MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 24295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016911	TTA	2	6	280534	280539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723656
5502	NC_016911	TAG	2	6	280622	280627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723656
5503	NC_016911	TTAT	2	8	280649	280656	25 %	75 %	0 %	0 %	378723656
5504	NC_016911	GAG	2	6	280695	280700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378723656
5505	NC_016911	GAA	2	6	280710	280715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723656
5506	NC_016911	GAA	2	6	280764	280769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723656
5507	NC_016911	GCGGTA	2	12	280843	280854	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378723656
5508	NC_016911	GTC	2	6	280890	280895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723656
5509	NC_016911	GAT	2	6	280917	280922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723656
5510	NC_016911	GCG	2	6	281002	281007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378723656
5511	NC_016911	GAT	2	6	281025	281030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723656
5512	NC_016911	GTCT	2	8	281045	281052	0 %	50 %	25 %	25 %	378723656
5513	NC_016911	CTG	2	6	281068	281073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723656
5514	NC_016911	AGA	3	9	281078	281086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723656
5515	NC_016911	TTG	2	6	281994	281999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723657
5516	NC_016911	ATT	2	6	282015	282020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723657
5517	NC_016911	TAG	2	6	282041	282046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723657
5518	NC_016911	TAT	2	6	282047	282052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723657
5519	NC_016911	TG	3	6	282076	282081	0 %	50 %	50 %	0 %	378723657
5520	NC_016911	ATTGG	2	10	282093	282102	20 %	40 %	40 %	0 %	378723657
5521	NC_016911	TTG	2	6	282141	282146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723657
5522	NC_016911	TA	3	6	282148	282153	50 %	50 %	0 %	0 %	378723657
5523	NC_016911	TTAT	2	8	282160	282167	25 %	75 %	0 %	0 %	378723657
5524	NC_016911	TGA	2	6	282195	282200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723657
5525	NC_016911	ATT	2	6	282214	282219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723658
5526	NC_016911	TCTT	2	8	282272	282279	0 %	75 %	0 %	25 %	378723658
5527	NC_016911	TTATT	2	10	282282	282291	20 %	80 %	0 %	0 %	378723658
5528	NC_016911	TAGC	2	8	282320	282327	25 %	25 %	25 %	25 %	378723658
5529	NC_016911	ATG	2	6	282337	282342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723658
5530	NC_016911	ATA	2	6	282416	282421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723658
5531	NC_016911	ATA	2	6	282425	282430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723658
5532	NC_016911	CTCG	2	8	282436	282443	0 %	25 %	25 %	50 %	378723658
5533	NC_016911	TTTA	2	8	282548	282555	25 %	75 %	0 %	0 %	378723659
5534	NC_016911	ATT	2	6	282556	282561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723659
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5537	NC_016911	ATT	2	6	282618	282623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723659
5538	NC_016911	ATG	2	6	282669	282674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723659
5539	NC_016911	GATA	2	8	282758	282765	50 %	25 %	25 %	0 %	378723659
5540	NC_016911	TAA	2	6	282937	282942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723660
5541	NC_016911	TTG	2	6	282982	282987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723660
5542	NC_016911	ATG	2	6	283150	283155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723661
5543	NC_016911	TTA	2	6	283159	283164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723661
5544	NC_016911	TTA	2	6	283193	283198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723661
5545	NC_016911	GTA	2	6	283204	283209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723661
5546	NC_016911	T	8	8	283271	283278	0 %	100 %	0 %	0 %	378723661
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5549	NC_016911	TCT	2	6	283414	283419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723662
5550	NC_016911	CTT	2	6	283427	283432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723662
5551	NC_016911	T	6	6	283437	283442	0 %	100 %	0 %	0 %	378723662
5552	NC_016911	TAA	2	6	283491	283496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723662
5553	NC_016911	T	10	10	283502	283511	0 %	100 %	0 %	0 %	378723662
5554	NC_016911	TTC	2	6	283534	283539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723663
5555	NC_016911	GTT	2	6	283542	283547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723663
5556	NC_016911	TTC	2	6	283555	283560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723663
5557	NC_016911	ATT	3	9	283577	283585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723663
5558	NC_016911	TGA	2	6	283815	283820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723664
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5560	NC_016911	GCA	2	6	283927	283932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723664
5561	NC_016911	AGA	2	6	284052	284057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723664
5562	NC_016911	TGAT	2	8	284237	284244	25 %	50 %	25 %	0 %	378723664
5563	NC_016911	GTA	2	6	284269	284274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723664
5564	NC_016911	ATA	2	6	284300	284305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723664
5565	NC_016911	A	6	6	284358	284363	100 %	0 %	0 %	0 %	378723665
5566	NC_016911	TCA	2	6	284372	284377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723665
5567	NC_016911	ACTTA	2	10	284426	284435	40 %	40 %	0 %	20 %	378723665
5568	NC_016911	ATG	2	6	284506	284511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723665
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5570	NC_016911	TAAT	2	8	284524	284531	50 %	50 %	0 %	0 %	378723665
5571	NC_016911	GTT	2	6	284553	284558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723665
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5578	NC_016911	AT	3	6	284743	284748	50 %	50 %	0 %	0 %	378723665
5579	NC_016911	TGA	2	6	284749	284754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723665
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5583	NC_016911	CGGAG	2	10	284819	284828	20 %	0 %	60 %	20 %	378723665
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5587	NC_016911	AAT	2	6	285020	285025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723665
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5592	NC_016911	A	6	6	285153	285158	100 %	0 %	0 %	0 %	378723665
5593	NC_016911	AGA	2	6	285170	285175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723665
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5599	NC_016911	TAAAAT	2	12	285879	285890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723666
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5605	NC_016911	A	7	7	289896	289902	100 %	0 %	0 %	0 %	378723667
5606	NC_016911	TTA	2	6	289919	289924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723667
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5609	NC_016911	A	6	6	290012	290017	100 %	0 %	0 %	0 %	378723667
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5617	NC_016911	TTCAT	2	10	290428	290437	20 %	60 %	0 %	20 %	378723668
5618	NC_016911	AT	3	6	290487	290492	50 %	50 %	0 %	0 %	378723668
5619	NC_016911	ATAA	2	8	290518	290525	75 %	25 %	0 %	0 %	378723668
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5995	NC_016911	TCT	2	6	308862	308867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723689
5996	NC_016911	ATTT	2	8	308875	308882	25 %	75 %	0 %	0 %	378723689
5997	NC_016911	TTCT	2	8	308929	308936	0 %	75 %	0 %	25 %	378723689
5998	NC_016911	ATC	2	6	308993	308998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723689
5999	NC_016911	CCT	2	6	309006	309011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378723689
6000	NC_016911	GCA	2	6	309012	309017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723689

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