MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq202

Total Repeats: 1279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016819	TGA	2	6	631	636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192312
2	NC_016819	GTC	2	6	659	664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192312
3	NC_016819	GCC	2	6	665	670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192312
4	NC_016819	GCC	2	6	848	853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192312
5	NC_016819	GAT	2	6	910	915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192312
6	NC_016819	CAG	2	6	941	946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192312
7	NC_016819	GCC	2	6	1048	1053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192312
8	NC_016819	CAA	2	6	1159	1164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192312
9	NC_016819	CAG	2	6	1183	1188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192312
10	NC_016819	CTG	2	6	1201	1206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192312
11	NC_016819	ATG	2	6	1242	1247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192312
12	NC_016819	CCA	2	6	1321	1326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383192312
13	NC_016819	ATT	2	6	1367	1372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383192312
14	NC_016819	GGT	2	6	1469	1474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383192312
15	NC_016819	TAT	2	6	1629	1634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383192313
16	NC_016819	TGG	2	6	1665	1670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383192313
17	NC_016819	TTA	2	6	1739	1744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383192313
18	NC_016819	TTA	2	6	2540	2545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383192314
19	NC_016819	AAC	2	6	2698	2703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192314
20	NC_016819	ACG	2	6	2704	2709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192314
21	NC_016819	GTT	2	6	2791	2796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192315
22	NC_016819	CTG	3	9	3003	3011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192315
23	NC_016819	CAA	2	6	3122	3127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192315
24	NC_016819	CGC	2	6	3216	3221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192315
25	NC_016819	ACC	2	6	3236	3241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383192315
26	NC_016819	CGA	2	6	3269	3274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192315
27	NC_016819	AGT	2	6	3324	3329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192315
28	NC_016819	AAT	2	6	3360	3365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192315
29	NC_016819	ATT	2	6	4091	4096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383192316
30	NC_016819	TGC	2	6	4147	4152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192316
31	NC_016819	AAT	2	6	4242	4247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192316
32	NC_016819	CAA	2	6	4277	4282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192316
33	NC_016819	AAG	2	6	4335	4340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383192316
34	NC_016819	GCT	2	6	4398	4403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192316
35	NC_016819	GTG	2	6	4489	4494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383192316
36	NC_016819	GCA	2	6	4820	4825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192317
37	NC_016819	ACA	2	6	4929	4934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192317
38	NC_016819	GAC	2	6	4943	4948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192317
39	NC_016819	CAG	2	6	4970	4975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192317
40	NC_016819	TTG	2	6	5054	5059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192317
41	NC_016819	CGT	2	6	5168	5173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192317
42	NC_016819	ACA	2	6	5293	5298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192317
43	NC_016819	ATT	2	6	5552	5557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383192317
44	NC_016819	GTT	2	6	6272	6277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192318
45	NC_016819	TTC	2	6	6291	6296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192318
46	NC_016819	AAT	2	6	6360	6365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192318
47	NC_016819	TCG	2	6	6370	6375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192318
48	NC_016819	CAT	2	6	6392	6397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192318
49	NC_016819	GCC	2	6	6437	6442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192318
50	NC_016819	GTT	2	6	6515	6520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192318
51	NC_016819	GAA	3	9	6692	6700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383192318
52	NC_016819	ACA	2	6	6754	6759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192318
53	NC_016819	ATA	2	6	6804	6809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192318
54	NC_016819	CCT	2	6	6815	6820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383192318
55	NC_016819	TTG	2	6	6842	6847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192318
56	NC_016819	GAG	2	6	6892	6897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383192318
57	NC_016819	GCT	2	6	7082	7087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192318
58	NC_016819	ACG	2	6	8347	8352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192319
59	NC_016819	TAC	2	6	8403	8408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192319
60	NC_016819	TCA	2	6	8421	8426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192319
61	NC_016819	AAC	2	6	8537	8542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192319
62	NC_016819	GTA	2	6	8572	8577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192319
63	NC_016819	TCA	2	6	8636	8641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192319
64	NC_016819	TCA	2	6	8924	8929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192320
65	NC_016819	TCT	2	6	8965	8970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192320
66	NC_016819	TTG	2	6	9094	9099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192320
67	NC_016819	AAT	2	6	9177	9182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192320
68	NC_016819	ATT	2	6	9240	9245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383192320
69	NC_016819	ATA	2	6	9250	9255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192320
70	NC_016819	ACG	2	6	10392	10397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192321
71	NC_016819	CCA	2	6	10419	10424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383192321
72	NC_016819	TAT	2	6	10425	10430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383192321
73	NC_016819	CCG	2	6	10572	10577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192321
74	NC_016819	GCG	2	6	10675	10680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383192321
75	NC_016819	GAC	2	6	10725	10730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192321
76	NC_016819	CTG	2	6	10804	10809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192321
77	NC_016819	AAC	2	6	10850	10855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192321
78	NC_016819	TTG	2	6	10887	10892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192321
79	NC_016819	TTC	2	6	11005	11010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192321
80	NC_016819	GTG	2	6	11042	11047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383192321
81	NC_016819	TCA	2	6	11214	11219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192321
82	NC_016819	ATG	2	6	11507	11512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192322
83	NC_016819	GTG	2	6	11660	11665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383192322
84	NC_016819	ATT	2	6	11755	11760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383192322
85	NC_016819	GGC	2	6	11834	11839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383192322
86	NC_016819	TCT	2	6	12042	12047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192322
87	NC_016819	TCT	2	6	12074	12079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192322
88	NC_016819	CTG	2	6	12143	12148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192322
89	NC_016819	GCT	2	6	12451	12456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192322
90	NC_016819	ACA	2	6	12501	12506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192322
91	NC_016819	TGG	2	6	12546	12551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383192322
92	NC_016819	CTA	2	6	12738	12743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192322
93	NC_016819	CAT	2	6	12929	12934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192323
94	NC_016819	AGA	2	6	13036	13041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383192323
95	NC_016819	CGG	2	6	13065	13070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383192323
96	NC_016819	TGG	2	6	13071	13076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383192323
97	NC_016819	ATG	2	6	13134	13139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192323
98	NC_016819	CGG	2	6	13221	13226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383192323
99	NC_016819	CAT	2	6	13232	13237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192323
100	NC_016819	GTC	2	6	13283	13288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192323
101	NC_016819	TGG	2	6	13512	13517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383192323
102	NC_016819	GCC	2	6	13620	13625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192323
103	NC_016819	TGT	2	6	13695	13700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192323
104	NC_016819	CAG	2	6	13817	13822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192323
105	NC_016819	TCG	2	6	14125	14130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192323
106	NC_016819	AAC	2	6	14402	14407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192324
107	NC_016819	AGC	2	6	14423	14428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192324
108	NC_016819	AGC	2	6	14444	14449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192324
109	NC_016819	GAT	2	6	14803	14808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192324
110	NC_016819	CAG	2	6	14827	14832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192324
111	NC_016819	ATG	2	6	14962	14967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192324
112	NC_016819	GCA	3	9	14984	14992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192324
113	NC_016819	AGA	2	6	15057	15062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383192324
114	NC_016819	CGC	3	9	15174	15182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192324
115	NC_016819	AAT	2	6	15202	15207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192324
116	NC_016819	GCT	2	6	15349	15354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192324
117	NC_016819	CAA	2	6	15426	15431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192324
118	NC_016819	GCT	2	6	15805	15810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192325
119	NC_016819	GAT	2	6	15869	15874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192325
120	NC_016819	GAA	2	6	15875	15880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383192325
121	NC_016819	GTT	2	6	15904	15909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192325
122	NC_016819	TAA	2	6	16147	16152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192325
123	NC_016819	TGG	3	9	16209	16217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383192325
124	NC_016819	CGT	2	6	16258	16263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192325
125	NC_016819	AAT	2	6	16582	16587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192326
126	NC_016819	AAG	2	6	17004	17009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383192327
127	NC_016819	GAG	2	6	17082	17087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383192327
128	NC_016819	GAT	2	6	17147	17152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192327
129	NC_016819	CTT	2	6	17247	17252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192327
130	NC_016819	TAT	2	6	17418	17423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383192327
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132	NC_016819	CTT	2	6	17628	17633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192327
133	NC_016819	TAA	2	6	17651	17656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192327
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162	NC_016819	CGG	2	6	20788	20793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383192330
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248	NC_016819	CCT	2	6	27011	27016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383192336
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250	NC_016819	GAG	2	6	27074	27079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383192336
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252	NC_016819	TAT	2	6	27089	27094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383192336
253	NC_016819	TTG	2	6	27323	27328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192336
254	NC_016819	ATG	2	6	27528	27533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192336
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256	NC_016819	GGC	3	9	27630	27638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383192336
257	NC_016819	TGA	2	6	27730	27735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192336
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265	NC_016819	CTG	2	6	28442	28447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192337
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499	NC_016819	CGG	2	6	49784	49789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383192358
500	NC_016819	AGG	2	6	49836	49841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383192358

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