MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq202

Total Repeats: 1870

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016819	CGC	3	9	97377	97385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192400
1502	NC_016819	CAA	2	6	97422	97427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192400
1503	NC_016819	CGACA	2	10	97431	97440	40 %	0 %	20 %	40 %	383192400
1504	NC_016819	TGC	2	6	97567	97572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192400
1505	NC_016819	GTT	2	6	97589	97594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192400
1506	NC_016819	ACGGG	2	10	97602	97611	20 %	0 %	60 %	20 %	383192400
1507	NC_016819	AGGA	2	8	97634	97641	50 %	0 %	50 %	0 %	383192400
1508	NC_016819	TCAGA	2	10	97841	97850	40 %	20 %	20 %	20 %	383192401
1509	NC_016819	CAG	2	6	97912	97917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192401
1510	NC_016819	TCG	2	6	97979	97984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192401
1511	NC_016819	CCAG	2	8	97995	98002	25 %	0 %	25 %	50 %	383192401
1512	NC_016819	CACG	2	8	98139	98146	25 %	0 %	25 %	50 %	383192401
1513	NC_016819	TCA	2	6	98166	98171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192401
1514	NC_016819	CGCAC	2	10	98177	98186	20 %	0 %	20 %	60 %	383192401
1515	NC_016819	ATC	2	6	98260	98265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192401
1516	NC_016819	GCAG	2	8	98282	98289	25 %	0 %	50 %	25 %	383192401
1517	NC_016819	ATA	2	6	98314	98319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192401
1518	NC_016819	GCAC	2	8	98342	98349	25 %	0 %	25 %	50 %	383192401
1519	NC_016819	TGG	2	6	98370	98375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383192401
1520	NC_016819	AAT	2	6	98380	98385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192401
1521	NC_016819	CGC	2	6	98412	98417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192401
1522	NC_016819	GCA	2	6	98451	98456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192401
1523	NC_016819	ACG	2	6	98469	98474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192401
1524	NC_016819	GCC	2	6	98509	98514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192401
1525	NC_016819	CAG	2	6	98596	98601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192401
1526	NC_016819	GCG	2	6	98615	98620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383192401
1527	NC_016819	AATG	2	8	98664	98671	50 %	25 %	25 %	0 %	383192401
1528	NC_016819	CAC	2	6	98706	98711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383192401
1529	NC_016819	ACCGG	2	10	98826	98835	20 %	0 %	40 %	40 %	383192401
1530	NC_016819	TGGC	2	8	98878	98885	0 %	25 %	50 %	25 %	383192401
1531	NC_016819	TGA	2	6	98886	98891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192401
1532	NC_016819	CAGC	2	8	98925	98932	25 %	0 %	25 %	50 %	383192401
1533	NC_016819	CCA	2	6	98961	98966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383192401
1534	NC_016819	TCA	2	6	99102	99107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192401
1535	NC_016819	T	6	6	99157	99162	0 %	100 %	0 %	0 %	383192401
1536	NC_016819	AC	3	6	99226	99231	50 %	0 %	0 %	50 %	383192401
1537	NC_016819	CGC	2	6	99277	99282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192401
1538	NC_016819	GC	4	8	99287	99294	0 %	0 %	50 %	50 %	383192401
1539	NC_016819	GGTA	2	8	99385	99392	25 %	25 %	50 %	0 %	383192401
1540	NC_016819	CTG	2	6	99423	99428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192402
1541	NC_016819	GCC	2	6	99456	99461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192402
1542	NC_016819	GA	3	6	99475	99480	50 %	0 %	50 %	0 %	383192402
1543	NC_016819	GAT	2	6	99494	99499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192402
1544	NC_016819	CGC	2	6	99555	99560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192402
1545	NC_016819	CGGG	2	8	99564	99571	0 %	0 %	75 %	25 %	383192402
1546	NC_016819	CAA	2	6	99641	99646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192402
1547	NC_016819	CGTT	2	8	99732	99739	0 %	50 %	25 %	25 %	383192402
1548	NC_016819	CAGAT	2	10	99753	99762	40 %	20 %	20 %	20 %	383192402
1549	NC_016819	GC	3	6	99815	99820	0 %	0 %	50 %	50 %	383192402
1550	NC_016819	TCG	2	6	99826	99831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192402
1551	NC_016819	CTGC	2	8	99854	99861	0 %	25 %	25 %	50 %	383192402
1552	NC_016819	GACG	2	8	99877	99884	25 %	0 %	50 %	25 %	383192402
1553	NC_016819	TGT	2	6	99944	99949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192402
1554	NC_016819	CTT	2	6	99953	99958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192402
1555	NC_016819	GAC	2	6	99968	99973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192402
1556	NC_016819	GCC	2	6	99979	99984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192402
1557	NC_016819	CTG	3	9	100095	100103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192402
1558	NC_016819	A	6	6	100167	100172	100 %	0 %	0 %	0 %	383192402
1559	NC_016819	GAAA	2	8	100215	100222	75 %	0 %	25 %	0 %	383192402
1560	NC_016819	CAGC	2	8	100304	100311	25 %	0 %	25 %	50 %	383192402
1561	NC_016819	GCC	2	6	100320	100325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192402
1562	NC_016819	CAC	2	6	100365	100370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383192402
1563	NC_016819	CCA	4	12	100385	100396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383192402
1564	NC_016819	CGG	3	9	100397	100405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383192402
1565	NC_016819	GCT	2	6	100454	100459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192402
1566	NC_016819	TTA	2	6	100570	100575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383192402
1567	NC_016819	CAA	2	6	100614	100619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192402
1568	NC_016819	CTG	2	6	100656	100661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192402
1569	NC_016819	CAG	2	6	100668	100673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192402
1570	NC_016819	GGT	2	6	100676	100681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383192402
1571	NC_016819	GGC	2	6	100718	100723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383192402
1572	NC_016819	GC	3	6	100749	100754	0 %	0 %	50 %	50 %	383192402
1573	NC_016819	GAT	2	6	100783	100788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192402
1574	NC_016819	ATG	2	6	100859	100864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192402
1575	NC_016819	GTT	2	6	101203	101208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192403
1576	NC_016819	CAA	2	6	101318	101323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192403
1577	NC_016819	GCT	2	6	101354	101359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192403
1578	NC_016819	AAT	2	6	101382	101387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192403
1579	NC_016819	CCCAG	2	10	101425	101434	20 %	0 %	20 %	60 %	383192403
1580	NC_016819	CGC	3	9	101437	101445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192403
1581	NC_016819	GC	3	6	101516	101521	0 %	0 %	50 %	50 %	383192403
1582	NC_016819	CCG	2	6	101545	101550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192403
1583	NC_016819	CAG	3	9	101570	101578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192403
1584	NC_016819	TGC	2	6	101613	101618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192403
1585	NC_016819	CAT	2	6	101650	101655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192403
1586	NC_016819	TGC	2	6	101673	101678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192403
1587	NC_016819	TTC	2	6	101723	101728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192403
1588	NC_016819	CGG	2	6	101764	101769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383192403
1589	NC_016819	GCC	2	6	101829	101834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192403
1590	NC_016819	CTT	2	6	101845	101850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192403
1591	NC_016819	CTG	2	6	101858	101863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192403
1592	NC_016819	CTG	2	6	101885	101890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192403
1593	NC_016819	TTC	2	6	101915	101920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192403
1594	NC_016819	CA	3	6	101967	101972	50 %	0 %	0 %	50 %	383192403
1595	NC_016819	CAAA	2	8	102039	102046	75 %	0 %	0 %	25 %	383192404
1596	NC_016819	TCA	2	6	102084	102089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192404
1597	NC_016819	CAC	3	9	102112	102120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383192404
1598	NC_016819	CAC	2	6	102123	102128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383192404
1599	NC_016819	GCCA	2	8	102182	102189	25 %	0 %	25 %	50 %	383192404
1600	NC_016819	AAT	2	6	102229	102234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192404
1601	NC_016819	GTC	3	9	102238	102246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192404
1602	NC_016819	CACG	2	8	102297	102304	25 %	0 %	25 %	50 %	383192404
1603	NC_016819	CGG	2	6	102320	102325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383192404
1604	NC_016819	CGC	2	6	102336	102341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192404
1605	NC_016819	CTG	2	6	102394	102399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192404
1606	NC_016819	CGGCC	2	10	102507	102516	0 %	0 %	40 %	60 %	383192405
1607	NC_016819	CAG	2	6	102540	102545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192405
1608	NC_016819	GCC	2	6	102557	102562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192405
1609	NC_016819	TTC	2	6	102579	102584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192405
1610	NC_016819	ATG	2	6	102640	102645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192405
1611	NC_016819	GGC	2	6	102653	102658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383192405
1612	NC_016819	GAA	2	6	102690	102695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383192405
1613	NC_016819	TCA	2	6	102724	102729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192405
1614	NC_016819	CCT	2	6	102882	102887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383192406
1615	NC_016819	CG	3	6	102932	102937	0 %	0 %	50 %	50 %	383192406
1616	NC_016819	GCCT	3	12	102953	102964	0 %	25 %	25 %	50 %	383192406
1617	NC_016819	CCCG	2	8	102993	103000	0 %	0 %	25 %	75 %	383192406
1618	NC_016819	AG	3	6	103004	103009	50 %	0 %	50 %	0 %	383192406
1619	NC_016819	GCA	2	6	103041	103046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192406
1620	NC_016819	GCC	2	6	103049	103054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192406
1621	NC_016819	CCG	2	6	103088	103093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192406
1622	NC_016819	TGC	2	6	103103	103108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192406
1623	NC_016819	CGC	2	6	103126	103131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192406
1624	NC_016819	AGC	2	6	103132	103137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192406
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1747	NC_016819	TGC	2	6	109349	109354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192412
1748	NC_016819	CGG	2	6	109364	109369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383192412
1749	NC_016819	CGG	3	9	109394	109402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383192412
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1753	NC_016819	TGC	2	6	109504	109509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192412
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1755	NC_016819	GCTC	2	8	109556	109563	0 %	25 %	25 %	50 %	383192412
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1762	NC_016819	GC	3	6	110043	110048	0 %	0 %	50 %	50 %	383192413
1763	NC_016819	CGG	2	6	110055	110060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383192413
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1866	NC_016819	CGC	2	6	114751	114756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192417
1867	NC_016819	ATG	2	6	114825	114830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192417
1868	NC_016819	CGA	2	6	114889	114894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192417
1869	NC_016819	CTT	2	6	114902	114907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192417
1870	NC_016819	GTG	2	6	114945	114950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383192417

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