MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Arizona chromosome

Total Repeats: 24271

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016909	TTA	2	6	201459	201464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722218
4002	NC_016909	TTA	2	6	201479	201484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722218
4003	NC_016909	TTA	2	6	201512	201517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722218
4004	NC_016909	T	6	6	201591	201596	0 %	100 %	0 %	0 %	378722218
4005	NC_016909	TTA	2	6	201623	201628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722218
4006	NC_016909	ATA	2	6	201636	201641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722218
4007	NC_016909	CGG	2	6	201646	201651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378722218
4008	NC_016909	TGT	2	6	201712	201717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378722218
4009	NC_016909	T	6	6	201789	201794	0 %	100 %	0 %	0 %	378722218
4010	NC_016909	T	7	7	201819	201825	0 %	100 %	0 %	0 %	378722219
4011	NC_016909	ATTA	2	8	201852	201859	50 %	50 %	0 %	0 %	378722219
4012	NC_016909	TTC	2	6	201903	201908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722219
4013	NC_016909	ATT	2	6	201933	201938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722219
4014	NC_016909	T	6	6	201948	201953	0 %	100 %	0 %	0 %	378722219
4015	NC_016909	ATA	2	6	201973	201978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722219
4016	NC_016909	TTC	2	6	202002	202007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722219
4017	NC_016909	T	7	7	202075	202081	0 %	100 %	0 %	0 %	378722219
4018	NC_016909	CTA	2	6	202106	202111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722219
4019	NC_016909	TAT	2	6	202142	202147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722219
4020	NC_016909	TA	3	6	202157	202162	50 %	50 %	0 %	0 %	378722219
4021	NC_016909	AT	3	6	202204	202209	50 %	50 %	0 %	0 %	378722219
4022	NC_016909	T	6	6	202300	202305	0 %	100 %	0 %	0 %	378722219
4023	NC_016909	T	6	6	202314	202319	0 %	100 %	0 %	0 %	378722219
4024	NC_016909	ATA	2	6	202345	202350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722219
4025	NC_016909	CAA	2	6	202364	202369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378722219
4026	NC_016909	TC	3	6	202370	202375	0 %	50 %	0 %	50 %	378722219
4027	NC_016909	AGG	2	6	202395	202400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378722219
4028	NC_016909	GCA	2	6	202408	202413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378722219
4029	NC_016909	T	6	6	202430	202435	0 %	100 %	0 %	0 %	378722219
4030	NC_016909	T	8	8	202443	202450	0 %	100 %	0 %	0 %	378722219
4031	NC_016909	T	7	7	202819	202825	0 %	100 %	0 %	0 %	378722220
4032	NC_016909	AAT	2	6	202851	202856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722220
4033	NC_016909	TTA	2	6	202935	202940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722220
4034	NC_016909	TCT	2	6	202965	202970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722220
4035	NC_016909	ATT	2	6	202971	202976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722220
4036	NC_016909	CATT	2	8	203097	203104	25 %	50 %	0 %	25 %	378722220
4037	NC_016909	TTTA	2	8	203120	203127	25 %	75 %	0 %	0 %	378722220
4038	NC_016909	AAT	2	6	203136	203141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722220
4039	NC_016909	CATT	2	8	203178	203185	25 %	50 %	0 %	25 %	378722220
4040	NC_016909	TGC	2	6	203186	203191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722220
4041	NC_016909	CTA	2	6	203224	203229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722220
4042	NC_016909	CAT	2	6	203239	203244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722220
4043	NC_016909	TCA	2	6	203331	203336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722220
4044	NC_016909	TAA	2	6	203351	203356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722220
4045	NC_016909	CTT	3	9	203389	203397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722220
4046	NC_016909	CGC	2	6	203419	203424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378722220
4047	NC_016909	ATT	2	6	203454	203459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722220
4048	NC_016909	CAAG	2	8	203473	203480	50 %	0 %	25 %	25 %	378722220
4049	NC_016909	ATG	2	6	203517	203522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722220
4050	NC_016909	GAATT	2	10	203527	203536	40 %	40 %	20 %	0 %	378722220
4051	NC_016909	CGC	2	6	203572	203577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378722220
4052	NC_016909	T	6	6	203670	203675	0 %	100 %	0 %	0 %	378722220
4053	NC_016909	GCT	2	6	203685	203690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722220
4054	NC_016909	TGA	2	6	203699	203704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722220
4055	NC_016909	TGAT	2	8	203777	203784	25 %	50 %	25 %	0 %	378722220
4056	NC_016909	AAT	2	6	203941	203946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722220
4057	NC_016909	ATTT	3	12	203968	203979	25 %	75 %	0 %	0 %	378722220
4058	NC_016909	AAGCCC	2	12	203987	203998	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378722220
4059	NC_016909	TGC	2	6	204056	204061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722220
4060	NC_016909	TGC	2	6	204092	204097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722220
4061	NC_016909	TAC	2	6	204106	204111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722220
4062	NC_016909	A	6	6	204118	204123	100 %	0 %	0 %	0 %	378722220
4063	NC_016909	AT	3	6	204198	204203	50 %	50 %	0 %	0 %	378722220
4064	NC_016909	CAG	2	6	204345	204350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378722221
4065	NC_016909	TAAA	2	8	204393	204400	75 %	25 %	0 %	0 %	378722221
4066	NC_016909	ATA	2	6	204413	204418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722221
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4069	NC_016909	ACG	2	6	204526	204531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378722221
4070	NC_016909	ATA	2	6	204550	204555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722221
4071	NC_016909	GAT	2	6	204572	204577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722221
4072	NC_016909	ATA	2	6	204596	204601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722221
4073	NC_016909	GAA	2	6	204722	204727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722221
4074	NC_016909	TAA	2	6	204749	204754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722221
4075	NC_016909	AGT	2	6	204818	204823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722221
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4078	NC_016909	CAT	2	6	204988	204993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722221
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4081	NC_016909	CTG	2	6	205197	205202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722221
4082	NC_016909	GAA	2	6	205217	205222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722221
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4087	NC_016909	GTTT	2	8	205674	205681	0 %	75 %	25 %	0 %	378722221
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4092	NC_016909	A	6	6	205917	205922	100 %	0 %	0 %	0 %	378722222
4093	NC_016909	TCT	2	6	205936	205941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722222
4094	NC_016909	TGC	2	6	205977	205982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722222
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4097	NC_016909	TAG	2	6	206358	206363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722223
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4100	NC_016909	CCTG	2	8	206421	206428	0 %	25 %	25 %	50 %	378722223
4101	NC_016909	CTAA	2	8	206458	206465	50 %	25 %	0 %	25 %	378722223
4102	NC_016909	ATTTT	2	10	206473	206482	20 %	80 %	0 %	0 %	378722223
4103	NC_016909	ATT	2	6	206802	206807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722224
4104	NC_016909	TTA	2	6	206824	206829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722224
4105	NC_016909	TAC	2	6	206842	206847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722224
4106	NC_016909	ATC	2	6	206852	206857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722224
4107	NC_016909	ATG	2	6	206888	206893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722224
4108	NC_016909	TCT	2	6	206951	206956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722224
4109	NC_016909	TCTT	2	8	207023	207030	0 %	75 %	0 %	25 %	378722224
4110	NC_016909	CCGT	2	8	207066	207073	0 %	25 %	25 %	50 %	378722224
4111	NC_016909	GAT	2	6	207120	207125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722224
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4113	NC_016909	ATTT	2	8	207727	207734	25 %	75 %	0 %	0 %	378722225
4114	NC_016909	TTA	2	6	207777	207782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722225
4115	NC_016909	T	6	6	207815	207820	0 %	100 %	0 %	0 %	378722225
4116	NC_016909	T	8	8	207831	207838	0 %	100 %	0 %	0 %	378722225
4117	NC_016909	TAA	2	6	207878	207883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722225
4118	NC_016909	CCG	2	6	207954	207959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378722225
4119	NC_016909	TAC	2	6	207968	207973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722225
4120	NC_016909	T	7	7	207978	207984	0 %	100 %	0 %	0 %	378722225
4121	NC_016909	GCG	2	6	208004	208009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378722225
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4123	NC_016909	TA	3	6	208127	208132	50 %	50 %	0 %	0 %	378722225
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4240	NC_016909	CCTTG	2	10	214016	214025	0 %	40 %	20 %	40 %	378722231
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4243	NC_016909	CT	3	6	214218	214223	0 %	50 %	0 %	50 %	378722231
4244	NC_016909	A	6	6	214279	214284	100 %	0 %	0 %	0 %	378722231
4245	NC_016909	AAAT	2	8	214357	214364	75 %	25 %	0 %	0 %	378722231
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4493	NC_016909	AT	3	6	224871	224876	50 %	50 %	0 %	0 %	378722241
4494	NC_016909	A	6	6	224960	224965	100 %	0 %	0 %	0 %	378722241
4495	NC_016909	TAT	2	6	225518	225523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722242
4496	NC_016909	A	8	8	225548	225555	100 %	0 %	0 %	0 %	378722242
4497	NC_016909	GACC	2	8	225584	225591	25 %	0 %	25 %	50 %	378722242
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4500	NC_016909	TAATAT	2	12	225701	225712	50 %	50 %	0 %	0 %	378722242

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