MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 2565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016818	CTATC	2	10	852	861	20 %	40 %	0 %	40 %	383187968
2	NC_016818	GTTGC	2	10	4862	4871	0 %	40 %	40 %	20 %	383187971
3	NC_016818	CCGCG	2	10	6461	6470	0 %	0 %	40 %	60 %	383187971
4	NC_016818	TGGCT	2	10	11445	11454	0 %	40 %	40 %	20 %	383187978
5	NC_016818	TAATG	2	10	12161	12170	40 %	40 %	20 %	0 %	383187979
6	NC_016818	GGCGC	2	10	14218	14227	0 %	0 %	60 %	40 %	383187980
7	NC_016818	GGAAA	2	10	17976	17985	60 %	0 %	40 %	0 %	383187984
8	NC_016818	GAACA	2	10	18238	18247	60 %	0 %	20 %	20 %	383187984
9	NC_016818	TGCTG	2	10	19651	19660	0 %	40 %	40 %	20 %	383187985
10	NC_016818	GTGGC	2	10	19668	19677	0 %	20 %	60 %	20 %	383187985
11	NC_016818	AATGC	2	10	21891	21900	40 %	20 %	20 %	20 %	383187986
12	NC_016818	TCTGG	2	10	27345	27354	0 %	40 %	40 %	20 %	383187991
13	NC_016818	CAGCG	2	10	30580	30589	20 %	0 %	40 %	40 %	383187993
14	NC_016818	GTGCG	2	10	31519	31528	0 %	20 %	60 %	20 %	383187994
15	NC_016818	ACCAC	2	10	33656	33665	40 %	0 %	0 %	60 %	383187996
16	NC_016818	ATCCG	2	10	33906	33915	20 %	20 %	20 %	40 %	383187996
17	NC_016818	AAAAG	2	10	37206	37215	80 %	0 %	20 %	0 %	383188001
18	NC_016818	AGACG	2	10	37615	37624	40 %	0 %	40 %	20 %	383188001
19	NC_016818	AGAAA	2	10	38044	38053	80 %	0 %	20 %	0 %	383188001
20	NC_016818	GTGTA	2	10	38297	38306	20 %	40 %	40 %	0 %	383188001
21	NC_016818	TAAGC	2	10	42073	42082	40 %	20 %	20 %	20 %	383188003
22	NC_016818	TTCCA	2	10	43234	43243	20 %	40 %	0 %	40 %	383188006
23	NC_016818	CGGGC	2	10	43695	43704	0 %	0 %	60 %	40 %	383188006
24	NC_016818	CAGCG	2	10	51156	51165	20 %	0 %	40 %	40 %	383188013
25	NC_016818	GCCCG	2	10	53303	53312	0 %	0 %	40 %	60 %	383188015
26	NC_016818	GCTGG	2	10	55483	55492	0 %	20 %	60 %	20 %	383188016
27	NC_016818	GCAAT	2	10	57320	57329	40 %	20 %	20 %	20 %	383188017
28	NC_016818	GAATG	2	10	57467	57476	40 %	20 %	40 %	0 %	383188017
29	NC_016818	CTGCA	2	10	59502	59511	20 %	20 %	20 %	40 %	383188019
30	NC_016818	TCTGT	2	10	61221	61230	0 %	60 %	20 %	20 %	383188021
31	NC_016818	CACCG	2	10	66283	66292	20 %	0 %	20 %	60 %	383188025
32	NC_016818	CGAAT	2	10	67017	67026	40 %	20 %	20 %	20 %	383188025
33	NC_016818	GGTGA	2	10	67144	67153	20 %	20 %	60 %	0 %	383188025
34	NC_016818	ATGCG	2	10	72848	72857	20 %	20 %	40 %	20 %	383188030
35	NC_016818	GCGCC	2	10	81741	81750	0 %	0 %	40 %	60 %	383188039
36	NC_016818	CCACA	2	10	84154	84163	40 %	0 %	0 %	60 %	383188041
37	NC_016818	AAAAT	2	10	86675	86684	80 %	20 %	0 %	0 %	383188046
38	NC_016818	TGTTT	2	10	87155	87164	0 %	80 %	20 %	0 %	383188047
39	NC_016818	ACCAA	2	10	87366	87375	60 %	0 %	0 %	40 %	383188047
40	NC_016818	GCCAG	2	10	89199	89208	20 %	0 %	40 %	40 %	383188050
41	NC_016818	CAGAC	2	10	89297	89306	40 %	0 %	20 %	40 %	383188050
42	NC_016818	GGTTT	2	10	93025	93034	0 %	60 %	40 %	0 %	383188057
43	NC_016818	ATCGG	2	10	93181	93190	20 %	20 %	40 %	20 %	383188057
44	NC_016818	CGAGC	2	10	95188	95197	20 %	0 %	40 %	40 %	383188059
45	NC_016818	GCTTC	2	10	95697	95706	0 %	40 %	20 %	40 %	383188059
46	NC_016818	CAGCG	2	10	100615	100624	20 %	0 %	40 %	40 %	383188062
47	NC_016818	AAAAT	2	10	100972	100981	80 %	20 %	0 %	0 %	383188062
48	NC_016818	TGAAG	2	10	104185	104194	40 %	20 %	40 %	0 %	383188064
49	NC_016818	CTGGT	2	10	107285	107294	0 %	40 %	40 %	20 %	383188067
50	NC_016818	AAAGA	2	10	107609	107618	80 %	0 %	20 %	0 %	383188067
51	NC_016818	TTCTG	2	10	109039	109048	0 %	60 %	20 %	20 %	383188068
52	NC_016818	CTTCA	2	10	109939	109948	20 %	40 %	0 %	40 %	383188070
53	NC_016818	TGCCA	2	10	111616	111625	20 %	20 %	20 %	40 %	383188072
54	NC_016818	GCACG	2	10	111922	111931	20 %	0 %	40 %	40 %	383188072
55	NC_016818	AATCA	2	10	113207	113216	60 %	20 %	0 %	20 %	383188074
56	NC_016818	GGTCG	2	10	115724	115733	0 %	20 %	60 %	20 %	383188076
57	NC_016818	TGACC	2	10	116540	116549	20 %	20 %	20 %	40 %	383188077
58	NC_016818	GCCAC	2	10	119461	119470	20 %	0 %	20 %	60 %	383188079
59	NC_016818	CGGAA	2	10	119744	119753	40 %	0 %	40 %	20 %	383188079
60	NC_016818	GCACA	2	10	125403	125412	40 %	0 %	20 %	40 %	383188083
61	NC_016818	GCGCC	2	10	125472	125481	0 %	0 %	40 %	60 %	383188083
62	NC_016818	CTGCG	2	10	125647	125656	0 %	20 %	40 %	40 %	383188083
63	NC_016818	CTTGT	2	10	127467	127476	0 %	60 %	20 %	20 %	383188086
64	NC_016818	TTTCA	2	10	127824	127833	20 %	60 %	0 %	20 %	383188086
65	NC_016818	CTGGT	2	10	128576	128585	0 %	40 %	40 %	20 %	383188087
66	NC_016818	CAGCG	2	10	129152	129161	20 %	0 %	40 %	40 %	383188088
67	NC_016818	GTGTG	2	10	129516	129525	0 %	40 %	60 %	0 %	383188088
68	NC_016818	GCTTT	2	10	129632	129641	0 %	60 %	20 %	20 %	383188089
69	NC_016818	AACGG	2	10	130053	130062	40 %	0 %	40 %	20 %	383188089
70	NC_016818	GACGT	2	10	130833	130842	20 %	20 %	40 %	20 %	383188089
71	NC_016818	ACCGT	2	10	131093	131102	20 %	20 %	20 %	40 %	383188089
72	NC_016818	GCCGC	2	10	132833	132842	0 %	0 %	40 %	60 %	383188089
73	NC_016818	GCGCG	2	10	134993	135002	0 %	0 %	60 %	40 %	383188090
74	NC_016818	CGGCG	2	10	136028	136037	0 %	0 %	60 %	40 %	383188090
75	NC_016818	GCGGT	2	10	137106	137115	0 %	20 %	60 %	20 %	383188091
76	NC_016818	CGGCG	2	10	139317	139326	0 %	0 %	60 %	40 %	383188093
77	NC_016818	TGCTG	2	10	141408	141417	0 %	40 %	40 %	20 %	383188094
78	NC_016818	ACCTG	2	10	143362	143371	20 %	20 %	20 %	40 %	383188095
79	NC_016818	CCCGG	2	10	145271	145280	0 %	0 %	40 %	60 %	383188096
80	NC_016818	TGGTG	2	10	145537	145546	0 %	40 %	60 %	0 %	383188096
81	NC_016818	CGTAA	2	10	146762	146771	40 %	20 %	20 %	20 %	383188097
82	NC_016818	GAATT	2	10	147780	147789	40 %	40 %	20 %	0 %	383188099
83	NC_016818	GCCGT	2	10	152072	152081	0 %	20 %	40 %	40 %	383188102
84	NC_016818	GCCGC	2	10	152462	152471	0 %	0 %	40 %	60 %	383188102
85	NC_016818	CGTTG	2	10	155591	155600	0 %	40 %	40 %	20 %	383188106
86	NC_016818	GCTTT	2	10	156206	156215	0 %	60 %	20 %	20 %	383188107
87	NC_016818	GCGCC	2	10	162535	162544	0 %	0 %	40 %	60 %	383188114
88	NC_016818	CGCGC	2	10	163322	163331	0 %	0 %	40 %	60 %	383188114
89	NC_016818	ACGGC	2	10	163942	163951	20 %	0 %	40 %	40 %	383188114
90	NC_016818	GACCG	2	10	166746	166755	20 %	0 %	40 %	40 %	383188119
91	NC_016818	TGGCG	2	10	167922	167931	0 %	20 %	60 %	20 %	383188121
92	NC_016818	TTCCC	2	10	169363	169372	0 %	40 %	0 %	60 %	383188122
93	NC_016818	CCAGC	2	10	173748	173757	20 %	0 %	20 %	60 %	383188124
94	NC_016818	GCATT	2	10	176324	176333	20 %	40 %	20 %	20 %	383188128
95	NC_016818	ATGAC	2	10	178984	178993	40 %	20 %	20 %	20 %	383188129
96	NC_016818	GCTTT	2	10	179614	179623	0 %	60 %	20 %	20 %	383188130
97	NC_016818	TGTTT	2	10	181149	181158	0 %	80 %	20 %	0 %	383188131
98	NC_016818	TCGGT	2	10	183191	183200	0 %	40 %	40 %	20 %	383188133
99	NC_016818	GTGAT	2	10	183302	183311	20 %	40 %	40 %	0 %	383188133
100	NC_016818	TGGCG	2	10	184152	184161	0 %	20 %	60 %	20 %	383188133
101	NC_016818	ATGCC	2	10	186591	186600	20 %	20 %	20 %	40 %	383188135
102	NC_016818	GCGCC	2	10	189951	189960	0 %	0 %	40 %	60 %	383188140
103	NC_016818	CCGCA	2	10	191395	191404	20 %	0 %	20 %	60 %	383188141
104	NC_016818	CATAT	2	10	191797	191806	40 %	40 %	0 %	20 %	383188142
105	NC_016818	AAACC	2	10	192454	192463	60 %	0 %	0 %	40 %	383188143
106	NC_016818	CGGCA	2	10	193435	193444	20 %	0 %	40 %	40 %	383188144
107	NC_016818	GTGCG	2	10	195010	195019	0 %	20 %	60 %	20 %	383188146
108	NC_016818	CGGTG	2	10	196560	196569	0 %	20 %	60 %	20 %	383188147
109	NC_016818	AGGCG	2	10	198427	198436	20 %	0 %	60 %	20 %	383188149
110	NC_016818	ATGCT	2	10	206564	206573	20 %	40 %	20 %	20 %	383188156
111	NC_016818	CCATG	2	10	209472	209481	20 %	20 %	20 %	40 %	383188161
112	NC_016818	AGAAC	2	10	210833	210842	60 %	0 %	20 %	20 %	383188161
113	NC_016818	CCGGC	2	10	211926	211935	0 %	0 %	40 %	60 %	383188162
114	NC_016818	CGGCC	2	10	213541	213550	0 %	0 %	40 %	60 %	383188164
115	NC_016818	TCGGT	2	10	213621	213630	0 %	40 %	40 %	20 %	383188164
116	NC_016818	CCGGC	2	10	218054	218063	0 %	0 %	40 %	60 %	383188167
117	NC_016818	AATGT	2	10	220144	220153	40 %	40 %	20 %	0 %	383188170
118	NC_016818	TGATC	2	10	220853	220862	20 %	40 %	20 %	20 %	383188170
119	NC_016818	TGTTC	2	10	221751	221760	0 %	60 %	20 %	20 %	383188171
120	NC_016818	AATAA	2	10	221761	221770	80 %	20 %	0 %	0 %	383188171
121	NC_016818	TCACT	2	10	221889	221898	20 %	40 %	0 %	40 %	383188171
122	NC_016818	GCAGG	2	10	224156	224165	20 %	0 %	60 %	20 %	383188172
123	NC_016818	GCGGT	2	10	224875	224884	0 %	20 %	60 %	20 %	383188173
124	NC_016818	TATGA	2	10	225995	226004	40 %	40 %	20 %	0 %	383188173
125	NC_016818	CGATC	2	10	227072	227081	20 %	20 %	20 %	40 %	383188175
126	NC_016818	CTGGG	2	10	227838	227847	0 %	20 %	60 %	20 %	383188175
127	NC_016818	TGCCG	2	10	228053	228062	0 %	20 %	40 %	40 %	383188175
128	NC_016818	GCCGC	2	10	229014	229023	0 %	0 %	40 %	60 %	383188176
129	NC_016818	TGCGA	2	10	229859	229868	20 %	20 %	40 %	20 %	383188177
130	NC_016818	TCAAA	2	10	231705	231714	60 %	20 %	0 %	20 %	383188179
131	NC_016818	TGACG	2	10	232289	232298	20 %	20 %	40 %	20 %	383188180
132	NC_016818	TCGGT	2	10	238463	238472	0 %	40 %	40 %	20 %	383188185
133	NC_016818	ATGTC	2	10	240703	240712	20 %	40 %	20 %	20 %	383188186
134	NC_016818	TGCGC	2	10	241387	241396	0 %	20 %	40 %	40 %	383188186
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246	NC_016818	TGGTC	2	10	457709	457718	0 %	40 %	40 %	20 %	383188395
247	NC_016818	TCCAT	2	10	457955	457964	20 %	40 %	0 %	40 %	383188395
248	NC_016818	AAACG	2	10	458134	458143	60 %	0 %	20 %	20 %	383188396
249	NC_016818	CTGAT	2	10	458504	458513	20 %	40 %	20 %	20 %	383188396
250	NC_016818	TGCGT	2	10	458943	458952	0 %	40 %	40 %	20 %	383188396
251	NC_016818	TGCTG	2	10	460181	460190	0 %	40 %	40 %	20 %	383188398
252	NC_016818	AAATC	2	10	460614	460623	60 %	20 %	0 %	20 %	383188398
253	NC_016818	GCAGA	2	10	462256	462265	40 %	0 %	40 %	20 %	383188399
254	NC_016818	GCACC	2	10	464015	464024	20 %	0 %	20 %	60 %	383188400
255	NC_016818	CCGAC	2	10	464432	464441	20 %	0 %	20 %	60 %	383188400
256	NC_016818	CGACA	2	10	464643	464652	40 %	0 %	20 %	40 %	383188400
257	NC_016818	GCACC	2	10	465436	465445	20 %	0 %	20 %	60 %	383188402
258	NC_016818	GCCTG	2	10	467007	467016	0 %	20 %	40 %	40 %	383188403
259	NC_016818	CTGGT	2	10	471043	471052	0 %	40 %	40 %	20 %	383188407
260	NC_016818	GGGAT	2	10	474950	474959	20 %	20 %	60 %	0 %	383188410
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262	NC_016818	ATGTG	2	10	476140	476149	20 %	40 %	40 %	0 %	383188410
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386	NC_016818	ATCAC	2	10	752028	752037	40 %	20 %	0 %	40 %	383188642
387	NC_016818	TGCGT	2	10	753637	753646	0 %	40 %	40 %	20 %	383188642
388	NC_016818	TGCTG	2	10	756924	756933	0 %	40 %	40 %	20 %	383188645
389	NC_016818	AAACC	2	10	758918	758927	60 %	0 %	0 %	40 %	383188645
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