MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Arizona chromosome

Total Repeats: 24271

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016909	CAT	2	6	225738	225743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722242
4502	NC_016909	GAA	2	6	225826	225831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722242
4503	NC_016909	AAG	2	6	225838	225843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722242
4504	NC_016909	ATA	2	6	226043	226048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722243
4505	NC_016909	AGA	2	6	226107	226112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722243
4506	NC_016909	TA	4	8	226116	226123	50 %	50 %	0 %	0 %	378722243
4507	NC_016909	AAC	2	6	226153	226158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378722243
4508	NC_016909	CTT	2	6	226248	226253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722243
4509	NC_016909	AAT	2	6	226290	226295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722243
4510	NC_016909	TGC	2	6	226299	226304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722243
4511	NC_016909	T	7	7	226376	226382	0 %	100 %	0 %	0 %	378722243
4512	NC_016909	TAT	2	6	226404	226409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722243
4513	NC_016909	ATC	2	6	226449	226454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722243
4514	NC_016909	CAT	2	6	226459	226464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722243
4515	NC_016909	TTA	2	6	226526	226531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722243
4516	NC_016909	TAC	2	6	226539	226544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722243
4517	NC_016909	TAT	3	9	226583	226591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722243
4518	NC_016909	A	6	6	226609	226614	100 %	0 %	0 %	0 %	378722243
4519	NC_016909	TAA	2	6	226662	226667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722243
4520	NC_016909	A	6	6	226716	226721	100 %	0 %	0 %	0 %	378722243
4521	NC_016909	AT	3	6	226726	226731	50 %	50 %	0 %	0 %	378722243
4522	NC_016909	GTG	2	6	226777	226782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378722243
4523	NC_016909	AGG	2	6	227198	227203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378722244
4524	NC_016909	TTA	2	6	227204	227209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722244
4525	NC_016909	GAT	2	6	227229	227234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722244
4526	NC_016909	GAT	2	6	227256	227261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722244
4527	NC_016909	TAAATT	2	12	227297	227308	50 %	50 %	0 %	0 %	378722244
4528	NC_016909	GCC	2	6	227313	227318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378722244
4529	NC_016909	GCTT	2	8	227376	227383	0 %	50 %	25 %	25 %	378722244
4530	NC_016909	ATG	2	6	227567	227572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722244
4531	NC_016909	GAT	2	6	227616	227621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722244
4532	NC_016909	GGA	2	6	227622	227627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378722244
4533	NC_016909	A	6	6	227640	227645	100 %	0 %	0 %	0 %	378722244
4534	NC_016909	AGT	2	6	227703	227708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722244
4535	NC_016909	AGT	2	6	227716	227721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722244
4536	NC_016909	GTG	2	6	227783	227788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378722244
4537	NC_016909	AT	3	6	227805	227810	50 %	50 %	0 %	0 %	378722244
4538	NC_016909	AGA	2	6	227862	227867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722244
4539	NC_016909	TTG	2	6	227924	227929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378722244
4540	NC_016909	AGC	2	6	227934	227939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378722244
4541	NC_016909	TTG	2	6	227945	227950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378722244
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4543	NC_016909	A	6	6	227966	227971	100 %	0 %	0 %	0 %	378722244
4544	NC_016909	A	6	6	227985	227990	100 %	0 %	0 %	0 %	378722244
4545	NC_016909	A	8	8	228036	228043	100 %	0 %	0 %	0 %	378722244
4546	NC_016909	ATCA	2	8	228107	228114	50 %	25 %	0 %	25 %	378722244
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4550	NC_016909	TA	3	6	228190	228195	50 %	50 %	0 %	0 %	378722244
4551	NC_016909	A	6	6	228298	228303	100 %	0 %	0 %	0 %	378722244
4552	NC_016909	AAAT	2	8	229105	229112	75 %	25 %	0 %	0 %	378722245
4553	NC_016909	CCG	2	6	229148	229153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378722245
4554	NC_016909	TTA	2	6	229203	229208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722245
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4559	NC_016909	GGA	2	6	229588	229593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378722246
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4561	NC_016909	TCT	2	6	229624	229629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722246
4562	NC_016909	TCA	3	9	229633	229641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722246
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4564	NC_016909	GAA	2	6	230083	230088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722247
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4566	NC_016909	TA	3	6	230123	230128	50 %	50 %	0 %	0 %	378722247
4567	NC_016909	T	6	6	230150	230155	0 %	100 %	0 %	0 %	378722247
4568	NC_016909	AGTC	2	8	230212	230219	25 %	25 %	25 %	25 %	378722247
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4579	NC_016909	TAGG	2	8	231545	231552	25 %	25 %	50 %	0 %	378722248
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4607	NC_016909	AAACT	2	10	232994	233003	60 %	20 %	0 %	20 %	378722251
4608	NC_016909	AGAA	2	8	233016	233023	75 %	0 %	25 %	0 %	378722251
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4611	NC_016909	TCT	2	6	233543	233548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722252
4612	NC_016909	TA	3	6	233550	233555	50 %	50 %	0 %	0 %	378722252
4613	NC_016909	CATA	2	8	233589	233596	50 %	25 %	0 %	25 %	378722252
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4619	NC_016909	TCT	2	6	234071	234076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722253
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4992	NC_016909	CAT	2	6	250668	250673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722267
4993	NC_016909	TAT	2	6	250726	250731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722267
4994	NC_016909	CATGG	2	10	250752	250761	20 %	20 %	40 %	20 %	378722267
4995	NC_016909	AGA	2	6	250768	250773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722267
4996	NC_016909	GAT	2	6	250787	250792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722267
4997	NC_016909	AAT	2	6	250822	250827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722267
4998	NC_016909	TCT	2	6	251018	251023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722268
4999	NC_016909	TTTG	2	8	251042	251049	0 %	75 %	25 %	0 %	378722268
5000	NC_016909	ATC	3	9	251059	251067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722268

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