MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq201

Total Repeats: 8280

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016835	CAG	2	6	282324	282329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704186
5002	NC_016835	AAG	2	6	282457	282462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704186
5003	NC_016835	A	6	6	282489	282494	100 %	0 %	0 %	0 %	379704186
5004	NC_016835	CGC	2	6	282519	282524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704186
5005	NC_016835	ATCCA	2	10	282526	282535	40 %	20 %	0 %	40 %	379704186
5006	NC_016835	AGG	2	6	282569	282574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379704186
5007	NC_016835	ATCTGG	2	12	282689	282700	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379704186
5008	NC_016835	GGC	2	6	282819	282824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704186
5009	NC_016835	GGC	2	6	282897	282902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704186
5010	NC_016835	CA	3	6	282915	282920	50 %	0 %	0 %	50 %	379704186
5011	NC_016835	ATGA	2	8	282976	282983	50 %	25 %	25 %	0 %	379704186
5012	NC_016835	CTG	2	6	282988	282993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704186
5013	NC_016835	GC	3	6	283011	283016	0 %	0 %	50 %	50 %	379704186
5014	NC_016835	TGC	2	6	283053	283058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704186
5015	NC_016835	CAG	2	6	283090	283095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704186
5016	NC_016835	GAA	2	6	283108	283113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704186
5017	NC_016835	GGC	2	6	283188	283193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704186
5018	NC_016835	GTG	2	6	283228	283233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704186
5019	NC_016835	GTG	2	6	283240	283245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704186
5020	NC_016835	TCG	2	6	283283	283288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704186
5021	NC_016835	GTG	2	6	283393	283398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704186
5022	NC_016835	GCC	2	6	283438	283443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704186
5023	NC_016835	CGA	2	6	283464	283469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704186
5024	NC_016835	CCA	2	6	283520	283525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704186
5025	NC_016835	GTG	2	6	283534	283539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704186
5026	NC_016835	TGAC	2	8	283556	283563	25 %	25 %	25 %	25 %	379704186
5027	NC_016835	CAA	2	6	283620	283625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704186
5028	NC_016835	GATG	2	8	283638	283645	25 %	25 %	50 %	0 %	379704186
5029	NC_016835	CAG	2	6	283654	283659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704186
5030	NC_016835	CGC	2	6	283662	283667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704186
5031	NC_016835	CTT	2	6	283682	283687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704186
5032	NC_016835	CGG	2	6	283688	283693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704186
5033	NC_016835	TGA	3	9	283992	284000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704187
5034	NC_016835	GGC	3	9	284029	284037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704187
5035	NC_016835	GCG	2	6	284063	284068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704187
5036	NC_016835	CAG	2	6	284105	284110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704187
5037	NC_016835	GCG	2	6	284117	284122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704187
5038	NC_016835	GCG	2	6	284136	284141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704187
5039	NC_016835	GTC	2	6	284142	284147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704187
5040	NC_016835	TGA	2	6	284200	284205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704187
5041	NC_016835	GCA	2	6	284220	284225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704187
5042	NC_016835	A	6	6	284306	284311	100 %	0 %	0 %	0 %	379704187
5043	NC_016835	GCT	3	9	284381	284389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704187
5044	NC_016835	ATA	2	6	284406	284411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704187
5045	NC_016835	GGC	2	6	284441	284446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704187
5046	NC_016835	ACC	2	6	284552	284557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704187
5047	NC_016835	GCTG	2	8	284608	284615	0 %	25 %	50 %	25 %	379704187
5048	NC_016835	TGG	2	6	284634	284639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704187
5049	NC_016835	ACC	2	6	284657	284662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704187
5050	NC_016835	CTGC	2	8	284687	284694	0 %	25 %	25 %	50 %	379704187
5051	NC_016835	GTC	2	6	284702	284707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704187
5052	NC_016835	GCG	2	6	284724	284729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704187
5053	NC_016835	ATA	2	6	284769	284774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704187
5054	NC_016835	CGT	2	6	284831	284836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704187
5055	NC_016835	ATTG	2	8	284877	284884	25 %	50 %	25 %	0 %	379704187
5056	NC_016835	ACA	2	6	285124	285129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704188
5057	NC_016835	AGG	2	6	285165	285170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379704188
5058	NC_016835	CAG	2	6	285194	285199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704188
5059	NC_016835	GAA	2	6	285266	285271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704188
5060	NC_016835	GGC	2	6	285337	285342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704188
5061	NC_016835	GCAG	2	8	285358	285365	25 %	0 %	50 %	25 %	379704188
5062	NC_016835	ATG	2	6	286153	286158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704189
5063	NC_016835	CTGG	2	8	286345	286352	0 %	25 %	50 %	25 %	379704189
5064	NC_016835	CGCTTG	2	12	286361	286372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704189
5065	NC_016835	TGC	2	6	286391	286396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704189
5066	NC_016835	TACA	2	8	286433	286440	50 %	25 %	0 %	25 %	379704189
5067	NC_016835	CT	3	6	286486	286491	0 %	50 %	0 %	50 %	379704189
5068	NC_016835	A	6	6	286579	286584	100 %	0 %	0 %	0 %	379704189
5069	NC_016835	ATC	2	6	286603	286608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704189
5070	NC_016835	ACGC	2	8	286636	286643	25 %	0 %	25 %	50 %	379704189
5071	NC_016835	AAG	2	6	286676	286681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704189
5072	NC_016835	ATG	2	6	286693	286698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704189
5073	NC_016835	ACG	2	6	286805	286810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704189
5074	NC_016835	GCG	2	6	286817	286822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704189
5075	NC_016835	GGC	2	6	286867	286872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704189
5076	NC_016835	CCGGCT	2	12	286879	286890	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	379704189
5077	NC_016835	CAT	2	6	287019	287024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704189
5078	NC_016835	GGC	2	6	287044	287049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704189
5079	NC_016835	CAC	2	6	287107	287112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704189
5080	NC_016835	AGA	2	6	287178	287183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704189
5081	NC_016835	GGC	2	6	287202	287207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704189
5082	NC_016835	TGA	2	6	287288	287293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704189
5083	NC_016835	CAAAC	2	10	287310	287319	60 %	0 %	0 %	40 %	379704189
5084	NC_016835	GTT	2	6	287370	287375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704189
5085	NC_016835	A	6	6	287380	287385	100 %	0 %	0 %	0 %	379704189
5086	NC_016835	CGG	2	6	287415	287420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704189
5087	NC_016835	TGC	2	6	287435	287440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704189
5088	NC_016835	CTG	2	6	287455	287460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704189
5089	NC_016835	CCTG	2	8	287530	287537	0 %	25 %	25 %	50 %	379704189
5090	NC_016835	CAG	2	6	287611	287616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704190
5091	NC_016835	TGT	2	6	287640	287645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704190
5092	NC_016835	CAA	2	6	287656	287661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704190
5093	NC_016835	CTGT	2	8	287788	287795	0 %	50 %	25 %	25 %	379704190
5094	NC_016835	TGG	2	6	287837	287842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704190
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5098	NC_016835	GC	3	6	288034	288039	0 %	0 %	50 %	50 %	379704190
5099	NC_016835	CATTC	2	10	288064	288073	20 %	40 %	0 %	40 %	379704190
5100	NC_016835	TGGTC	2	10	288081	288090	0 %	40 %	40 %	20 %	379704190
5101	NC_016835	AGA	2	6	288146	288151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704190
5102	NC_016835	GCT	2	6	288159	288164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704190
5103	NC_016835	GGCGCA	2	12	288246	288257	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	379704190
5104	NC_016835	TAC	2	6	288300	288305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704190
5105	NC_016835	GGC	2	6	288348	288353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704190
5106	NC_016835	GCG	2	6	288382	288387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704190
5107	NC_016835	GGGGC	2	10	288389	288398	0 %	0 %	80 %	20 %	379704190
5108	NC_016835	TGG	2	6	288446	288451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704190
5109	NC_016835	TTC	2	6	288481	288486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704190
5110	NC_016835	GCG	2	6	288500	288505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704190
5111	NC_016835	AGA	2	6	288519	288524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704190
5112	NC_016835	GGC	2	6	288552	288557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704190
5113	NC_016835	GGC	2	6	288582	288587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704190
5114	NC_016835	ACC	2	6	288622	288627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704190
5115	NC_016835	CGT	2	6	288628	288633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704190
5116	NC_016835	TGA	2	6	288767	288772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704190
5117	NC_016835	GCA	2	6	288824	288829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704190
5118	NC_016835	CTG	2	6	288847	288852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704190
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5120	NC_016835	TGA	3	9	289413	289421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704191
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5122	NC_016835	TG	4	8	289452	289459	0 %	50 %	50 %	0 %	379704191
5123	NC_016835	GCTG	2	8	289488	289495	0 %	25 %	50 %	25 %	379704191
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