAA	2	8	56118	56125	75 %	25 %	0 %	0 %	378723441
1045	NC_016911	T	6	6	56162	56167	0 %	100 %	0 %	0 %	378723441
1046	NC_016911	AGC	2	6	56181	56186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723441
1047	NC_016911	CCG	2	6	56191	56196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378723441
1048	NC_016911	TTC	2	6	56209	56214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723441
1049	NC_016911	ATT	2	6	56223	56228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723441
1050	NC_016911	TAC	2	6	56267	56272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723441
1051	NC_016911	TGC	2	6	56304	56309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723441
1052	NC_016911	ATT	2	6	56350	56355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723441
1053	NC_016911	ATTTAT	2	12	56429	56440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723441
1054	NC_016911	TCC	2	6	56478	56483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378723441
1055	NC_016911	CAT	2	6	56537	56542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723441
1056	NC_016911	TAG	2	6	56546	56551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723441
1057	NC_016911	ATAAGG	2	12	56628	56639	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	378723441
1058	NC_016911	T	7	7	56703	56709	0 %	100 %	0 %	0 %	378723441
1059	NC_016911	CCG	2	6	56755	56760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378723441
1060	NC_016911	GCA	2	6	56782	56787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723441
1061	NC_016911	CTTT	2	8	56818	56825	0 %	75 %	0 %	25 %	378723441
1062	NC_016911	T	6	6	56833	56838	0 %	100 %	0 %	0 %	378723441
1063	NC_016911	GCA	2	6	56872	56877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723441
1064	NC_016911	TAC	2	6	56886	56891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723441
1065	NC_016911	ATC	2	6	56979	56984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723441
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1067	NC_016911	T	7	7	57269	57275	0 %	100 %	0 %	0 %	378723442
1068	NC_016911	TTTGC	2	10	57317	57326	0 %	60 %	20 %	20 %	378723442
1069	NC_016911	ACTT	2	8	57330	57337	25 %	50 %	0 %	25 %	378723442
1070	NC_016911	T	6	6	57381	57386	0 %	100 %	0 %	0 %	378723442
1071	NC_016911	GAT	2	6	57409	57414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723442
1072	NC_016911	TAA	2	6	57450	57455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723442
1073	NC_016911	GTA	2	6	57553	57558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723442
1074	NC_016911	ATG	2	6	57666	57671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723442
1075	NC_016911	AAT	2	6	57700	57705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723442
1076	NC_016911	CCA	2	6	57711	57716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378723442
1077	NC_016911	T	6	6	57744	57749	0 %	100 %	0 %	0 %	378723442
1078	NC_016911	TTGC	2	8	57788	57795	0 %	50 %	25 %	25 %	378723442
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1080	NC_016911	ACC	2	6	57855	57860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378723442
1081	NC_016911	ATAA	2	8	57874	57881	75 %	25 %	0 %	0 %	378723442
1082	NC_016911	GCT	2	6	57904	57909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723442
1083	NC_016911	AAT	2	6	57917	57922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723442
1084	NC_016911	TAA	2	6	57939	57944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723442
1085	NC_016911	CATC	2	8	58011	58018	25 %	25 %	0 %	50 %	378723442
1086	NC_016911	TAT	2	6	58049	58054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723442
1087	NC_016911	TCTTGG	2	12	58078	58089	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	378723442
1088	NC_016911	ATG	2	6	58101	58106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723442
1089	NC_016911	ATTT	3	12	58187	58198	25 %	75 %	0 %	0 %	378723442
1090	NC_016911	ATT	2	6	58248	58253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723442
1091	NC_016911	ATA	2	6	58257	58262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723442
1092	NC_016911	ATA	2	6	58333	58338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723442
1093	NC_016911	TAT	2	6	58671	58676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723443
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1095	NC_016911	TAA	2	6	58813	58818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723443
1096	NC_016911	TAT	2	6	58819	58824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723443
1097	NC_016911	CTA	2	6	58870	58875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723443
1098	NC_016911	AAG	2	6	58887	58892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723443
1099	NC_016911	A	7	7	58900	58906	100 %	0 %	0 %	0 %	378723443
1100	NC_016911	TAT	2	6	59362	59367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723444
1101	NC_016911	TGA	2	6	59407	59412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723444
1102	NC_016911	ATT	2	6	59423	59428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723444
1103	NC_016911	ATA	2	6	59433	59438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723444
1104	NC_016911	A	7	7	59452	59458	100 %	0 %	0 %	0 %	378723444
1105	NC_016911	TAA	2	6	59497	59502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723444
1106	NC_016911	A	6	6	59504	59509	100 %	0 %	0 %	0 %	378723444
1107	NC_016911	ATT	3	9	59514	59522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723444
1108	NC_016911	T	6	6	59521	59526	0 %	100 %	0 %	0 %	378723444
1109	NC_016911	AGA	2	6	59554	59559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723444
1110	NC_016911	AGAA	2	8	59563	59570	75 %	0 %	25 %	0 %	378723444
1111	NC_016911	TAG	2	6	59626	59631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723444
1112	NC_016911	A	6	6	59650	59655	100 %	0 %	0 %	0 %	378723444
1113	NC_016911	TAA	2	6	59695	59700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723444
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1122	NC_016911	TTA	2	6	59987	59992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723445
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1125	NC_016911	TAA	2	6	60153	60158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723446
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1127	NC_016911	A	6	6	60224	60229	100 %	0 %	0 %	0 %	378723446
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