MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 24295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016911	T	6	6	224559	224564	0 %	100 %	0 %	0 %	378723600
4502	NC_016911	TTA	2	6	224582	224587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723600
4503	NC_016911	TA	3	6	224586	224591	50 %	50 %	0 %	0 %	378723600
4504	NC_016911	CCG	2	6	224599	224604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378723600
4505	NC_016911	CGA	2	6	224663	224668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723600
4506	NC_016911	ATA	2	6	224843	224848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723600
4507	NC_016911	TAC	2	6	224864	224869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723600
4508	NC_016911	TA	3	6	224895	224900	50 %	50 %	0 %	0 %	378723600
4509	NC_016911	TTGC	2	8	224948	224955	0 %	50 %	25 %	25 %	378723600
4510	NC_016911	AT	3	6	224959	224964	50 %	50 %	0 %	0 %	378723600
4511	NC_016911	A	6	6	225048	225053	100 %	0 %	0 %	0 %	378723600
4512	NC_016911	TAT	2	6	225606	225611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723601
4513	NC_016911	A	8	8	225636	225643	100 %	0 %	0 %	0 %	378723601
4514	NC_016911	GACC	2	8	225672	225679	25 %	0 %	25 %	50 %	378723601
4515	NC_016911	TCATAA	2	12	225684	225695	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378723601
4516	NC_016911	CCA	2	6	225783	225788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378723601
4517	NC_016911	TAATAT	2	12	225789	225800	50 %	50 %	0 %	0 %	378723601
4518	NC_016911	CAT	2	6	225826	225831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723601
4519	NC_016911	GAA	2	6	225914	225919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723601
4520	NC_016911	AAG	2	6	225926	225931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723601
4521	NC_016911	ATA	2	6	226131	226136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723602
4522	NC_016911	AGA	2	6	226195	226200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723602
4523	NC_016911	TA	4	8	226204	226211	50 %	50 %	0 %	0 %	378723602
4524	NC_016911	AAC	2	6	226241	226246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378723602
4525	NC_016911	CTT	2	6	226336	226341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378723602
4526	NC_016911	AAT	2	6	226378	226383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723602
4527	NC_016911	TGC	2	6	226387	226392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378723602
4528	NC_016911	T	7	7	226464	226470	0 %	100 %	0 %	0 %	378723602
4529	NC_016911	TAT	2	6	226492	226497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723602
4530	NC_016911	ATC	2	6	226537	226542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723602
4531	NC_016911	CAT	2	6	226547	226552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723602
4532	NC_016911	TTA	2	6	226614	226619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723602
4533	NC_016911	TAC	2	6	226627	226632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723602
4534	NC_016911	TAT	3	9	226671	226679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723602
4535	NC_016911	A	6	6	226697	226702	100 %	0 %	0 %	0 %	378723602
4536	NC_016911	TAA	2	6	226750	226755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723602
4537	NC_016911	A	6	6	226804	226809	100 %	0 %	0 %	0 %	378723602
4538	NC_016911	AT	3	6	226814	226819	50 %	50 %	0 %	0 %	378723602
4539	NC_016911	GTG	2	6	226865	226870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378723602
4540	NC_016911	AGG	2	6	227286	227291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378723603
4541	NC_016911	TTA	2	6	227292	227297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723603
4542	NC_016911	GAT	2	6	227317	227322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723603
4543	NC_016911	GAT	2	6	227344	227349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723603
4544	NC_016911	TAAATT	2	12	227385	227396	50 %	50 %	0 %	0 %	378723603
4545	NC_016911	GCC	2	6	227401	227406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378723603
4546	NC_016911	GCTT	2	8	227464	227471	0 %	50 %	25 %	25 %	378723603
4547	NC_016911	ATG	2	6	227655	227660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723603
4548	NC_016911	GAT	2	6	227704	227709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723603
4549	NC_016911	GGA	2	6	227710	227715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378723603
4550	NC_016911	A	6	6	227728	227733	100 %	0 %	0 %	0 %	378723603
4551	NC_016911	AGT	2	6	227791	227796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723603
4552	NC_016911	AGT	2	6	227804	227809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723603
4553	NC_016911	GTG	2	6	227871	227876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378723603
4554	NC_016911	AT	3	6	227893	227898	50 %	50 %	0 %	0 %	378723603
4555	NC_016911	AGA	2	6	227950	227955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723603
4556	NC_016911	TTG	2	6	228012	228017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723603
4557	NC_016911	AGC	2	6	228022	228027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378723603
4558	NC_016911	TTG	2	6	228033	228038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378723603
4559	NC_016911	AGA	2	6	228043	228048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723603
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4561	NC_016911	A	6	6	228073	228078	100 %	0 %	0 %	0 %	378723603
4562	NC_016911	A	8	8	228124	228131	100 %	0 %	0 %	0 %	378723603
4563	NC_016911	ATCA	2	8	228195	228202	50 %	25 %	0 %	25 %	378723603
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4582	NC_016911	ACTG	2	8	230196	230203	25 %	25 %	25 %	25 %	378723606
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4585	NC_016911	AGTC	2	8	230300	230307	25 %	25 %	25 %	25 %	378723606
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4590	NC_016911	T	8	8	231411	231418	0 %	100 %	0 %	0 %	378723607
4591	NC_016911	AAT	2	6	231463	231468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723607
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4593	NC_016911	CAT	2	6	231534	231539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378723607
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4596	NC_016911	TAGG	2	8	231633	231640	25 %	25 %	50 %	0 %	378723607
4597	NC_016911	GGC	2	6	231676	231681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378723607
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4599	NC_016911	AAG	2	6	231753	231758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723607
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4604	NC_016911	ATT	2	6	232169	232174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723607
4605	NC_016911	GAA	2	6	232175	232180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378723607
4606	NC_016911	ATG	2	6	232187	232192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723607
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4608	NC_016911	ATCT	2	8	232325	232332	25 %	50 %	0 %	25 %	378723607
4609	NC_016911	GATT	2	8	232374	232381	25 %	50 %	25 %	0 %	378723607
4610	NC_016911	ATA	2	6	232551	232556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723608
4611	NC_016911	A	7	7	232567	232573	100 %	0 %	0 %	0 %	378723608
4612	NC_016911	AAT	3	9	232642	232650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723609
4613	NC_016911	T	6	6	232665	232670	0 %	100 %	0 %	0 %	378723609
4614	NC_016911	GTG	2	6	232679	232684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378723609
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4618	NC_016911	TAA	2	6	232832	232837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723609
4619	NC_016911	TTA	2	6	232901	232906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378723609
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4994	NC_016911	ATG	2	6	249440	249445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723625
4995	NC_016911	AAT	2	6	249451	249456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378723625
4996	NC_016911	CGG	2	6	249480	249485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378723625
4997	NC_016911	T	6	6	249493	249498	0 %	100 %	0 %	0 %	378723625
4998	NC_016911	TGA	2	6	249504	249509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378723625
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