MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq201

Total Repeats: 563

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016835	TC	3	6	780	785	0 %	50 %	0 %	50 %	379703933
2	NC_016835	GC	3	6	1396	1401	0 %	0 %	50 %	50 %	379703933
3	NC_016835	GC	3	6	1887	1892	0 %	0 %	50 %	50 %	379703933
4	NC_016835	GT	3	6	1931	1936	0 %	50 %	50 %	0 %	379703933
5	NC_016835	GC	4	8	2582	2589	0 %	0 %	50 %	50 %	379703933
6	NC_016835	CG	3	6	3070	3075	0 %	0 %	50 %	50 %	379703934
7	NC_016835	CA	3	6	4147	4152	50 %	0 %	0 %	50 %	379703934
8	NC_016835	CA	3	6	4496	4501	50 %	0 %	0 %	50 %	379703934
9	NC_016835	AG	3	6	5251	5256	50 %	0 %	50 %	0 %	379703935
10	NC_016835	TC	3	6	5490	5495	0 %	50 %	0 %	50 %	379703935
11	NC_016835	TG	3	6	5723	5728	0 %	50 %	50 %	0 %	379703935
12	NC_016835	CA	3	6	6558	6563	50 %	0 %	0 %	50 %	379703935
13	NC_016835	TA	3	6	7280	7285	50 %	50 %	0 %	0 %	379703935
14	NC_016835	TC	3	6	8005	8010	0 %	50 %	0 %	50 %	379703936
15	NC_016835	TG	3	6	8709	8714	0 %	50 %	50 %	0 %	379703936
16	NC_016835	AT	3	6	9443	9448	50 %	50 %	0 %	0 %	379703937
17	NC_016835	GA	3	6	10271	10276	50 %	0 %	50 %	0 %	379703938
18	NC_016835	AT	3	6	10921	10926	50 %	50 %	0 %	0 %	379703938
19	NC_016835	AT	3	6	12570	12575	50 %	50 %	0 %	0 %	379703939
20	NC_016835	TC	3	6	13374	13379	0 %	50 %	0 %	50 %	379703941
21	NC_016835	TG	3	6	13607	13612	0 %	50 %	50 %	0 %	379703941
22	NC_016835	CA	3	6	14442	14447	50 %	0 %	0 %	50 %	379703941
23	NC_016835	TA	3	6	15670	15675	50 %	50 %	0 %	0 %	379703941
24	NC_016835	CA	3	6	17024	17029	50 %	0 %	0 %	50 %	379703943
25	NC_016835	GA	4	8	17802	17809	50 %	0 %	50 %	0 %	379703943
26	NC_016835	TA	3	6	18556	18561	50 %	50 %	0 %	0 %	379703944
27	NC_016835	TC	3	6	19858	19863	0 %	50 %	0 %	50 %	379703946
28	NC_016835	CG	3	6	20766	20771	0 %	0 %	50 %	50 %	379703947
29	NC_016835	CA	3	6	20972	20977	50 %	0 %	0 %	50 %	379703947
30	NC_016835	CA	3	6	20996	21001	50 %	0 %	0 %	50 %	379703947
31	NC_016835	GC	3	6	21961	21966	0 %	0 %	50 %	50 %	379703948
32	NC_016835	CA	3	6	24058	24063	50 %	0 %	0 %	50 %	379703948
33	NC_016835	TC	3	6	24375	24380	0 %	50 %	0 %	50 %	379703948
34	NC_016835	GC	3	6	24722	24727	0 %	0 %	50 %	50 %	379703949
35	NC_016835	AC	3	6	24967	24972	50 %	0 %	0 %	50 %	379703949
36	NC_016835	CA	3	6	25727	25732	50 %	0 %	0 %	50 %	379703949
37	NC_016835	GC	3	6	28796	28801	0 %	0 %	50 %	50 %	379703952
38	NC_016835	CG	3	6	29719	29724	0 %	0 %	50 %	50 %	379703952
39	NC_016835	GC	3	6	29873	29878	0 %	0 %	50 %	50 %	379703952
40	NC_016835	AT	3	6	30634	30639	50 %	50 %	0 %	0 %	379703953
41	NC_016835	TA	3	6	30986	30991	50 %	50 %	0 %	0 %	379703954
42	NC_016835	AT	3	6	32010	32015	50 %	50 %	0 %	0 %	379703956
43	NC_016835	AT	3	6	32328	32333	50 %	50 %	0 %	0 %	379703956
44	NC_016835	AT	3	6	32371	32376	50 %	50 %	0 %	0 %	379703956
45	NC_016835	AC	3	6	33653	33658	50 %	0 %	0 %	50 %	379703957
46	NC_016835	AT	3	6	33691	33696	50 %	50 %	0 %	0 %	379703957
47	NC_016835	CG	3	6	35223	35228	0 %	0 %	50 %	50 %	379703957
48	NC_016835	TG	3	6	35236	35241	0 %	50 %	50 %	0 %	379703957
49	NC_016835	TG	3	6	36258	36263	0 %	50 %	50 %	0 %	379703959
50	NC_016835	AT	3	6	36308	36313	50 %	50 %	0 %	0 %	379703959
51	NC_016835	AC	3	6	36945	36950	50 %	0 %	0 %	50 %	379703960
52	NC_016835	AT	3	6	37906	37911	50 %	50 %	0 %	0 %	379703960
53	NC_016835	TG	3	6	38509	38514	0 %	50 %	50 %	0 %	379703961
54	NC_016835	GC	3	6	38568	38573	0 %	0 %	50 %	50 %	379703961
55	NC_016835	CG	3	6	42218	42223	0 %	0 %	50 %	50 %	379703965
56	NC_016835	CA	3	6	43888	43893	50 %	0 %	0 %	50 %	379703966
57	NC_016835	GC	3	6	44067	44072	0 %	0 %	50 %	50 %	379703966
58	NC_016835	CG	3	6	44157	44162	0 %	0 %	50 %	50 %	379703966
59	NC_016835	CG	3	6	44375	44380	0 %	0 %	50 %	50 %	379703966
60	NC_016835	CG	3	6	44792	44797	0 %	0 %	50 %	50 %	379703967
61	NC_016835	CA	3	6	44846	44851	50 %	0 %	0 %	50 %	379703967
62	NC_016835	GC	3	6	45842	45847	0 %	0 %	50 %	50 %	379703968
63	NC_016835	GC	3	6	46730	46735	0 %	0 %	50 %	50 %	379703969
64	NC_016835	AG	3	6	47577	47582	50 %	0 %	50 %	0 %	379703970
65	NC_016835	GC	3	6	48282	48287	0 %	0 %	50 %	50 %	379703970
66	NC_016835	CG	3	6	48571	48576	0 %	0 %	50 %	50 %	379703971
67	NC_016835	GC	3	6	49576	49581	0 %	0 %	50 %	50 %	379703972
68	NC_016835	GC	3	6	56064	56069	0 %	0 %	50 %	50 %	379703978
69	NC_016835	GC	3	6	56742	56747	0 %	0 %	50 %	50 %	379703979
70	NC_016835	AC	3	6	57297	57302	50 %	0 %	0 %	50 %	379703979
71	NC_016835	AG	3	6	58057	58062	50 %	0 %	50 %	0 %	379703980
72	NC_016835	GT	3	6	58570	58575	0 %	50 %	50 %	0 %	379703980
73	NC_016835	AC	3	6	59050	59055	50 %	0 %	0 %	50 %	379703981
74	NC_016835	GT	3	6	59546	59551	0 %	50 %	50 %	0 %	379703981
75	NC_016835	GC	3	6	60065	60070	0 %	0 %	50 %	50 %	379703982
76	NC_016835	CT	3	6	60375	60380	0 %	50 %	0 %	50 %	379703982
77	NC_016835	CA	3	6	61620	61625	50 %	0 %	0 %	50 %	379703984
78	NC_016835	AT	3	6	63417	63422	50 %	50 %	0 %	0 %	379703985
79	NC_016835	CT	3	6	63939	63944	0 %	50 %	0 %	50 %	379703985
80	NC_016835	AC	3	6	65660	65665	50 %	0 %	0 %	50 %	379703987
81	NC_016835	TG	3	6	65711	65716	0 %	50 %	50 %	0 %	379703987
82	NC_016835	GC	3	6	66311	66316	0 %	0 %	50 %	50 %	379703988
83	NC_016835	TG	3	6	68086	68091	0 %	50 %	50 %	0 %	379703989
84	NC_016835	AC	3	6	68135	68140	50 %	0 %	0 %	50 %	379703989
85	NC_016835	CG	3	6	68377	68382	0 %	0 %	50 %	50 %	379703989
86	NC_016835	CG	3	6	68472	68477	0 %	0 %	50 %	50 %	379703989
87	NC_016835	AG	3	6	69597	69602	50 %	0 %	50 %	0 %	379703990
88	NC_016835	CA	3	6	69655	69660	50 %	0 %	0 %	50 %	379703990
89	NC_016835	TG	3	6	69736	69741	0 %	50 %	50 %	0 %	379703990
90	NC_016835	GT	3	6	69911	69916	0 %	50 %	50 %	0 %	379703990
91	NC_016835	CG	3	6	73147	73152	0 %	0 %	50 %	50 %	379703995
92	NC_016835	CG	3	6	75667	75672	0 %	0 %	50 %	50 %	379703999
93	NC_016835	TC	3	6	75807	75812	0 %	50 %	0 %	50 %	379703999
94	NC_016835	GC	3	6	79419	79424	0 %	0 %	50 %	50 %	379704002
95	NC_016835	GC	3	6	79956	79961	0 %	0 %	50 %	50 %	379704003
96	NC_016835	GC	3	6	80941	80946	0 %	0 %	50 %	50 %	379704004
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99	NC_016835	CT	3	6	84045	84050	0 %	50 %	0 %	50 %	379704007
100	NC_016835	TA	3	6	84147	84152	50 %	50 %	0 %	0 %	379704007
101	NC_016835	CG	3	6	84488	84493	0 %	0 %	50 %	50 %	379704007
102	NC_016835	GC	3	6	84797	84802	0 %	0 %	50 %	50 %	379704008
103	NC_016835	GT	3	6	86089	86094	0 %	50 %	50 %	0 %	379704009
104	NC_016835	TC	3	6	87190	87195	0 %	50 %	0 %	50 %	379704011
105	NC_016835	GT	3	6	87747	87752	0 %	50 %	50 %	0 %	379704011
106	NC_016835	CG	3	6	88040	88045	0 %	0 %	50 %	50 %	379704011
107	NC_016835	GC	5	10	89378	89387	0 %	0 %	50 %	50 %	379704012
108	NC_016835	CG	3	6	89539	89544	0 %	0 %	50 %	50 %	379704013
109	NC_016835	TC	3	6	90566	90571	0 %	50 %	0 %	50 %	379704013
110	NC_016835	AG	3	6	91788	91793	50 %	0 %	50 %	0 %	379704014
111	NC_016835	CG	3	6	91823	91828	0 %	0 %	50 %	50 %	379704014
112	NC_016835	CA	3	6	92030	92035	50 %	0 %	0 %	50 %	379704014
113	NC_016835	CG	3	6	92331	92336	0 %	0 %	50 %	50 %	379704014
114	NC_016835	CA	3	6	92771	92776	50 %	0 %	0 %	50 %	379704015
115	NC_016835	GC	3	6	93157	93162	0 %	0 %	50 %	50 %	379704016
116	NC_016835	AC	3	6	93508	93513	50 %	0 %	0 %	50 %	379704016
117	NC_016835	GA	3	6	93566	93571	50 %	0 %	50 %	0 %	379704016
118	NC_016835	GC	4	8	94748	94755	0 %	0 %	50 %	50 %	379704017
119	NC_016835	CG	3	6	95487	95492	0 %	0 %	50 %	50 %	379704018
120	NC_016835	GT	3	6	95655	95660	0 %	50 %	50 %	0 %	379704018
121	NC_016835	TA	3	6	96144	96149	50 %	50 %	0 %	0 %	379704019
122	NC_016835	AT	3	6	97484	97489	50 %	50 %	0 %	0 %	379704022
123	NC_016835	CA	3	6	98252	98257	50 %	0 %	0 %	50 %	379704023
124	NC_016835	GA	3	6	98778	98783	50 %	0 %	50 %	0 %	379704023
125	NC_016835	TC	3	6	100612	100617	0 %	50 %	0 %	50 %	379704027
126	NC_016835	GC	3	6	101335	101340	0 %	0 %	50 %	50 %	379704027
127	NC_016835	GC	3	6	101455	101460	0 %	0 %	50 %	50 %	379704027
128	NC_016835	GC	3	6	104197	104202	0 %	0 %	50 %	50 %	379704030
129	NC_016835	CA	3	6	104810	104815	50 %	0 %	0 %	50 %	379704031
130	NC_016835	GA	3	6	105592	105597	50 %	0 %	50 %	0 %	379704032
131	NC_016835	AC	4	8	106370	106377	50 %	0 %	0 %	50 %	379704033
132	NC_016835	AT	3	6	108048	108053	50 %	50 %	0 %	0 %	379704034
133	NC_016835	CG	3	6	108448	108453	0 %	0 %	50 %	50 %	379704035
134	NC_016835	CG	3	6	108911	108916	0 %	0 %	50 %	50 %	379704035
135	NC_016835	CG	3	6	109294	109299	0 %	0 %	50 %	50 %	379704035
136	NC_016835	GC	3	6	110373	110378	0 %	0 %	50 %	50 %	379704036
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138	NC_016835	GC	3	6	111950	111955	0 %	0 %	50 %	50 %	379704038
139	NC_016835	CG	4	8	112134	112141	0 %	0 %	50 %	50 %	379704038
140	NC_016835	CG	3	6	112701	112706	0 %	0 %	50 %	50 %	379704038
141	NC_016835	CG	3	6	112987	112992	0 %	0 %	50 %	50 %	379704039
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