MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq201

Total Repeats: 8280

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_016835	CGA	2	6	447772	447777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704326
8002	NC_016835	GGC	2	6	447891	447896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704326
8003	NC_016835	ATT	2	6	447900	447905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704326
8004	NC_016835	TCA	2	6	447912	447917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704326
8005	NC_016835	CTTG	2	8	448013	448020	0 %	50 %	25 %	25 %	379704326
8006	NC_016835	GAA	2	6	448071	448076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704326
8007	NC_016835	AGC	2	6	448097	448102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704326
8008	NC_016835	CGC	2	6	448181	448186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704326
8009	NC_016835	GCCGG	2	10	448203	448212	0 %	0 %	60 %	40 %	379704326
8010	NC_016835	TTGA	2	8	448242	448249	25 %	50 %	25 %	0 %	379704326
8011	NC_016835	CGG	2	6	448250	448255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704326
8012	NC_016835	ATA	2	6	448422	448427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704327
8013	NC_016835	ATACAG	2	12	448460	448471	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379704327
8014	NC_016835	TCA	2	6	448611	448616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704327
8015	NC_016835	GCA	2	6	448687	448692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704327
8016	NC_016835	GTG	2	6	448831	448836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704327
8017	NC_016835	GCG	2	6	448868	448873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704327
8018	NC_016835	TGC	2	6	448926	448931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704327
8019	NC_016835	CGG	2	6	449010	449015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704327
8020	NC_016835	T	7	7	449092	449098	0 %	100 %	0 %	0 %	379704327
8021	NC_016835	AGTAG	2	10	449146	449155	40 %	20 %	40 %	0 %	379704327
8022	NC_016835	TCA	2	6	449169	449174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704327
8023	NC_016835	TGC	3	9	449430	449438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704328
8024	NC_016835	CCGA	2	8	449503	449510	25 %	0 %	25 %	50 %	379704328
8025	NC_016835	CAGT	2	8	449540	449547	25 %	25 %	25 %	25 %	379704328
8026	NC_016835	TCA	2	6	449571	449576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704328
8027	NC_016835	CAG	2	6	449704	449709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704328
8028	NC_016835	TCA	2	6	449727	449732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704328
8029	NC_016835	ATG	3	9	449776	449784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704328
8030	NC_016835	ACCTG	2	10	449786	449795	20 %	20 %	20 %	40 %	379704328
8031	NC_016835	GCC	2	6	449798	449803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704328
8032	NC_016835	GGT	2	6	449830	449835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704328
8033	NC_016835	CGC	2	6	449836	449841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704328
8034	NC_016835	CGG	2	6	449852	449857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704328
8035	NC_016835	CTT	2	6	449898	449903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704328
8036	NC_016835	GGC	2	6	450095	450100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704329
8037	NC_016835	TTTG	2	8	450197	450204	0 %	75 %	25 %	0 %	379704329
8038	NC_016835	ATCA	2	8	450206	450213	50 %	25 %	0 %	25 %	379704329
8039	NC_016835	GCT	2	6	450296	450301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704329
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8041	NC_016835	TGA	2	6	450339	450344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704329
8042	NC_016835	CGG	2	6	450401	450406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704329
8043	NC_016835	TGC	2	6	450453	450458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704329
8044	NC_016835	ATT	3	9	450479	450487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704329
8045	NC_016835	GA	3	6	450545	450550	50 %	0 %	50 %	0 %	379704329
8046	NC_016835	CAT	2	6	450599	450604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704329
8047	NC_016835	AAGGA	2	10	450607	450616	60 %	0 %	40 %	0 %	379704329
8048	NC_016835	AAT	3	9	450617	450625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704329
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8051	NC_016835	CGT	2	6	451063	451068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704329
8052	NC_016835	GT	3	6	451190	451195	0 %	50 %	50 %	0 %	379704329
8053	NC_016835	T	7	7	451195	451201	0 %	100 %	0 %	0 %	379704329
8054	NC_016835	CGC	2	6	451264	451269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704329
8055	NC_016835	GCC	2	6	451385	451390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704329
8056	NC_016835	TGA	2	6	451528	451533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704329
8057	NC_016835	CG	3	6	451536	451541	0 %	0 %	50 %	50 %	379704329
8058	NC_016835	T	6	6	451584	451589	0 %	100 %	0 %	0 %	379704329
8059	NC_016835	AGC	2	6	451628	451633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704329
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8061	NC_016835	CGG	2	6	451704	451709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704329
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8064	NC_016835	A	7	7	451773	451779	100 %	0 %	0 %	0 %	379704329
8065	NC_016835	ATTA	2	8	451794	451801	50 %	50 %	0 %	0 %	379704329
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8070	NC_016835	CGG	2	6	452176	452181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704330
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8072	NC_016835	ACA	2	6	452314	452319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704331
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8074	NC_016835	TCGG	2	8	452563	452570	0 %	25 %	50 %	25 %	379704332
8075	NC_016835	CCAG	2	8	452657	452664	25 %	0 %	25 %	50 %	379704332
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8080	NC_016835	TCTGC	2	10	452873	452882	0 %	40 %	20 %	40 %	379704332
8081	NC_016835	AT	3	6	452885	452890	50 %	50 %	0 %	0 %	379704332
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8087	NC_016835	AAT	2	6	453005	453010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704332
8088	NC_016835	GCCC	2	8	453055	453062	0 %	0 %	25 %	75 %	379704332
8089	NC_016835	TGC	2	6	453132	453137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704332
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8105	NC_016835	CTT	2	6	453812	453817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704332
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8111	NC_016835	ACGG	2	8	454261	454268	25 %	0 %	50 %	25 %	379704332
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8119	NC_016835	TTGTT	2	10	454606	454615	0 %	80 %	20 %	0 %	379704332
8120	NC_016835	TC	3	6	454775	454780	0 %	50 %	0 %	50 %	379704333
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8122	NC_016835	GAC	2	6	454831	454836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704333
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8124	NC_016835	ATG	2	6	454863	454868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704333
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8131	NC_016835	TCA	2	6	455292	455297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704334
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8141	NC_016835	CTG	2	6	455792	455797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704334
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8151	NC_016835	AT	3	6	456471	456476	50 %	50 %	0 %	0 %	379704334
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8233	NC_016835	CAGG	2	8	461264	461271	25 %	0 %	50 %	25 %	379704338
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8237	NC_016835	GTG	2	6	461456	461461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704338
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8241	NC_016835	TCA	2	6	461749	461754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704339
8242	NC_016835	CGA	2	6	461815	461820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704339
8243	NC_016835	ACAG	2	8	461946	461953	50 %	0 %	25 %	25 %	379704339
8244	NC_016835	CAG	2	6	462096	462101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704339
8245	NC_016835	GCTG	2	8	462154	462161	0 %	25 %	50 %	25 %	379704339
8246	NC_016835	GAC	3	9	462219	462227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704339
8247	NC_016835	CTG	2	6	462240	462245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704339
8248	NC_016835	TGA	2	6	462347	462352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704339
8249	NC_016835	GCA	2	6	462356	462361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704339
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8253	NC_016835	GCT	2	6	462542	462547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704339
8254	NC_016835	CAGGG	2	10	462569	462578	20 %	0 %	60 %	20 %	379704339
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8271	NC_016835	AAC	2	6	463472	463477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704340
8272	NC_016835	TTC	2	6	463537	463542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704340
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8275	NC_016835	ACG	2	6	463617	463622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704340
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8280	NC_016835	ACC	2	6	463820	463825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704340

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