MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Colombia chromosome

Total Repeats: 24405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_016908	TAT	2	6	202167	202172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720865
4003	NC_016908	TA	3	6	202182	202187	50 %	50 %	0 %	0 %	378720865
4004	NC_016908	AT	3	6	202229	202234	50 %	50 %	0 %	0 %	378720865
4005	NC_016908	T	6	6	202325	202330	0 %	100 %	0 %	0 %	378720865
4006	NC_016908	T	6	6	202339	202344	0 %	100 %	0 %	0 %	378720865
4007	NC_016908	ATA	2	6	202370	202375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720865
4008	NC_016908	CAA	2	6	202389	202394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378720865
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4010	NC_016908	AGG	2	6	202420	202425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378720865
4011	NC_016908	GCA	2	6	202433	202438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720865
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4013	NC_016908	T	8	8	202468	202475	0 %	100 %	0 %	0 %	378720865
4014	NC_016908	T	7	7	202844	202850	0 %	100 %	0 %	0 %	378720866
4015	NC_016908	AAT	2	6	202876	202881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720866
4016	NC_016908	TTA	2	6	202960	202965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720866
4017	NC_016908	TCT	2	6	202990	202995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378720866
4018	NC_016908	ATT	2	6	202996	203001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720866
4019	NC_016908	CATT	2	8	203122	203129	25 %	50 %	0 %	25 %	378720866
4020	NC_016908	TTTA	2	8	203145	203152	25 %	75 %	0 %	0 %	378720866
4021	NC_016908	AAT	2	6	203161	203166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720866
4022	NC_016908	CATT	2	8	203203	203210	25 %	50 %	0 %	25 %	378720866
4023	NC_016908	TGC	2	6	203211	203216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720866
4024	NC_016908	CTA	2	6	203249	203254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720866
4025	NC_016908	CAT	2	6	203264	203269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720866
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4029	NC_016908	CGC	2	6	203444	203449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720866
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4033	NC_016908	GAATT	2	10	203552	203561	40 %	40 %	20 %	0 %	378720866
4034	NC_016908	CGC	2	6	203597	203602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720866
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4040	NC_016908	ATTT	3	12	203993	204004	25 %	75 %	0 %	0 %	378720866
4041	NC_016908	AAGCCC	2	12	204012	204023	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378720866
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4052	NC_016908	ACG	2	6	204551	204556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720867
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4054	NC_016908	GAT	2	6	204597	204602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720867
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4494	NC_016908	TA	4	8	226236	226243	50 %	50 %	0 %	0 %	378720890
4495	NC_016908	AAC	2	6	226273	226278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378720890
4496	NC_016908	CTT	2	6	226368	226373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378720890
4497	NC_016908	AAT	2	6	226410	226415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720890
4498	NC_016908	TGC	2	6	226419	226424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720890
4499	NC_016908	T	7	7	226496	226502	0 %	100 %	0 %	0 %	378720890
4500	NC_016908	TAT	2	6	226524	226529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720890

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