MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq201

Total Repeats: 8280

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016835	GGTCA	2	10	57440	57449	20 %	20 %	40 %	20 %	379703979
1002	NC_016835	AGC	2	6	57477	57482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703979
1003	NC_016835	AGA	2	6	57486	57491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703979
1004	NC_016835	ATT	2	6	57623	57628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703980
1005	NC_016835	CCG	2	6	57629	57634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703980
1006	NC_016835	CTG	2	6	57714	57719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703980
1007	NC_016835	GGC	2	6	57765	57770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703980
1008	NC_016835	CAGT	2	8	57816	57823	25 %	25 %	25 %	25 %	379703980
1009	NC_016835	GCC	2	6	57907	57912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703980
1010	NC_016835	TGG	2	6	57932	57937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379703980
1011	NC_016835	AGG	2	6	58007	58012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379703980
1012	NC_016835	ACA	2	6	58040	58045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703980
1013	NC_016835	AG	3	6	58057	58062	50 %	0 %	50 %	0 %	379703980
1014	NC_016835	CTG	2	6	58066	58071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703980
1015	NC_016835	CAG	2	6	58100	58105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703980
1016	NC_016835	GCTG	2	8	58106	58113	0 %	25 %	50 %	25 %	379703980
1017	NC_016835	CTGAAA	2	12	58177	58188	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379703980
1018	NC_016835	GAC	2	6	58207	58212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703980
1019	NC_016835	CCG	2	6	58215	58220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703980
1020	NC_016835	TGA	2	6	58262	58267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703980
1021	NC_016835	CGA	2	6	58293	58298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703980
1022	NC_016835	GAA	2	6	58348	58353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703980
1023	NC_016835	GAC	2	6	58366	58371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703980
1024	NC_016835	CAT	2	6	58446	58451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703980
1025	NC_016835	GTG	2	6	58486	58491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379703980
1026	NC_016835	TGCC	2	8	58500	58507	0 %	25 %	25 %	50 %	379703980
1027	NC_016835	GCG	2	6	58514	58519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703980
1028	NC_016835	GCC	2	6	58549	58554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703980
1029	NC_016835	GT	3	6	58570	58575	0 %	50 %	50 %	0 %	379703980
1030	NC_016835	GCG	2	6	58586	58591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703980
1031	NC_016835	ACA	2	6	58611	58616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703980
1032	NC_016835	TGAT	2	8	58625	58632	25 %	50 %	25 %	0 %	379703980
1033	NC_016835	GTCG	2	8	58779	58786	0 %	25 %	50 %	25 %	379703980
1034	NC_016835	GAT	2	6	58843	58848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703981
1035	NC_016835	CCA	2	6	58861	58866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379703981
1036	NC_016835	T	6	6	58936	58941	0 %	100 %	0 %	0 %	379703981
1037	NC_016835	GAA	2	6	58954	58959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703981
1038	NC_016835	GCTG	2	8	59028	59035	0 %	25 %	50 %	25 %	379703981
1039	NC_016835	AC	3	6	59050	59055	50 %	0 %	0 %	50 %	379703981
1040	NC_016835	GCT	2	6	59137	59142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703981
1041	NC_016835	TCA	2	6	59155	59160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703981
1042	NC_016835	TGGC	2	8	59189	59196	0 %	25 %	50 %	25 %	379703981
1043	NC_016835	GCG	2	6	59363	59368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703981
1044	NC_016835	GAA	2	6	59374	59379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703981
1045	NC_016835	GGC	2	6	59395	59400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703981
1046	NC_016835	GCT	2	6	59431	59436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703981
1047	NC_016835	G	7	7	59452	59458	0 %	0 %	100 %	0 %	379703981
1048	NC_016835	GT	3	6	59546	59551	0 %	50 %	50 %	0 %	379703981
1049	NC_016835	GCAG	2	8	59623	59630	25 %	0 %	50 %	25 %	379703981
1050	NC_016835	GGC	2	6	59639	59644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703981
1051	NC_016835	TGA	2	6	59680	59685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703981
1052	NC_016835	ATCTGC	2	12	59686	59697	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379703981
1053	NC_016835	GTG	2	6	59706	59711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379703982
1054	NC_016835	GCG	2	6	59742	59747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703982
1055	NC_016835	GAA	2	6	59766	59771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703982
1056	NC_016835	ATC	2	6	59787	59792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703982
1057	NC_016835	ACTG	2	8	59861	59868	25 %	25 %	25 %	25 %	379703982
1058	NC_016835	CGA	2	6	59876	59881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703982
1059	NC_016835	GGC	2	6	59894	59899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703982
1060	NC_016835	ATT	2	6	60028	60033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379703982
1061	NC_016835	GC	3	6	60065	60070	0 %	0 %	50 %	50 %	379703982
1062	NC_016835	GGC	2	6	60153	60158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703982
1063	NC_016835	GCG	2	6	60186	60191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703982
1064	NC_016835	CGG	2	6	60229	60234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703982
1065	NC_016835	CGC	2	6	60244	60249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703982
1066	NC_016835	GAA	2	6	60285	60290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703982
1067	NC_016835	CAA	2	6	60297	60302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703982
1068	NC_016835	AGC	2	6	60325	60330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703982
1069	NC_016835	CGC	2	6	60340	60345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703982
1070	NC_016835	GTG	2	6	60363	60368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379703982
1071	NC_016835	CT	3	6	60375	60380	0 %	50 %	0 %	50 %	379703982
1072	NC_016835	CAC	2	6	60395	60400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379703982
1073	NC_016835	CGG	2	6	60422	60427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703982
1074	NC_016835	CGC	2	6	60461	60466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703983
1075	NC_016835	GAA	2	6	60509	60514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379703983
1076	NC_016835	TGA	2	6	60612	60617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703983
1077	NC_016835	CGC	2	6	60662	60667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703983
1078	NC_016835	GGA	2	6	60673	60678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379703983
1079	NC_016835	CGCC	2	8	60738	60745	0 %	0 %	25 %	75 %	379703983
1080	NC_016835	GTGG	2	8	60754	60761	0 %	25 %	75 %	0 %	379703983
1081	NC_016835	T	6	6	60774	60779	0 %	100 %	0 %	0 %	379703983
1082	NC_016835	ACTG	2	8	60781	60788	25 %	25 %	25 %	25 %	379703983
1083	NC_016835	AGT	2	6	60795	60800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703983
1084	NC_016835	ACA	2	6	61088	61093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703984
1085	NC_016835	GCGCA	2	10	61126	61135	20 %	0 %	40 %	40 %	379703984
1086	NC_016835	ACG	2	6	61138	61143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703984
1087	NC_016835	CAC	2	6	61173	61178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379703984
1088	NC_016835	GCT	2	6	61209	61214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703984
1089	NC_016835	GCC	2	6	61282	61287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703984
1090	NC_016835	ATC	2	6	61306	61311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703984
1091	NC_016835	CTGC	2	8	61315	61322	0 %	25 %	25 %	50 %	379703984
1092	NC_016835	TTC	2	6	61327	61332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379703984
1093	NC_016835	TGT	2	6	61397	61402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703984
1094	NC_016835	CGC	2	6	61410	61415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703984
1095	NC_016835	GCAG	2	8	61420	61427	25 %	0 %	50 %	25 %	379703984
1096	NC_016835	GTT	2	6	61449	61454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379703984
1097	NC_016835	CCG	2	6	61487	61492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703984
1098	NC_016835	CCGG	2	8	61522	61529	0 %	0 %	50 %	50 %	379703984
1099	NC_016835	CGC	2	6	61537	61542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379703984
1100	NC_016835	GGT	2	6	61597	61602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379703984
1101	NC_016835	TTC	2	6	61609	61614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379703984
1102	NC_016835	CA	3	6	61620	61625	50 %	0 %	0 %	50 %	379703984
1103	NC_016835	CAC	2	6	61629	61634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379703984
1104	NC_016835	GACG	2	8	61635	61642	25 %	0 %	50 %	25 %	379703984
1105	NC_016835	TGC	2	6	61688	61693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703984
1106	NC_016835	GCA	2	6	61782	61787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379703984
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1108	NC_016835	TTC	2	6	61819	61824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379703984
1109	NC_016835	TTC	2	6	61855	61860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379703984
1110	NC_016835	ACC	2	6	61870	61875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379703984
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1112	NC_016835	CTG	2	6	61915	61920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703984
1113	NC_016835	TTC	2	6	61954	61959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379703984
1114	NC_016835	GCT	2	6	61995	62000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379703984
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1116	NC_016835	CAT	2	6	62013	62018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379703984
1117	NC_016835	TGTGC	2	10	62025	62034	0 %	40 %	40 %	20 %	379703984
1118	NC_016835	GTG	2	6	62038	62043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379703984
1119	NC_016835	TGG	2	6	62078	62083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379703984
1120	NC_016835	TCT	2	6	62090	62095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379703984
1121	NC_016835	CAAA	2	8	62148	62155	75 %	0 %	0 %	25 %	379703984
1122	NC_016835	TGA	2	6	62174	62179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379703984
1123	NC_016835	ACA	2	6	62240	62245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379703984
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1125	NC_016835	GCG	2	6	62320	62325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379703984
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