MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq201

Total Repeats: 8280

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016835	CAT	2	6	176797	176802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704095
3002	NC_016835	TGG	2	6	176820	176825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704095
3003	NC_016835	GCA	2	6	176874	176879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704095
3004	NC_016835	ATG	2	6	176882	176887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704095
3005	NC_016835	AT	3	6	176928	176933	50 %	50 %	0 %	0 %	379704095
3006	NC_016835	CAC	2	6	176962	176967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704095
3007	NC_016835	CAG	2	6	176974	176979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704095
3008	NC_016835	CAG	2	6	176986	176991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704095
3009	NC_016835	CAT	2	6	177010	177015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704095
3010	NC_016835	GCG	2	6	177016	177021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704095
3011	NC_016835	GT	3	6	177072	177077	0 %	50 %	50 %	0 %	379704095
3012	NC_016835	TTG	2	6	177175	177180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704096
3013	NC_016835	CGTT	2	8	177184	177191	0 %	50 %	25 %	25 %	379704096
3014	NC_016835	CGC	2	6	177215	177220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704096
3015	NC_016835	ATT	2	6	177270	177275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704096
3016	NC_016835	AAC	2	6	177289	177294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704096
3017	NC_016835	CAG	2	6	177300	177305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704096
3018	NC_016835	ACC	2	6	177313	177318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704096
3019	NC_016835	GCC	2	6	177327	177332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704096
3020	NC_016835	CA	3	6	177354	177359	50 %	0 %	0 %	50 %	379704096
3021	NC_016835	GC	3	6	177452	177457	0 %	0 %	50 %	50 %	379704096
3022	NC_016835	CGC	2	6	177513	177518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704096
3023	NC_016835	GCC	2	6	177528	177533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704096
3024	NC_016835	GC	3	6	177545	177550	0 %	0 %	50 %	50 %	379704096
3025	NC_016835	CCA	2	6	177581	177586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704096
3026	NC_016835	AGC	2	6	177616	177621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704096
3027	NC_016835	TGA	2	6	177673	177678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704096
3028	NC_016835	GCC	2	6	177690	177695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704096
3029	NC_016835	CGG	2	6	177756	177761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704096
3030	NC_016835	TGG	2	6	177859	177864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704096
3031	NC_016835	CGA	2	6	177878	177883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704096
3032	NC_016835	GGC	2	6	177906	177911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704096
3033	NC_016835	CAG	2	6	177936	177941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704096
3034	NC_016835	CAT	2	6	177945	177950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704096
3035	NC_016835	GAT	2	6	177966	177971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704096
3036	NC_016835	CG	3	6	178033	178038	0 %	0 %	50 %	50 %	379704096
3037	NC_016835	CAC	2	6	178065	178070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704096
3038	NC_016835	CAG	3	9	178074	178082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704096
3039	NC_016835	CAG	2	6	178095	178100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704096
3040	NC_016835	TGC	2	6	178112	178117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704096
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3042	NC_016835	CGC	2	6	178129	178134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704097
3043	NC_016835	CCA	2	6	178186	178191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704097
3044	NC_016835	ATG	2	6	178212	178217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704097
3045	NC_016835	GAC	2	6	178251	178256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704097
3046	NC_016835	CCG	2	6	178309	178314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704097
3047	NC_016835	ATG	3	9	178356	178364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704097
3048	NC_016835	GCCA	2	8	178377	178384	25 %	0 %	25 %	50 %	379704097
3049	NC_016835	CAC	2	6	178394	178399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704097
3050	NC_016835	CCG	2	6	178413	178418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704097
3051	NC_016835	CCG	2	6	178466	178471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704097
3052	NC_016835	ATC	2	6	178478	178483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704097
3053	NC_016835	T	6	6	178499	178504	0 %	100 %	0 %	0 %	379704097
3054	NC_016835	GCTG	2	8	178531	178538	0 %	25 %	50 %	25 %	379704097
3055	NC_016835	TTC	2	6	178601	178606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704097
3056	NC_016835	CGGG	2	8	178643	178650	0 %	0 %	75 %	25 %	379704097
3057	NC_016835	GCC	2	6	178685	178690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704097
3058	NC_016835	CCA	2	6	178744	178749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704097
3059	NC_016835	TCGG	2	8	178806	178813	0 %	25 %	50 %	25 %	379704097
3060	NC_016835	CAT	2	6	178898	178903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704097
3061	NC_016835	CTG	2	6	178913	178918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704097
3062	NC_016835	GTA	2	6	178976	178981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704097
3063	NC_016835	TCG	2	6	179001	179006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704097
3064	NC_016835	CCT	2	6	179038	179043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379704097
3065	NC_016835	TCG	2	6	179109	179114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704097
3066	NC_016835	ACC	2	6	179121	179126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704097
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3068	NC_016835	CGA	2	6	179305	179310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704097
3069	NC_016835	TGA	2	6	179355	179360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704097
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3071	NC_016835	ACA	2	6	179596	179601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704097
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3079	NC_016835	AAT	2	6	180027	180032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704098
3080	NC_016835	CAG	2	6	180057	180062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704098
3081	NC_016835	ATC	2	6	180096	180101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704098
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3084	NC_016835	TGG	2	6	180182	180187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704098
3085	NC_016835	TGGCG	2	10	180192	180201	0 %	20 %	60 %	20 %	379704098
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3088	NC_016835	GGC	2	6	180314	180319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704098
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3090	NC_016835	GTG	3	9	180481	180489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704098
3091	NC_016835	CTG	2	6	180537	180542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704098
3092	NC_016835	TGC	2	6	180555	180560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704098
3093	NC_016835	A	7	7	180564	180570	100 %	0 %	0 %	0 %	379704098
3094	NC_016835	CCA	2	6	180590	180595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704098
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3100	NC_016835	GT	3	6	181271	181276	0 %	50 %	50 %	0 %	379704099
3101	NC_016835	CAT	2	6	181295	181300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704099
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3107	NC_016835	ATGA	2	8	181625	181632	50 %	25 %	25 %	0 %	379704099
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3121	NC_016835	GC	3	6	182485	182490	0 %	0 %	50 %	50 %	379704100
3122	NC_016835	ACC	2	6	182566	182571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704100
3123	NC_016835	TTC	2	6	182596	182601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704100
3124	NC_016835	TCA	2	6	182630	182635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704100
3125	NC_016835	CAT	2	6	182685	182690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704100
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3127	NC_016835	GGC	2	6	182778	182783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704100
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3130	NC_016835	TGA	2	6	182909	182914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704100
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3134	NC_016835	GT	3	6	183017	183022	0 %	50 %	50 %	0 %	379704100
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3145	NC_016835	GC	3	6	183906	183911	0 %	0 %	50 %	50 %	379704101
3146	NC_016835	ATC	2	6	184000	184005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704101
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3153	NC_016835	CCG	2	6	184572	184577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704102
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3213	NC_016835	CGG	2	6	188116	188121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704104
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3217	NC_016835	GC	3	6	188297	188302	0 %	0 %	50 %	50 %	379704104
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3221	NC_016835	CTG	2	6	188387	188392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704104
3222	NC_016835	CCA	2	6	188535	188540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704104
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3224	NC_016835	GCA	2	6	188559	188564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704104
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3232	NC_016835	ACG	2	6	188928	188933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704104
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3238	NC_016835	GGT	2	6	189408	189413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704105
3239	NC_016835	CTGG	2	8	189416	189423	0 %	25 %	50 %	25 %	379704105
3240	NC_016835	AGG	2	6	189431	189436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379704105
3241	NC_016835	CAT	2	6	189449	189454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704105
3242	NC_016835	GCT	2	6	189485	189490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704105
3243	NC_016835	CGC	2	6	189498	189503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704105
3244	NC_016835	TCT	2	6	189504	189509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704105
3245	NC_016835	ATT	2	6	189512	189517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704105
3246	NC_016835	CAC	2	6	189542	189547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704105
3247	NC_016835	CGC	2	6	189592	189597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704105
3248	NC_016835	CTT	2	6	189611	189616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704105
3249	NC_016835	CTG	2	6	189633	189638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704105
3250	NC_016835	GC	3	6	189685	189690	0 %	0 %	50 %	50 %	379704105
3251	NC_016835	CTG	2	6	189702	189707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704105
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3253	NC_016835	CGC	2	6	190015	190020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704105
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3255	NC_016835	GTG	2	6	190120	190125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704105
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3257	NC_016835	CGGCG	2	10	190172	190181	0 %	0 %	60 %	40 %	379704105
3258	NC_016835	CTG	2	6	190183	190188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704105
3259	NC_016835	CGT	2	6	190197	190202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704105
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3262	NC_016835	ATC	2	6	190353	190358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704105
3263	NC_016835	ATC	2	6	190371	190376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704105
3264	NC_016835	ACT	2	6	190399	190404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704105
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3266	NC_016835	ATG	2	6	190561	190566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704105
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3271	NC_016835	CAA	2	6	190784	190789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704105
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3273	NC_016835	GCG	2	6	190896	190901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704105
3274	NC_016835	CGC	2	6	191056	191061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704105
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3283	NC_016835	CAT	2	6	191684	191689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704105
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3302	NC_016835	CTG	2	6	193584	193589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704109
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3331	NC_016835	GCC	2	6	195262	195267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704112
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3350	NC_016835	GCG	2	6	195868	195873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704112
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3353	NC_016835	ATC	2	6	196018	196023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704112
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3355	NC_016835	CGT	2	6	196307	196312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704113
3356	NC_016835	GCC	2	6	196350	196355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704113
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3358	NC_016835	GCT	2	6	196378	196383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704113
3359	NC_016835	GC	3	6	196387	196392	0 %	0 %	50 %	50 %	379704113
3360	NC_016835	GAA	2	6	196424	196429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704113
3361	NC_016835	GC	4	8	196463	196470	0 %	0 %	50 %	50 %	379704113
3362	NC_016835	ATG	2	6	196539	196544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704113
3363	NC_016835	TGG	2	6	196551	196556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704113
3364	NC_016835	GAT	2	6	196570	196575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704113
3365	NC_016835	CGC	3	9	196576	196584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704113
3366	NC_016835	GTT	2	6	196720	196725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704113
3367	NC_016835	GTG	2	6	196745	196750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704113
3368	NC_016835	AAG	2	6	196775	196780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704113
3369	NC_016835	TGT	2	6	196816	196821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704113
3370	NC_016835	CAA	2	6	196834	196839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704113
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3372	NC_016835	GCC	2	6	196895	196900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704113
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3374	NC_016835	GCTG	2	8	197085	197092	0 %	25 %	50 %	25 %	379704113
3375	NC_016835	GT	3	6	197111	197116	0 %	50 %	50 %	0 %	379704113
3376	NC_016835	TGA	2	6	197119	197124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704113
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3382	NC_016835	GC	3	6	197395	197400	0 %	0 %	50 %	50 %	379704114
3383	NC_016835	TGA	2	6	197403	197408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704114
3384	NC_016835	GCA	2	6	197536	197541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704114
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3392	NC_016835	CGC	2	6	198345	198350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704115
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3394	NC_016835	CTG	2	6	198557	198562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704115
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3403	NC_016835	CGG	2	6	199048	199053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704115
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3424	NC_016835	GGCA	2	8	200037	200044	25 %	0 %	50 %	25 %	379704116
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3428	NC_016835	TATT	2	8	200257	200264	25 %	75 %	0 %	0 %	379704116
3429	NC_016835	TGAT	2	8	200331	200338	25 %	50 %	25 %	0 %	379704116
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3432	NC_016835	CG	3	6	200451	200456	0 %	0 %	50 %	50 %	379704116
3433	NC_016835	ACG	2	6	200501	200506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704116
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3435	NC_016835	GCG	2	6	200670	200675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704116
3436	NC_016835	CCGCAT	2	12	200681	200692	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379704116
3437	NC_016835	GC	4	8	200701	200708	0 %	0 %	50 %	50 %	379704116
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3442	NC_016835	ACG	2	6	200871	200876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704116
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3444	NC_016835	CTG	4	12	201145	201156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704117
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3454	NC_016835	TCA	3	9	201791	201799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704117
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3463	NC_016835	TC	3	6	202104	202109	0 %	50 %	0 %	50 %	379704118
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3472	NC_016835	ATC	2	6	202758	202763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704118
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3475	NC_016835	ATG	2	6	202884	202889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704118
3476	NC_016835	TGG	2	6	202896	202901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704118
3477	NC_016835	TGAC	2	8	202994	203001	25 %	25 %	25 %	25 %	379704118
3478	NC_016835	CGGGT	2	10	203127	203136	0 %	20 %	60 %	20 %	379704119
3479	NC_016835	CG	3	6	203152	203157	0 %	0 %	50 %	50 %	379704119
3480	NC_016835	TGCATC	2	12	203162	203173	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379704119
3481	NC_016835	TGC	2	6	203225	203230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704119
3482	NC_016835	GGCGT	2	10	203343	203352	0 %	20 %	60 %	20 %	379704119
3483	NC_016835	CAC	2	6	203356	203361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704119
3484	NC_016835	GTG	2	6	203410	203415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704119
3485	NC_016835	CGG	2	6	203466	203471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704119
3486	NC_016835	CAT	2	6	203484	203489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704119
3487	NC_016835	ATG	2	6	203497	203502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704119
3488	NC_016835	GCT	2	6	203583	203588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704119
3489	NC_016835	CGA	2	6	203589	203594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704119
3490	NC_016835	GCC	2	6	203710	203715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704119
3491	NC_016835	GCA	2	6	203733	203738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704119
3492	NC_016835	CTG	2	6	203755	203760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704119
3493	NC_016835	CCG	2	6	203784	203789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704119
3494	NC_016835	GCTG	2	8	203822	203829	0 %	25 %	50 %	25 %	379704119
3495	NC_016835	AACCTG	2	12	203878	203889	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379704120
3496	NC_016835	A	6	6	203907	203912	100 %	0 %	0 %	0 %	379704120
3497	NC_016835	CGTG	2	8	203943	203950	0 %	25 %	50 %	25 %	379704120
3498	NC_016835	TGG	2	6	203969	203974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704120
3499	NC_016835	CAG	2	6	204061	204066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704120
3500	NC_016835	CGG	2	6	204282	204287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704120

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