MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Arizona chromosome

Total Repeats: 2054

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016909	AT	3	6	787	792	50 %	50 %	0 %	0 %	378722020
2	NC_016909	TC	3	6	1521	1526	0 %	50 %	0 %	50 %	378722022
3	NC_016909	AT	3	6	1646	1651	50 %	50 %	0 %	0 %	378722022
4	NC_016909	TA	3	6	1764	1769	50 %	50 %	0 %	0 %	378722022
5	NC_016909	GA	3	6	2332	2337	50 %	0 %	50 %	0 %	378722023
6	NC_016909	TA	3	6	2496	2501	50 %	50 %	0 %	0 %	378722023
7	NC_016909	TG	3	6	2612	2617	0 %	50 %	50 %	0 %	378722023
8	NC_016909	AT	3	6	2756	2761	50 %	50 %	0 %	0 %	378722023
9	NC_016909	TC	3	6	3069	3074	0 %	50 %	0 %	50 %	378722024
10	NC_016909	TG	3	6	3437	3442	0 %	50 %	50 %	0 %	378722024
11	NC_016909	GA	3	6	3544	3549	50 %	0 %	50 %	0 %	378722024
12	NC_016909	AT	3	6	4006	4011	50 %	50 %	0 %	0 %	378722024
13	NC_016909	AT	3	6	4316	4321	50 %	50 %	0 %	0 %	378722024
14	NC_016909	AG	3	6	4335	4340	50 %	0 %	50 %	0 %	378722024
15	NC_016909	TA	3	6	4423	4428	50 %	50 %	0 %	0 %	378722024
16	NC_016909	TA	3	6	4675	4680	50 %	50 %	0 %	0 %	378722024
17	NC_016909	AT	3	6	4867	4872	50 %	50 %	0 %	0 %	378722024
18	NC_016909	AT	3	6	5901	5906	50 %	50 %	0 %	0 %	378722024
19	NC_016909	TA	3	6	6247	6252	50 %	50 %	0 %	0 %	378722025
20	NC_016909	TA	3	6	8521	8526	50 %	50 %	0 %	0 %	378722028
21	NC_016909	GT	3	6	9629	9634	0 %	50 %	50 %	0 %	378722030
22	NC_016909	TA	3	6	9730	9735	50 %	50 %	0 %	0 %	378722030
23	NC_016909	TA	3	6	11525	11530	50 %	50 %	0 %	0 %	378722032
24	NC_016909	AC	3	6	12241	12246	50 %	0 %	0 %	50 %	378722034
25	NC_016909	TA	3	6	12278	12283	50 %	50 %	0 %	0 %	378722034
26	NC_016909	TA	3	6	14119	14124	50 %	50 %	0 %	0 %	378722036
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29	NC_016909	AT	3	6	15720	15725	50 %	50 %	0 %	0 %	378722039
30	NC_016909	TA	3	6	15748	15753	50 %	50 %	0 %	0 %	378722039
31	NC_016909	AT	3	6	17221	17226	50 %	50 %	0 %	0 %	378722040
32	NC_016909	TG	3	6	17760	17765	0 %	50 %	50 %	0 %	378722040
33	NC_016909	AT	3	6	18971	18976	50 %	50 %	0 %	0 %	378722042
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39	NC_016909	AT	3	6	23459	23464	50 %	50 %	0 %	0 %	378722044
40	NC_016909	TA	3	6	24143	24148	50 %	50 %	0 %	0 %	378722044
41	NC_016909	TA	3	6	24242	24247	50 %	50 %	0 %	0 %	378722044
42	NC_016909	TA	3	6	25407	25412	50 %	50 %	0 %	0 %	378722044
43	NC_016909	AT	3	6	25464	25469	50 %	50 %	0 %	0 %	378722044
44	NC_016909	AT	3	6	28017	28022	50 %	50 %	0 %	0 %	378722048
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49	NC_016909	AT	3	6	29828	29833	50 %	50 %	0 %	0 %	378722052
50	NC_016909	AT	3	6	31639	31644	50 %	50 %	0 %	0 %	378722055
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63	NC_016909	AT	3	6	44003	44008	50 %	50 %	0 %	0 %	378722069
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104	NC_016909	TA	3	6	71287	71292	50 %	50 %	0 %	0 %	378722098
105	NC_016909	AT	3	6	71652	71657	50 %	50 %	0 %	0 %	378722098
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113	NC_016909	TA	4	8	76753	76760	50 %	50 %	0 %	0 %	378722105
114	NC_016909	AT	3	6	77240	77245	50 %	50 %	0 %	0 %	378722105
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119	NC_016909	AT	3	6	81248	81253	50 %	50 %	0 %	0 %	378722109
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125	NC_016909	AT	3	6	82389	82394	50 %	50 %	0 %	0 %	378722110
126	NC_016909	AT	3	6	82421	82426	50 %	50 %	0 %	0 %	378722110
127	NC_016909	TA	3	6	83865	83870	50 %	50 %	0 %	0 %	378722112
128	NC_016909	AT	3	6	85151	85156	50 %	50 %	0 %	0 %	378722112
129	NC_016909	AT	3	6	86054	86059	50 %	50 %	0 %	0 %	378722114
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133	NC_016909	GA	3	6	88929	88934	50 %	0 %	50 %	0 %	378722118
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