MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq201

Total Repeats: 8280

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016835	CGA	2	6	256395	256400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704163
4502	NC_016835	CGA	2	6	256405	256410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704163
4503	NC_016835	CTG	2	6	256463	256468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704163
4504	NC_016835	ACG	2	6	256554	256559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704163
4505	NC_016835	CGC	2	6	256571	256576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704163
4506	NC_016835	CTACAC	2	12	256642	256653	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	379704163
4507	NC_016835	CTA	2	6	256822	256827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704163
4508	NC_016835	CGC	2	6	257034	257039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704163
4509	NC_016835	ACG	2	6	257070	257075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704163
4510	NC_016835	AAC	2	6	257207	257212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704163
4511	NC_016835	CCAG	2	8	257268	257275	25 %	0 %	25 %	50 %	379704163
4512	NC_016835	ACC	2	6	257276	257281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704163
4513	NC_016835	CG	4	8	257293	257300	0 %	0 %	50 %	50 %	379704163
4514	NC_016835	AC	3	6	257490	257495	50 %	0 %	0 %	50 %	379704163
4515	NC_016835	TTC	2	6	257507	257512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379704163
4516	NC_016835	GAA	2	6	257567	257572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379704163
4517	NC_016835	GCA	2	6	257583	257588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704163
4518	NC_016835	AACCTG	2	12	257657	257668	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379704163
4519	NC_016835	AAC	2	6	257726	257731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704163
4520	NC_016835	T	6	6	257848	257853	0 %	100 %	0 %	0 %	379704164
4521	NC_016835	T	6	6	257884	257889	0 %	100 %	0 %	0 %	379704164
4522	NC_016835	CTGC	2	8	257891	257898	0 %	25 %	25 %	50 %	379704164
4523	NC_016835	CAG	2	6	257924	257929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704164
4524	NC_016835	GTG	2	6	257966	257971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704164
4525	NC_016835	GGT	2	6	258001	258006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704164
4526	NC_016835	GGTG	2	8	258019	258026	0 %	25 %	75 %	0 %	379704164
4527	NC_016835	GTCG	2	8	258091	258098	0 %	25 %	50 %	25 %	379704164
4528	NC_016835	ATC	2	6	258152	258157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704164
4529	NC_016835	CAG	2	6	258163	258168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704164
4530	NC_016835	CGC	2	6	258187	258192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704164
4531	NC_016835	GCT	3	9	258214	258222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704164
4532	NC_016835	GCG	2	6	258263	258268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704164
4533	NC_016835	ATC	2	6	258269	258274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704164
4534	NC_016835	CAA	2	6	258305	258310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704164
4535	NC_016835	GGT	2	6	258373	258378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704164
4536	NC_016835	CG	3	6	258390	258395	0 %	0 %	50 %	50 %	379704164
4537	NC_016835	AGC	2	6	258396	258401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704164
4538	NC_016835	CG	3	6	258417	258422	0 %	0 %	50 %	50 %	379704164
4539	NC_016835	CTCG	2	8	258448	258455	0 %	25 %	25 %	50 %	379704164
4540	NC_016835	CAG	2	6	258482	258487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704164
4541	NC_016835	GCA	2	6	258583	258588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704164
4542	NC_016835	GAT	2	6	258604	258609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704164
4543	NC_016835	GCA	2	6	258619	258624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704164
4544	NC_016835	AGG	2	6	258630	258635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379704164
4545	NC_016835	GCC	2	6	258680	258685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704164
4546	NC_016835	CAT	2	6	258719	258724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704164
4547	NC_016835	ATG	2	6	258745	258750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704164
4548	NC_016835	T	6	6	258827	258832	0 %	100 %	0 %	0 %	379704165
4549	NC_016835	TGC	2	6	258878	258883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704165
4550	NC_016835	CCG	2	6	258889	258894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704165
4551	NC_016835	TGG	2	6	258944	258949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704165
4552	NC_016835	TGC	2	6	258953	258958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704165
4553	NC_016835	CTGGCG	2	12	258970	258981	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379704165
4554	NC_016835	TGC	2	6	258989	258994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704165
4555	NC_016835	TGG	2	6	259118	259123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704165
4556	NC_016835	GCG	2	6	259133	259138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704165
4557	NC_016835	GCG	2	6	259169	259174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704165
4558	NC_016835	GGC	2	6	259178	259183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704165
4559	NC_016835	CGC	2	6	259239	259244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704165
4560	NC_016835	GCTG	2	8	259298	259305	0 %	25 %	50 %	25 %	379704165
4561	NC_016835	GTGGC	2	10	259310	259319	0 %	20 %	60 %	20 %	379704165
4562	NC_016835	ATC	2	6	259366	259371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704165
4563	NC_016835	TGC	2	6	259385	259390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704165
4564	NC_016835	CGA	2	6	259422	259427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704165
4565	NC_016835	GC	3	6	259430	259435	0 %	0 %	50 %	50 %	379704165
4566	NC_016835	TGC	2	6	259490	259495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704165
4567	NC_016835	CTG	2	6	259543	259548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704165
4568	NC_016835	TGC	2	6	259631	259636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704165
4569	NC_016835	GC	3	6	259651	259656	0 %	0 %	50 %	50 %	379704165
4570	NC_016835	CGG	2	6	259682	259687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704165
4571	NC_016835	GTG	2	6	259690	259695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704165
4572	NC_016835	CTGG	2	8	259725	259732	0 %	25 %	50 %	25 %	379704165
4573	NC_016835	GTT	2	6	259784	259789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704166
4574	NC_016835	GCT	2	6	259790	259795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704166
4575	NC_016835	GCG	2	6	259938	259943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704166
4576	NC_016835	TGC	2	6	260021	260026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704166
4577	NC_016835	CAG	2	6	260038	260043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704166
4578	NC_016835	GCC	2	6	260084	260089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704166
4579	NC_016835	CGG	2	6	260102	260107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704166
4580	NC_016835	CGC	2	6	260111	260116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704166
4581	NC_016835	TGC	2	6	260125	260130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704166
4582	NC_016835	CTGA	2	8	260205	260212	25 %	25 %	25 %	25 %	379704166
4583	NC_016835	CAA	2	6	260243	260248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379704166
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4585	NC_016835	TTG	2	6	260296	260301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704166
4586	NC_016835	CTG	2	6	260328	260333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704166
4587	NC_016835	TGA	2	6	260381	260386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704166
4588	NC_016835	GTT	2	6	260435	260440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704166
4589	NC_016835	GGC	2	6	260456	260461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704166
4590	NC_016835	GCG	2	6	260472	260477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704166
4591	NC_016835	GGTT	2	8	260486	260493	0 %	50 %	50 %	0 %	379704166
4592	NC_016835	GCACC	2	10	260508	260517	20 %	0 %	20 %	60 %	379704166
4593	NC_016835	CGG	2	6	260534	260539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704166
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4595	NC_016835	CTGC	2	8	260637	260644	0 %	25 %	25 %	50 %	379704166
4596	NC_016835	CGG	2	6	260656	260661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704166
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4600	NC_016835	TGA	3	9	260896	260904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704167
4601	NC_016835	GCC	2	6	260922	260927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704167
4602	NC_016835	GCA	3	9	260956	260964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704167
4603	NC_016835	GCGT	2	8	260985	260992	0 %	25 %	50 %	25 %	379704167
4604	NC_016835	TGG	2	6	260997	261002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704167
4605	NC_016835	GCA	2	6	261046	261051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704167
4606	NC_016835	TCG	2	6	261063	261068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704167
4607	NC_016835	CGG	2	6	261130	261135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704167
4608	NC_016835	CGC	2	6	261180	261185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704167
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4612	NC_016835	TGA	2	6	261240	261245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704167
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4614	NC_016835	TGG	2	6	261282	261287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379704167
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4616	NC_016835	TGA	2	6	261384	261389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704167
4617	NC_016835	CATTC	2	10	261514	261523	20 %	40 %	0 %	40 %	379704168
4618	NC_016835	TGT	2	6	261568	261573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379704168
4619	NC_016835	CAT	2	6	261575	261580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704168
4620	NC_016835	ATA	2	6	261678	261683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379704168
4621	NC_016835	TA	3	6	261769	261774	50 %	50 %	0 %	0 %	379704168
4622	NC_016835	CGA	2	6	261785	261790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704168
4623	NC_016835	CAT	2	6	261809	261814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704168
4624	NC_016835	TGC	2	6	261841	261846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704168
4625	NC_016835	GAT	2	6	261890	261895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704168
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4628	NC_016835	ATG	2	6	262207	262212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704169
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4661	NC_016835	CTGA	2	8	264464	264471	25 %	25 %	25 %	25 %	379704172
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4741	NC_016835	GCA	2	6	268237	268242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704174
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4859	NC_016835	AC	3	6	275081	275086	50 %	0 %	0 %	50 %	379704180
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4981	NC_016835	CGC	2	6	281163	281168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704185
4982	NC_016835	GC	3	6	281213	281218	0 %	0 %	50 %	50 %	379704185
4983	NC_016835	CG	3	6	281262	281267	0 %	0 %	50 %	50 %	379704185
4984	NC_016835	GCT	2	6	281335	281340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704185
4985	NC_016835	ACC	2	6	281513	281518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379704185
4986	NC_016835	CAGC	2	8	281527	281534	25 %	0 %	25 %	50 %	379704185
4987	NC_016835	GTGA	2	8	281546	281553	25 %	25 %	50 %	0 %	379704185
4988	NC_016835	GGC	2	6	281587	281592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704185
4989	NC_016835	CGC	2	6	281602	281607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379704185
4990	NC_016835	CGGG	2	8	281613	281620	0 %	0 %	75 %	25 %	379704185
4991	NC_016835	GT	4	8	281631	281638	0 %	50 %	50 %	0 %	379704185
4992	NC_016835	GGC	2	6	281653	281658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379704185
4993	NC_016835	CAG	2	6	281747	281752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704185
4994	NC_016835	TTA	2	6	281775	281780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379704185
4995	NC_016835	GAT	2	6	281888	281893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379704185
4996	NC_016835	TGC	2	6	281907	281912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379704185
4997	NC_016835	TGGC	2	8	281935	281942	0 %	25 %	50 %	25 %	379704185
4998	NC_016835	TCA	2	6	282215	282220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379704186
4999	NC_016835	GCA	2	6	282250	282255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704186
5000	NC_016835	AGC	2	6	282313	282318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379704186

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