MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq201

Total Repeats: 8280

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016835	GC	3	6	229228	229233	0 %	0 %	50 %	50 %	379704139
4002	NC_016835	AGC	2	6	229305	229310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704139
4003	NC_016835	CGG	2	6	229316	229321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704139
4004	NC_016835	CCG	3	9	229351	229359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704139
4005	NC_016835	CTGAC	2	10	229362	229371	20 %	20 %	20 %	40 %	379704139
4006	NC_016835	CCA	2	6	229375	229380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704139
4007	NC_016835	T	6	6	229394	229399	0 %	100 %	0 %	0 %	379704139
4008	NC_016835	CAG	3	9	229444	229452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704140
4009	NC_016835	CAG	2	6	229456	229461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704140
4010	NC_016835	CCG	2	6	229557	229562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704140
4011	NC_016835	CCG	2	6	229595	229600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704140
4012	NC_016835	GCC	2	6	229762	229767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704140
4013	NC_016835	GCA	2	6	229797	229802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704140
4014	NC_016835	ATG	2	6	230021	230026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704140
4015	NC_016835	ATC	2	6	230150	230155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704140
4016	NC_016835	GCC	2	6	230239	230244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704140
4017	NC_016835	GCC	2	6	230269	230274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704140
4018	NC_016835	CG	4	8	230280	230287	0 %	0 %	50 %	50 %	379704140
4019	NC_016835	GCC	2	6	230324	230329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704140
4020	NC_016835	AGC	2	6	230402	230407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704140
4021	NC_016835	CAG	2	6	230413	230418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704140
4022	NC_016835	AAT	2	6	230440	230445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704140
4023	NC_016835	CG	4	8	230469	230476	0 %	0 %	50 %	50 %	379704140
4024	NC_016835	CGG	2	6	230514	230519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704140
4025	NC_016835	TAA	2	6	230556	230561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704140
4026	NC_016835	TTG	2	6	230666	230671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704140
4027	NC_016835	GTC	2	6	230680	230685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704140
4028	NC_016835	AGC	2	6	230759	230764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704140
4029	NC_016835	AAG	2	6	230990	230995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704141
4030	NC_016835	GGC	2	6	231006	231011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704141
4031	NC_016835	TGT	2	6	231084	231089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704141
4032	NC_016835	ATC	2	6	231205	231210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704141
4033	NC_016835	CTG	2	6	231235	231240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704141
4034	NC_016835	GTCA	2	8	231322	231329	25 %	25 %	25 %	25 %	379704141
4035	NC_016835	AGC	2	6	231383	231388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704141
4036	NC_016835	CAG	2	6	231442	231447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704141
4037	NC_016835	GTT	2	6	231562	231567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704141
4038	NC_016835	ATC	2	6	231598	231603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704141
4039	NC_016835	GTT	2	6	231604	231609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704141
4040	NC_016835	CGT	2	6	231681	231686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704141
4041	NC_016835	CGC	2	6	231693	231698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704141
4042	NC_016835	TGCC	2	8	231702	231709	0 %	25 %	25 %	50 %	379704141
4043	NC_016835	GAT	2	6	231715	231720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704141
4044	NC_016835	GCCC	2	8	231769	231776	0 %	0 %	25 %	75 %	379704141
4045	NC_016835	CAA	2	6	231828	231833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704141
4046	NC_016835	CGC	2	6	231862	231867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704141
4047	NC_016835	CAGC	2	8	231897	231904	25 %	0 %	25 %	50 %	379704141
4048	NC_016835	CGC	2	6	231927	231932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704141
4049	NC_016835	CCG	2	6	232007	232012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704141
4050	NC_016835	TCAT	2	8	232064	232071	25 %	50 %	0 %	25 %	379704141
4051	NC_016835	CTG	2	6	232121	232126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704141
4052	NC_016835	CCG	2	6	232140	232145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704141
4053	NC_016835	CCG	2	6	232173	232178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704141
4054	NC_016835	T	6	6	232179	232184	0 %	100 %	0 %	0 %	379704141
4055	NC_016835	CCA	2	6	232209	232214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704141
4056	NC_016835	CTG	2	6	232222	232227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704141
4057	NC_016835	GC	3	6	232243	232248	0 %	0 %	50 %	50 %	379704141
4058	NC_016835	CTG	2	6	232264	232269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704141
4059	NC_016835	GGC	2	6	232300	232305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704141
4060	NC_016835	GCTG	2	8	232363	232370	0 %	25 %	50 %	25 %	379704141
4061	NC_016835	ATC	2	6	232439	232444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704141
4062	NC_016835	GGT	2	6	232729	232734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704142
4063	NC_016835	GAA	2	6	232748	232753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704142
4064	NC_016835	TTA	2	6	232763	232768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704142
4065	NC_016835	CGGG	2	8	232776	232783	0 %	0 %	75 %	25 %	379704142
4066	NC_016835	CCG	2	6	232810	232815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704142
4067	NC_016835	CGG	2	6	232819	232824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704142
4068	NC_016835	TGA	2	6	232852	232857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704142
4069	NC_016835	TGA	2	6	232875	232880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704142
4070	NC_016835	TGA	2	6	232891	232896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704142
4071	NC_016835	GTG	2	6	232952	232957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704142
4072	NC_016835	ATTT	2	8	233013	233020	25 %	75 %	0 %	0 %	379704142
4073	NC_016835	GCC	2	6	233108	233113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704142
4074	NC_016835	TGGCAA	2	12	233118	233129	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379704142
4075	NC_016835	GCTG	2	8	233233	233240	0 %	25 %	50 %	25 %	379704142
4076	NC_016835	GTT	2	6	233290	233295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704142
4077	NC_016835	CTG	2	6	233339	233344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704142
4078	NC_016835	ACC	2	6	233438	233443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704142
4079	NC_016835	TTG	2	6	233460	233465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704142
4080	NC_016835	TAT	2	6	233527	233532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704142
4081	NC_016835	GGCA	2	8	233535	233542	25 %	0 %	50 %	25 %	379704142
4082	NC_016835	CCA	2	6	233562	233567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704142
4083	NC_016835	A	6	6	233860	233865	100 %	0 %	0 %	0 %	379704143
4084	NC_016835	GCT	2	6	233880	233885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704143
4085	NC_016835	CAG	2	6	233889	233894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704143
4086	NC_016835	TGC	2	6	233907	233912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704143
4087	NC_016835	CGG	2	6	233913	233918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704143
4088	NC_016835	TGT	2	6	233922	233927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704143
4089	NC_016835	GCG	2	6	233971	233976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704143
4090	NC_016835	CAA	2	6	234153	234158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704143
4091	NC_016835	GCA	2	6	234180	234185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704143
4092	NC_016835	CAC	2	6	234231	234236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704143
4093	NC_016835	TCG	2	6	234241	234246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704143
4094	NC_016835	GGA	2	6	234261	234266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379704143
4095	NC_016835	TTA	2	6	234270	234275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704143
4096	NC_016835	GGT	2	6	234309	234314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704143
4097	NC_016835	GT	3	6	234365	234370	0 %	50 %	50 %	0 %	379704143
4098	NC_016835	CAA	2	6	234382	234387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704143
4099	NC_016835	GTG	2	6	234462	234467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704143
4100	NC_016835	A	6	6	234484	234489	100 %	0 %	0 %	0 %	379704143
4101	NC_016835	A	6	6	234601	234606	100 %	0 %	0 %	0 %	379704143
4102	NC_016835	GTG	3	9	234661	234669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704143
4103	NC_016835	TTC	2	6	234690	234695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704143
4104	NC_016835	CAC	2	6	234753	234758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704143
4105	NC_016835	ACG	2	6	234817	234822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704143
4106	NC_016835	GCG	2	6	234945	234950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704143
4107	NC_016835	GTCG	2	8	235038	235045	0 %	25 %	50 %	25 %	379704143
4108	NC_016835	GTGGGT	2	12	235132	235143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704143
4109	NC_016835	CTGG	2	8	235194	235201	0 %	25 %	50 %	25 %	379704143
4110	NC_016835	CGG	2	6	235305	235310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704143
4111	NC_016835	ACG	2	6	235331	235336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704143
4112	NC_016835	AGA	2	6	235338	235343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704143
4113	NC_016835	GGC	2	6	235353	235358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704143
4114	NC_016835	ATA	2	6	235415	235420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704143
4115	NC_016835	GCG	2	6	235505	235510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704143
4116	NC_016835	GAC	2	6	235527	235532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704143
4117	NC_016835	CAG	2	6	235539	235544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704143
4118	NC_016835	CTT	2	6	235569	235574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704143
4119	NC_016835	CTT	2	6	235614	235619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704143
4120	NC_016835	CG	3	6	235634	235639	0 %	0 %	50 %	50 %	379704143
4121	NC_016835	CAC	2	6	235659	235664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704143
4122	NC_016835	GAC	2	6	235675	235680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704143
4123	NC_016835	GGCA	2	8	235776	235783	25 %	0 %	50 %	25 %	379704143
4124	NC_016835	GCA	2	6	235787	235792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704143
4125	NC_016835	GGC	2	6	235825	235830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704143
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4127	NC_016835	GCG	2	6	235876	235881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704143
4128	NC_016835	GCA	2	6	235892	235897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704143
4129	NC_016835	TCA	2	6	236003	236008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704143
4130	NC_016835	CAT	2	6	236036	236041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704143
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4135	NC_016835	TTCTG	2	10	236633	236642	0 %	60 %	20 %	20 %	379704144
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4140	NC_016835	CAT	2	6	237400	237405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704145
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4145	NC_016835	GA	3	6	237788	237793	50 %	0 %	50 %	0 %	379704145
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4152	NC_016835	CGGT	2	8	238494	238501	0 %	25 %	50 %	25 %	379704146
4153	NC_016835	TGT	2	6	238504	238509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704146
4154	NC_016835	CCG	2	6	238515	238520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704146
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4217	NC_016835	GTGAAA	2	12	241700	241711	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379704147
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4221	NC_016835	CCTG	2	8	241834	241841	0 %	25 %	25 %	50 %	379704147
4222	NC_016835	TAC	2	6	241850	241855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704147
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4225	NC_016835	ATA	2	6	241959	241964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704147
4226	NC_016835	GAT	3	9	241971	241979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704148
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4228	NC_016835	CTG	2	6	242029	242034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704148
4229	NC_016835	TGC	2	6	242036	242041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704148
4230	NC_016835	T	6	6	242043	242048	0 %	100 %	0 %	0 %	379704148
4231	NC_016835	GCA	2	6	242049	242054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704148
4232	NC_016835	AAC	2	6	242093	242098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704148
4233	NC_016835	TAT	2	6	242130	242135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704148
4234	NC_016835	GGA	2	6	242157	242162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379704148
4235	NC_016835	G	6	6	242193	242198	0 %	0 %	100 %	0 %	379704148
4236	NC_016835	AAG	2	6	242200	242205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704148
4237	NC_016835	AAC	2	6	242305	242310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704148
4238	NC_016835	GC	3	6	242331	242336	0 %	0 %	50 %	50 %	379704148
4239	NC_016835	ATAA	2	8	242338	242345	75 %	25 %	0 %	0 %	379704148
4240	NC_016835	CG	3	6	242428	242433	0 %	0 %	50 %	50 %	379704148
4241	NC_016835	TAT	2	6	242638	242643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704149
4242	NC_016835	CGTA	2	8	242704	242711	25 %	25 %	25 %	25 %	379704149
4243	NC_016835	TAC	2	6	242720	242725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704149
4244	NC_016835	TGCG	2	8	242782	242789	0 %	25 %	50 %	25 %	379704149
4245	NC_016835	CTGG	2	8	242861	242868	0 %	25 %	50 %	25 %	379704149
4246	NC_016835	ACAA	2	8	242880	242887	75 %	0 %	0 %	25 %	379704149
4247	NC_016835	GAC	2	6	242969	242974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704149
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4250	NC_016835	CCG	2	6	243229	243234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704149
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4351	NC_016835	T	6	6	248479	248484	0 %	100 %	0 %	0 %	379704154
4352	NC_016835	GCA	2	6	248508	248513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704155
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4355	NC_016835	CCA	2	6	248571	248576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704155
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4357	NC_016835	GCC	2	6	248620	248625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704155
4358	NC_016835	GC	3	6	248633	248638	0 %	0 %	50 %	50 %	379704155
4359	NC_016835	AGC	2	6	248639	248644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704155
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4361	NC_016835	GGC	2	6	248719	248724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704155
4362	NC_016835	GC	3	6	248723	248728	0 %	0 %	50 %	50 %	379704155
4363	NC_016835	TGT	2	6	248736	248741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704155
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4366	NC_016835	CG	3	6	248805	248810	0 %	0 %	50 %	50 %	379704155
4367	NC_016835	CCGG	2	8	248839	248846	0 %	0 %	50 %	50 %	379704155
4368	NC_016835	TCA	2	6	248856	248861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704155
4369	NC_016835	GCC	2	6	248923	248928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704155
4370	NC_016835	GCG	2	6	248976	248981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704155
4371	NC_016835	TGA	2	6	249095	249100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704155
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4374	NC_016835	TGA	2	6	249351	249356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704156
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4395	NC_016835	GCGCC	2	10	250421	250430	0 %	0 %	40 %	60 %	379704157
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4401	NC_016835	CGG	2	6	250653	250658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704157
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4442	NC_016835	CG	3	6	253830	253835	0 %	0 %	50 %	50 %	379704161
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4470	NC_016835	TGCG	2	8	254871	254878	0 %	25 %	50 %	25 %	379704162
4471	NC_016835	ATG	3	9	254907	254915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704162
4472	NC_016835	CGGCA	2	10	255016	255025	20 %	0 %	40 %	40 %	379704162
4473	NC_016835	GTG	2	6	255051	255056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704162
4474	NC_016835	GGT	2	6	255109	255114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704162
4475	NC_016835	TC	3	6	255226	255231	0 %	50 %	0 %	50 %	379704162
4476	NC_016835	TCACGC	2	12	255440	255451	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379704163
4477	NC_016835	GTT	2	6	255452	255457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704163
4478	NC_016835	ACA	2	6	255473	255478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704163
4479	NC_016835	CTG	2	6	255513	255518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704163
4480	NC_016835	GCTGCG	2	12	255539	255550	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379704163
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4482	NC_016835	CG	3	6	255654	255659	0 %	0 %	50 %	50 %	379704163
4483	NC_016835	TGA	2	6	255697	255702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704163
4484	NC_016835	GCT	2	6	255715	255720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704163
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4486	NC_016835	CGGTAC	2	12	255783	255794	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379704163
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4488	NC_016835	ACG	2	6	255849	255854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704163
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