MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq201

Total Repeats: 8280

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_016835	TG	3	6	147662	147667	0 %	50 %	50 %	0 %	379704068
2502	NC_016835	TTC	2	6	147916	147921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704068
2503	NC_016835	GTC	2	6	147977	147982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704068
2504	NC_016835	CAT	2	6	147987	147992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704068
2505	NC_016835	GCT	2	6	148023	148028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704068
2506	NC_016835	GTG	2	6	148051	148056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704068
2507	NC_016835	CAC	2	6	148131	148136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704068
2508	NC_016835	CGC	2	6	148184	148189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704068
2509	NC_016835	TGC	2	6	148197	148202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704068
2510	NC_016835	GGC	2	6	148231	148236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704068
2511	NC_016835	TGA	2	6	148301	148306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704068
2512	NC_016835	CGA	2	6	148311	148316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704068
2513	NC_016835	GC	3	6	148333	148338	0 %	0 %	50 %	50 %	379704068
2514	NC_016835	CGG	3	9	148410	148418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704068
2515	NC_016835	GATG	2	8	148455	148462	25 %	25 %	50 %	0 %	379704068
2516	NC_016835	GGC	2	6	148483	148488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704068
2517	NC_016835	GCTG	2	8	148506	148513	0 %	25 %	50 %	25 %	379704068
2518	NC_016835	CAT	2	6	148539	148544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704068
2519	NC_016835	GAA	3	9	148546	148554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704068
2520	NC_016835	GC	3	6	148566	148571	0 %	0 %	50 %	50 %	379704068
2521	NC_016835	GCG	2	6	148627	148632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704068
2522	NC_016835	TGG	2	6	148634	148639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704068
2523	NC_016835	CG	4	8	148645	148652	0 %	0 %	50 %	50 %	379704068
2524	NC_016835	TGG	2	6	148661	148666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704068
2525	NC_016835	CTT	2	6	148700	148705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704068
2526	NC_016835	GCTG	2	8	148857	148864	0 %	25 %	50 %	25 %	379704068
2527	NC_016835	TCAGGC	2	12	149190	149201	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379704069
2528	NC_016835	GGC	2	6	149227	149232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704069
2529	NC_016835	GCA	2	6	149278	149283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704069
2530	NC_016835	GTG	2	6	149371	149376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704069
2531	NC_016835	TGA	2	6	149409	149414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704069
2532	NC_016835	CTGGA	2	10	149431	149440	20 %	20 %	40 %	20 %	379704069
2533	NC_016835	A	6	6	149545	149550	100 %	0 %	0 %	0 %	379704069
2534	NC_016835	CAA	2	6	149555	149560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704069
2535	NC_016835	GCTG	2	8	149646	149653	0 %	25 %	50 %	25 %	379704069
2536	NC_016835	GC	3	6	149709	149714	0 %	0 %	50 %	50 %	379704069
2537	NC_016835	A	6	6	149719	149724	100 %	0 %	0 %	0 %	379704069
2538	NC_016835	TGG	2	6	149752	149757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704069
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2540	NC_016835	CAA	2	6	149961	149966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704069
2541	NC_016835	CCGA	2	8	150010	150017	25 %	0 %	25 %	50 %	379704069
2542	NC_016835	CCG	2	6	150068	150073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704069
2543	NC_016835	TCT	2	6	150160	150165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704069
2544	NC_016835	AGT	2	6	150167	150172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704069
2545	NC_016835	GAA	2	6	150378	150383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704070
2546	NC_016835	CAG	2	6	150385	150390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704070
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2549	NC_016835	TGT	2	6	150472	150477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704070
2550	NC_016835	TTTA	2	8	150853	150860	25 %	75 %	0 %	0 %	379704070
2551	NC_016835	TTG	2	6	150904	150909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704070
2552	NC_016835	CTG	2	6	150945	150950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704070
2553	NC_016835	TGG	2	6	150970	150975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704070
2554	NC_016835	TGC	2	6	150984	150989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704070
2555	NC_016835	CTGG	2	8	151016	151023	0 %	25 %	50 %	25 %	379704070
2556	NC_016835	CCGG	2	8	151032	151039	0 %	0 %	50 %	50 %	379704070
2557	NC_016835	CG	3	6	151041	151046	0 %	0 %	50 %	50 %	379704070
2558	NC_016835	CTG	2	6	151050	151055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704070
2559	NC_016835	TGC	2	6	151069	151074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704070
2560	NC_016835	CTG	2	6	151119	151124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704070
2561	NC_016835	GGT	2	6	151131	151136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704070
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2563	NC_016835	ATC	2	6	151174	151179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704070
2564	NC_016835	CAT	2	6	151229	151234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704070
2565	NC_016835	TCCT	2	8	151249	151256	0 %	50 %	0 %	50 %	379704070
2566	NC_016835	TGA	2	6	151267	151272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704070
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2568	NC_016835	ATG	2	6	151398	151403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704070
2569	NC_016835	TAC	2	6	151413	151418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704070
2570	NC_016835	GCT	2	6	151430	151435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704070
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2572	NC_016835	GAT	2	6	151454	151459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704070
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2575	NC_016835	CAGT	2	8	151523	151530	25 %	25 %	25 %	25 %	379704070
2576	NC_016835	TA	3	6	151552	151557	50 %	50 %	0 %	0 %	379704070
2577	NC_016835	AC	3	6	151624	151629	50 %	0 %	0 %	50 %	379704071
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2579	NC_016835	TGT	2	6	151701	151706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704071
2580	NC_016835	GTTC	2	8	151755	151762	0 %	50 %	25 %	25 %	379704071
2581	NC_016835	CGCTG	2	10	151788	151797	0 %	20 %	40 %	40 %	379704071
2582	NC_016835	CTG	2	6	151850	151855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704071
2583	NC_016835	GTCG	2	8	151903	151910	0 %	25 %	50 %	25 %	379704071
2584	NC_016835	GCG	2	6	151920	151925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704071
2585	NC_016835	GAT	2	6	151969	151974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704071
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2587	NC_016835	GCT	2	6	152029	152034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704071
2588	NC_016835	TGG	2	6	152100	152105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704071
2589	NC_016835	CGC	3	9	152140	152148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704071
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2591	NC_016835	CGA	2	6	152251	152256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704071
2592	NC_016835	GTG	3	9	152258	152266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704071
2593	NC_016835	CGACC	2	10	152338	152347	20 %	0 %	20 %	60 %	379704071
2594	NC_016835	TGCGGC	2	12	152350	152361	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379704071
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2598	NC_016835	CA	3	6	152449	152454	50 %	0 %	0 %	50 %	379704071
2599	NC_016835	A	7	7	152564	152570	100 %	0 %	0 %	0 %	379704072
2600	NC_016835	ATCTGG	2	12	152715	152726	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379704072
2601	NC_016835	GAT	2	6	152758	152763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704072
2602	NC_016835	CGG	2	6	152776	152781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704072
2603	NC_016835	CGG	2	6	152833	152838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704072
2604	NC_016835	ATT	2	6	152926	152931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704072
2605	NC_016835	TGA	2	6	152932	152937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704072
2606	NC_016835	GCA	2	6	152955	152960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704072
2607	NC_016835	GCA	2	6	152985	152990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704072
2608	NC_016835	GCG	2	6	153032	153037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704072
2609	NC_016835	TTCT	2	8	153129	153136	0 %	75 %	0 %	25 %	379704072
2610	NC_016835	TCG	2	6	153153	153158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704072
2611	NC_016835	GAA	2	6	153194	153199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704072
2612	NC_016835	TCGCT	2	10	153201	153210	0 %	40 %	20 %	40 %	379704072
2613	NC_016835	CGG	2	6	153271	153276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704072
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2986	NC_016835	CAG	2	6	176203	176208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704095
2987	NC_016835	AAT	2	6	176227	176232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704095
2988	NC_016835	TGC	2	6	176244	176249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704095
2989	NC_016835	CCG	2	6	176255	176260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704095
2990	NC_016835	CGC	2	6	176271	176276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704095
2991	NC_016835	CAG	2	6	176353	176358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704095
2992	NC_016835	CCG	2	6	176361	176366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704095
2993	NC_016835	CACC	2	8	176382	176389	25 %	0 %	0 %	75 %	379704095
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2995	NC_016835	GCG	2	6	176473	176478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704095
2996	NC_016835	AAATA	2	10	176504	176513	80 %	20 %	0 %	0 %	379704095
2997	NC_016835	CAG	2	6	176623	176628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704095
2998	NC_016835	AGA	2	6	176680	176685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704095
2999	NC_016835	CAG	2	6	176704	176709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704095
3000	NC_016835	CAA	2	6	176728	176733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704095

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