MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Arizona chromosome

Total Repeats: 24271

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016909	TACCT	2	10	24421	24430	20 %	40 %	0 %	40 %	378722044
502	NC_016909	GAA	2	6	24440	24445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722044
503	NC_016909	AAG	2	6	24447	24452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722044
504	NC_016909	AAGT	2	8	24459	24466	50 %	25 %	25 %	0 %	378722044
505	NC_016909	TACCT	2	10	24508	24517	20 %	40 %	0 %	40 %	378722044
506	NC_016909	GAA	2	6	24527	24532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722044
507	NC_016909	AAG	2	6	24534	24539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722044
508	NC_016909	AAGT	2	8	24546	24553	50 %	25 %	25 %	0 %	378722044
509	NC_016909	GCATTA	2	12	24599	24610	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378722044
510	NC_016909	GAA	2	6	24662	24667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722044
511	NC_016909	GAA	3	9	24692	24700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722044
512	NC_016909	TCCGAT	2	12	24716	24727	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378722044
513	NC_016909	A	7	7	24784	24790	100 %	0 %	0 %	0 %	378722044
514	NC_016909	AAATGC	2	12	24792	24803	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378722044
515	NC_016909	GTT	2	6	24842	24847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378722044
516	NC_016909	ATA	2	6	24861	24866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722044
517	NC_016909	TAA	2	6	24898	24903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722044
518	NC_016909	TGA	2	6	24922	24927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722044
519	NC_016909	AGA	2	6	24928	24933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722044
520	NC_016909	TAA	2	6	24979	24984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722044
521	NC_016909	CTA	2	6	25035	25040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722044
522	NC_016909	AAT	2	6	25064	25069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722044
523	NC_016909	TTCA	2	8	25095	25102	25 %	50 %	0 %	25 %	378722044
524	NC_016909	ATTTAA	2	12	25105	25116	50 %	50 %	0 %	0 %	378722044
525	NC_016909	AAT	2	6	25127	25132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722044
526	NC_016909	TTA	2	6	25143	25148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722044
527	NC_016909	GAA	2	6	25189	25194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722044
528	NC_016909	TTA	2	6	25233	25238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722044
529	NC_016909	AAC	2	6	25246	25251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378722044
530	NC_016909	TTA	2	6	25359	25364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722044
531	NC_016909	TA	3	6	25407	25412	50 %	50 %	0 %	0 %	378722044
532	NC_016909	AAT	2	6	25460	25465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722044
533	NC_016909	AT	3	6	25464	25469	50 %	50 %	0 %	0 %	378722044
534	NC_016909	TAA	2	6	25525	25530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722044
535	NC_016909	AATA	2	8	25588	25595	75 %	25 %	0 %	0 %	378722044
536	NC_016909	GTT	2	6	25598	25603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378722044
537	NC_016909	ATA	2	6	25614	25619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722044
538	NC_016909	TAT	2	6	25681	25686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722044
539	NC_016909	TAC	2	6	25702	25707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722044
540	NC_016909	ATT	2	6	25725	25730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722044
541	NC_016909	TAAA	2	8	25734	25741	75 %	25 %	0 %	0 %	378722044
542	NC_016909	TCA	2	6	25753	25758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722044
543	NC_016909	AGAAAA	2	12	26109	26120	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	378722045
544	NC_016909	ATGT	2	8	26533	26540	25 %	50 %	25 %	0 %	378722046
545	NC_016909	AAC	2	6	26581	26586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378722046
546	NC_016909	TTAT	2	8	26587	26594	25 %	75 %	0 %	0 %	378722046
547	NC_016909	TAA	2	6	26632	26637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722046
548	NC_016909	TTA	2	6	26650	26655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722046
549	NC_016909	AGCA	2	8	26661	26668	50 %	0 %	25 %	25 %	378722046
550	NC_016909	ACA	2	6	27130	27135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378722047
551	NC_016909	AGA	2	6	27139	27144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722047
552	NC_016909	TTA	2	6	27261	27266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722047
553	NC_016909	GAA	2	6	27347	27352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722047
554	NC_016909	ATA	2	6	27356	27361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722047
555	NC_016909	TAT	2	6	27402	27407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722047
556	NC_016909	TAAT	2	8	27462	27469	50 %	50 %	0 %	0 %	378722047
557	NC_016909	TAC	2	6	27499	27504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722047
558	NC_016909	ATA	2	6	27510	27515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722047
559	NC_016909	TGA	2	6	27523	27528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722047
560	NC_016909	ATATT	2	10	27537	27546	40 %	60 %	0 %	0 %	378722047
561	NC_016909	A	6	6	27563	27568	100 %	0 %	0 %	0 %	378722047
562	NC_016909	ATATT	2	10	27575	27584	40 %	60 %	0 %	0 %	378722047
563	NC_016909	A	6	6	27598	27603	100 %	0 %	0 %	0 %	378722047
564	NC_016909	AAGA	2	8	27614	27621	75 %	0 %	25 %	0 %	378722047
565	NC_016909	TAG	2	6	27633	27638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722047
566	NC_016909	GTA	2	6	27648	27653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722047
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568	NC_016909	AAAT	2	8	27706	27713	75 %	25 %	0 %	0 %	378722047
569	NC_016909	ATTA	2	8	27734	27741	50 %	50 %	0 %	0 %	378722047
570	NC_016909	GAT	2	6	27758	27763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722047
571	NC_016909	TAC	2	6	27783	27788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722047
572	NC_016909	ATT	2	6	27790	27795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722047
573	NC_016909	TTA	2	6	27857	27862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722048
574	NC_016909	GAA	2	6	27877	27882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722048
575	NC_016909	AT	3	6	28017	28022	50 %	50 %	0 %	0 %	378722048
576	NC_016909	AAATA	2	10	28023	28032	80 %	20 %	0 %	0 %	378722048
577	NC_016909	A	6	6	28219	28224	100 %	0 %	0 %	0 %	378722049
578	NC_016909	TTA	2	6	28229	28234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722049
579	NC_016909	AT	4	8	28241	28248	50 %	50 %	0 %	0 %	378722049
580	NC_016909	GAA	2	6	28260	28265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722049
581	NC_016909	CTT	2	6	28318	28323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722049
582	NC_016909	CT	3	6	28334	28339	0 %	50 %	0 %	50 %	378722049
583	NC_016909	TAA	2	6	28340	28345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722049
584	NC_016909	TCA	2	6	28817	28822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722050
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588	NC_016909	TCT	2	6	28964	28969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722050
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593	NC_016909	A	7	7	29144	29150	100 %	0 %	0 %	0 %	378722050
594	NC_016909	ATT	2	6	29195	29200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722050
595	NC_016909	GTA	2	6	29216	29221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722051
596	NC_016909	T	6	6	29249	29254	0 %	100 %	0 %	0 %	378722051
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598	NC_016909	TGC	2	6	29283	29288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722051
599	NC_016909	TTA	2	6	29293	29298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722051
600	NC_016909	AGC	2	6	29313	29318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378722051
601	NC_016909	T	6	6	29353	29358	0 %	100 %	0 %	0 %	378722051
602	NC_016909	T	8	8	29377	29384	0 %	100 %	0 %	0 %	378722051
603	NC_016909	T	6	6	29414	29419	0 %	100 %	0 %	0 %	378722051
604	NC_016909	TCTA	2	8	29430	29437	25 %	50 %	0 %	25 %	378722051
605	NC_016909	TTTGT	2	10	29446	29455	0 %	80 %	20 %	0 %	378722051
606	NC_016909	ATTT	2	8	29474	29481	25 %	75 %	0 %	0 %	378722051
607	NC_016909	TGTC	2	8	29538	29545	0 %	50 %	25 %	25 %	378722051
608	NC_016909	TAT	2	6	29546	29551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722051
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611	NC_016909	AAT	2	6	29639	29644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722051
612	NC_016909	A	6	6	29693	29698	100 %	0 %	0 %	0 %	378722052
613	NC_016909	A	6	6	29723	29728	100 %	0 %	0 %	0 %	378722052
614	NC_016909	AG	3	6	29818	29823	50 %	0 %	50 %	0 %	378722052
615	NC_016909	AT	3	6	29828	29833	50 %	50 %	0 %	0 %	378722052
616	NC_016909	CAT	2	6	30125	30130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722053
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618	NC_016909	CAA	2	6	30179	30184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378722053
619	NC_016909	ATA	2	6	30211	30216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722053
620	NC_016909	TAA	2	6	30276	30281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722053
621	NC_016909	CAT	2	6	30294	30299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722053
622	NC_016909	ATC	2	6	30364	30369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722053
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624	NC_016909	ATA	2	6	30493	30498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722053
625	NC_016909	TAG	2	6	30503	30508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722053
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627	NC_016909	CACT	2	8	30653	30660	25 %	25 %	0 %	50 %	378722053
628	NC_016909	T	6	6	30798	30803	0 %	100 %	0 %	0 %	378722053
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