MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Colombia chromosome

Total Repeats: 24405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016908	ATC	2	6	226569	226574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720890
4502	NC_016908	CAT	2	6	226579	226584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720890
4503	NC_016908	TTA	2	6	226646	226651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720890
4504	NC_016908	TAC	2	6	226659	226664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720890
4505	NC_016908	TAT	3	9	226703	226711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720890
4506	NC_016908	A	6	6	226729	226734	100 %	0 %	0 %	0 %	378720890
4507	NC_016908	TAA	2	6	226782	226787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720890
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4509	NC_016908	AT	3	6	226846	226851	50 %	50 %	0 %	0 %	378720890
4510	NC_016908	GTG	2	6	226897	226902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378720890
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4512	NC_016908	TTA	2	6	227324	227329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720891
4513	NC_016908	GAT	2	6	227349	227354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720891
4514	NC_016908	GAT	2	6	227376	227381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720891
4515	NC_016908	TAAATT	2	12	227417	227428	50 %	50 %	0 %	0 %	378720891
4516	NC_016908	GCC	2	6	227433	227438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720891
4517	NC_016908	GCTT	2	8	227496	227503	0 %	50 %	25 %	25 %	378720891
4518	NC_016908	ATG	2	6	227687	227692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720891
4519	NC_016908	GAT	2	6	227736	227741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720891
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4521	NC_016908	A	6	6	227760	227765	100 %	0 %	0 %	0 %	378720891
4522	NC_016908	AGT	2	6	227823	227828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720891
4523	NC_016908	AGT	2	6	227836	227841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720891
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4529	NC_016908	TTG	2	6	228065	228070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378720891
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4532	NC_016908	A	6	6	228105	228110	100 %	0 %	0 %	0 %	378720891
4533	NC_016908	A	8	8	228156	228163	100 %	0 %	0 %	0 %	378720891
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4540	NC_016908	AAAT	2	8	229225	229232	75 %	25 %	0 %	0 %	378720892
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4549	NC_016908	TCT	2	6	229744	229749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378720893
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4553	NC_016908	ACTG	2	8	230228	230235	25 %	25 %	25 %	25 %	378720894
4554	NC_016908	TA	3	6	230243	230248	50 %	50 %	0 %	0 %	378720894
4555	NC_016908	T	6	6	230270	230275	0 %	100 %	0 %	0 %	378720894
4556	NC_016908	AGTC	2	8	230332	230339	25 %	25 %	25 %	25 %	378720894
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4558	NC_016908	TAT	2	6	231354	231359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720895
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4564	NC_016908	CAT	2	6	231566	231571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720895
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4605	NC_016908	TTA	2	6	234155	234160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378720900
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4607	NC_016908	TCT	2	6	234191	234196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378720900
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4993	NC_016908	AT	3	6	251610	251615	50 %	50 %	0 %	0 %	378720917
4994	NC_016908	TAA	2	6	251630	251635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720917
4995	NC_016908	TTCT	2	8	251641	251648	0 %	75 %	0 %	25 %	378720917
4996	NC_016908	TA	3	6	251675	251680	50 %	50 %	0 %	0 %	378720917
4997	NC_016908	AAT	2	6	251698	251703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378720917
4998	NC_016908	ATC	2	6	251759	251764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720917
4999	NC_016908	TAAAG	2	10	251811	251820	60 %	20 %	20 %	0 %	378720917
5000	NC_016908	CAA	2	6	251828	251833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378720917

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