MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq201

Total Repeats: 8280

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016835	GTA	2	6	84399	84404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704007
1502	NC_016835	TGT	2	6	84440	84445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704007
1503	NC_016835	CG	3	6	84488	84493	0 %	0 %	50 %	50 %	379704007
1504	NC_016835	GGT	2	6	84520	84525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704007
1505	NC_016835	TTATT	2	10	84545	84554	20 %	80 %	0 %	0 %	379704008
1506	NC_016835	TCA	2	6	84607	84612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704008
1507	NC_016835	GCACCA	2	12	84628	84639	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	379704008
1508	NC_016835	CTT	2	6	84760	84765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704008
1509	NC_016835	GC	3	6	84797	84802	0 %	0 %	50 %	50 %	379704008
1510	NC_016835	CAC	2	6	84830	84835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704008
1511	NC_016835	TTC	2	6	84836	84841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704008
1512	NC_016835	CAA	2	6	84868	84873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704008
1513	NC_016835	CAT	2	6	84887	84892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704008
1514	NC_016835	TCT	2	6	84981	84986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704009
1515	NC_016835	TCT	3	9	84993	85001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704009
1516	NC_016835	AAT	2	6	85004	85009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704009
1517	NC_016835	CGA	2	6	85081	85086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704009
1518	NC_016835	TGC	2	6	85099	85104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704009
1519	NC_016835	AAG	2	6	85116	85121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704009
1520	NC_016835	CGC	2	6	85190	85195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704009
1521	NC_016835	GAT	2	6	85336	85341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704009
1522	NC_016835	GAT	2	6	85370	85375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704009
1523	NC_016835	ATG	2	6	85407	85412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704009
1524	NC_016835	CCG	2	6	85465	85470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704009
1525	NC_016835	ATG	2	6	85527	85532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704009
1526	NC_016835	GCC	2	6	85632	85637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704009
1527	NC_016835	ATA	2	6	85659	85664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704009
1528	NC_016835	TGG	2	6	85668	85673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704009
1529	NC_016835	AAT	2	6	85727	85732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704009
1530	NC_016835	AGA	2	6	85769	85774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704009
1531	NC_016835	GCG	2	6	85808	85813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704009
1532	NC_016835	ACC	2	6	85839	85844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704009
1533	NC_016835	ATA	2	6	85866	85871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704009
1534	NC_016835	CGCCC	2	10	85874	85883	0 %	0 %	20 %	80 %	379704009
1535	NC_016835	TAA	2	6	85955	85960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704009
1536	NC_016835	CGG	2	6	85963	85968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704009
1537	NC_016835	TTC	2	6	85988	85993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704009
1538	NC_016835	ATGCC	2	10	85999	86008	20 %	20 %	20 %	40 %	379704009
1539	NC_016835	ATA	2	6	86034	86039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704009
1540	NC_016835	GT	3	6	86089	86094	0 %	50 %	50 %	0 %	379704009
1541	NC_016835	AGAA	2	8	86134	86141	75 %	0 %	25 %	0 %	379704009
1542	NC_016835	TTA	2	6	86166	86171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704009
1543	NC_016835	TGA	2	6	86215	86220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704009
1544	NC_016835	GAA	2	6	86275	86280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704009
1545	NC_016835	GCT	3	9	86444	86452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704010
1546	NC_016835	T	6	6	86452	86457	0 %	100 %	0 %	0 %	379704010
1547	NC_016835	CGC	2	6	86461	86466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704010
1548	NC_016835	AATC	2	8	86517	86524	50 %	25 %	0 %	25 %	379704010
1549	NC_016835	T	6	6	86551	86556	0 %	100 %	0 %	0 %	379704010
1550	NC_016835	CAG	2	6	86590	86595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704010
1551	NC_016835	CGG	2	6	86622	86627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704010
1552	NC_016835	AAT	2	6	86650	86655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704010
1553	NC_016835	CAG	2	6	86701	86706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704010
1554	NC_016835	CGG	2	6	86721	86726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704010
1555	NC_016835	AACAA	2	10	86727	86736	80 %	0 %	0 %	20 %	379704010
1556	NC_016835	CTTT	2	8	86745	86752	0 %	75 %	0 %	25 %	379704010
1557	NC_016835	AAT	2	6	87119	87124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704011
1558	NC_016835	AAAT	2	8	87126	87133	75 %	25 %	0 %	0 %	379704011
1559	NC_016835	GGC	2	6	87181	87186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704011
1560	NC_016835	TC	3	6	87190	87195	0 %	50 %	0 %	50 %	379704011
1561	NC_016835	CGG	2	6	87307	87312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704011
1562	NC_016835	CGT	2	6	87343	87348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704011
1563	NC_016835	CAA	3	9	87361	87369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704011
1564	NC_016835	CGCGG	2	10	87409	87418	0 %	0 %	60 %	40 %	379704011
1565	NC_016835	TGT	2	6	87432	87437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704011
1566	NC_016835	TCA	2	6	87526	87531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704011
1567	NC_016835	GGT	2	6	87574	87579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704011
1568	NC_016835	TCG	2	6	87712	87717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704011
1569	NC_016835	GT	3	6	87747	87752	0 %	50 %	50 %	0 %	379704011
1570	NC_016835	AAG	2	6	87780	87785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704011
1571	NC_016835	CAT	2	6	87868	87873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704011
1572	NC_016835	GAT	2	6	87941	87946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704011
1573	NC_016835	GCC	2	6	87980	87985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704011
1574	NC_016835	CG	3	6	88040	88045	0 %	0 %	50 %	50 %	379704011
1575	NC_016835	A	9	9	88676	88684	100 %	0 %	0 %	0 %	379704012
1576	NC_016835	ATG	2	6	88741	88746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704012
1577	NC_016835	TAT	2	6	88839	88844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704012
1578	NC_016835	GCC	2	6	88846	88851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704012
1579	NC_016835	GAA	2	6	88954	88959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704012
1580	NC_016835	TCCG	2	8	89021	89028	0 %	25 %	25 %	50 %	379704012
1581	NC_016835	ATC	2	6	89081	89086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704012
1582	NC_016835	GAA	2	6	89176	89181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704012
1583	NC_016835	TTC	2	6	89200	89205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704012
1584	NC_016835	CGG	2	6	89256	89261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704012
1585	NC_016835	AGC	2	6	89333	89338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704012
1586	NC_016835	GC	5	10	89378	89387	0 %	0 %	50 %	50 %	379704012
1587	NC_016835	CGT	2	6	89466	89471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704013
1588	NC_016835	GGCTG	2	10	89485	89494	0 %	20 %	60 %	20 %	379704013
1589	NC_016835	TGA	2	6	89501	89506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704013
1590	NC_016835	CG	3	6	89539	89544	0 %	0 %	50 %	50 %	379704013
1591	NC_016835	GGC	2	6	89554	89559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704013
1592	NC_016835	GAA	2	6	89572	89577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704013
1593	NC_016835	CGG	2	6	89594	89599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704013
1594	NC_016835	GCC	2	6	89650	89655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704013
1595	NC_016835	CTGCC	2	10	89684	89693	0 %	20 %	20 %	60 %	379704013
1596	NC_016835	G	6	6	89733	89738	0 %	0 %	100 %	0 %	379704013
1597	NC_016835	CGG	2	6	89756	89761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704013
1598	NC_016835	CCGA	2	8	89779	89786	25 %	0 %	25 %	50 %	379704013
1599	NC_016835	CTGC	2	8	90004	90011	0 %	25 %	25 %	50 %	379704013
1600	NC_016835	CAG	2	6	90030	90035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704013
1601	NC_016835	ACT	2	6	90146	90151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704013
1602	NC_016835	ACT	2	6	90182	90187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704013
1603	NC_016835	CGC	2	6	90197	90202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704013
1604	NC_016835	GGAT	2	8	90230	90237	25 %	25 %	50 %	0 %	379704013
1605	NC_016835	GAC	2	6	90286	90291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704013
1606	NC_016835	GTG	2	6	90361	90366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704013
1607	NC_016835	AGC	2	6	90370	90375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704013
1608	NC_016835	TGC	2	6	90401	90406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704013
1609	NC_016835	GAA	2	6	90442	90447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704013
1610	NC_016835	CGG	2	6	90483	90488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704013
1611	NC_016835	TTC	2	6	90499	90504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704013
1612	NC_016835	TC	3	6	90566	90571	0 %	50 %	0 %	50 %	379704013
1613	NC_016835	CGG	2	6	90606	90611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704013
1614	NC_016835	AAG	2	6	90698	90703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704013
1615	NC_016835	GAA	2	6	90709	90714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704013
1616	NC_016835	CAC	3	9	90744	90752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704013
1617	NC_016835	ATCT	2	8	90772	90779	25 %	50 %	0 %	25 %	379704013
1618	NC_016835	GCT	2	6	90819	90824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704013
1619	NC_016835	GAAC	2	8	90849	90856	50 %	0 %	25 %	25 %	379704013
1620	NC_016835	GCA	2	6	90864	90869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704013
1621	NC_016835	TCG	2	6	90884	90889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704013
1622	NC_016835	TGACC	2	10	90957	90966	20 %	20 %	20 %	40 %	379704013
1623	NC_016835	GCG	2	6	90992	90997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704013
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1625	NC_016835	CCGA	2	8	91114	91121	25 %	0 %	25 %	50 %	379704013
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1865	NC_016835	GCA	2	6	105516	105521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704032
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1993	NC_016835	GGT	2	6	112183	112188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704038
1994	NC_016835	GCC	2	6	112282	112287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704038
1995	NC_016835	ATC	2	6	112309	112314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704038
1996	NC_016835	ATG	2	6	112352	112357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704038
1997	NC_016835	CGC	2	6	112368	112373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704038
1998	NC_016835	CG	3	6	112701	112706	0 %	0 %	50 %	50 %	379704038
1999	NC_016835	GCCAGC	2	12	112850	112861	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379704038
2000	NC_016835	ATG	2	6	112904	112909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704038

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