MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 86201

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016818	GCCA	2	8	214058	214065	25 %	0 %	25 %	50 %	383188164
4002	NC_016818	CCG	2	6	214123	214128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188164
4003	NC_016818	GTC	2	6	214136	214141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188164
4004	NC_016818	TGG	2	6	214167	214172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188164
4005	NC_016818	CGG	2	6	214173	214178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188164
4006	NC_016818	CGA	2	6	214198	214203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188164
4007	NC_016818	TGA	2	6	214231	214236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188164
4008	NC_016818	GCC	2	6	214259	214264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188164
4009	NC_016818	A	6	6	214278	214283	100 %	0 %	0 %	0 %	383188164
4010	NC_016818	AGC	2	6	214306	214311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188164
4011	NC_016818	GAT	2	6	214340	214345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188164
4012	NC_016818	TTA	2	6	214350	214355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188164
4013	NC_016818	CGG	2	6	214375	214380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188164
4014	NC_016818	CTG	2	6	214478	214483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188164
4015	NC_016818	GAT	2	6	214499	214504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188164
4016	NC_016818	TCT	2	6	214536	214541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188164
4017	NC_016818	GCTG	2	8	214622	214629	0 %	25 %	50 %	25 %	383188165
4018	NC_016818	CCA	2	6	214634	214639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188165
4019	NC_016818	CGC	2	6	214700	214705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188165
4020	NC_016818	TGC	2	6	214748	214753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188165
4021	NC_016818	CAG	2	6	214767	214772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188165
4022	NC_016818	ATC	2	6	214803	214808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188165
4023	NC_016818	CGT	2	6	214855	214860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188165
4024	NC_016818	CCA	2	6	214907	214912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188165
4025	NC_016818	CGGG	2	8	214921	214928	0 %	0 %	75 %	25 %	383188165
4026	NC_016818	CCG	2	6	214939	214944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188165
4027	NC_016818	CGA	2	6	215195	215200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188165
4028	NC_016818	ATA	2	6	215235	215240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188165
4029	NC_016818	CGG	2	6	215266	215271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188165
4030	NC_016818	GGC	2	6	215357	215362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188165
4031	NC_016818	CGC	2	6	215526	215531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188165
4032	NC_016818	CGCC	2	8	215537	215544	0 %	0 %	25 %	75 %	383188165
4033	NC_016818	CGT	2	6	215555	215560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188165
4034	NC_016818	GC	3	6	215580	215585	0 %	0 %	50 %	50 %	383188165
4035	NC_016818	GCGG	2	8	215654	215661	0 %	0 %	75 %	25 %	383188165
4036	NC_016818	TGC	2	6	215696	215701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188165
4037	NC_016818	CAC	2	6	215718	215723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188165
4038	NC_016818	GGC	2	6	215739	215744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188165
4039	NC_016818	CGCC	2	8	215810	215817	0 %	0 %	25 %	75 %	383188165
4040	NC_016818	CGC	2	6	215878	215883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188165
4041	NC_016818	ATC	2	6	215911	215916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188165
4042	NC_016818	CGAG	2	8	215924	215931	25 %	0 %	50 %	25 %	383188165
4043	NC_016818	CCA	2	6	215957	215962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188165
4044	NC_016818	GAT	2	6	216029	216034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188165
4045	NC_016818	ACC	2	6	216046	216051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188165
4046	NC_016818	CTG	2	6	216234	216239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188165
4047	NC_016818	CTG	2	6	216487	216492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188166
4048	NC_016818	TC	3	6	216539	216544	0 %	50 %	0 %	50 %	383188166
4049	NC_016818	TGA	2	6	216682	216687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188166
4050	NC_016818	A	6	6	216728	216733	100 %	0 %	0 %	0 %	383188166
4051	NC_016818	GCG	2	6	216769	216774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188166
4052	NC_016818	CTG	2	6	216783	216788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188166
4053	NC_016818	CGC	2	6	216803	216808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188166
4054	NC_016818	GC	3	6	216979	216984	0 %	0 %	50 %	50 %	383188166
4055	NC_016818	GGC	2	6	217011	217016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188166
4056	NC_016818	CAT	2	6	217037	217042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188166
4057	NC_016818	TGG	2	6	217045	217050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188166
4058	NC_016818	CTC	2	6	217062	217067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383188166
4059	NC_016818	GCC	2	6	217082	217087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188166
4060	NC_016818	GGT	2	6	217088	217093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188166
4061	NC_016818	ATG	2	6	217155	217160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188166
4062	NC_016818	TCA	2	6	217201	217206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188166
4063	NC_016818	CGC	2	6	217217	217222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188166
4064	NC_016818	TTA	2	6	217290	217295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188166
4065	NC_016818	TGG	2	6	217348	217353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188166
4066	NC_016818	CGG	2	6	217387	217392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188166
4067	NC_016818	GTG	2	6	217461	217466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188166
4068	NC_016818	A	6	6	217473	217478	100 %	0 %	0 %	0 %	383188166
4069	NC_016818	AT	3	6	217596	217601	50 %	50 %	0 %	0 %	383188166
4070	NC_016818	CTG	2	6	217614	217619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188166
4071	NC_016818	GTC	2	6	217641	217646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188166
4072	NC_016818	CCA	2	6	217747	217752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188167
4073	NC_016818	GCA	2	6	217827	217832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188167
4074	NC_016818	GCG	2	6	217899	217904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188167
4075	NC_016818	TGC	2	6	217915	217920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188167
4076	NC_016818	GGC	2	6	217975	217980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188167
4077	NC_016818	CCA	2	6	218017	218022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188167
4078	NC_016818	CCGGC	2	10	218054	218063	0 %	0 %	40 %	60 %	383188167
4079	NC_016818	G	6	6	218807	218812	0 %	0 %	100 %	0 %	383188168
4080	NC_016818	ACA	2	6	218936	218941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188168
4081	NC_016818	GGC	2	6	218992	218997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188168
4082	NC_016818	CAT	2	6	219003	219008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188168
4083	NC_016818	ATT	2	6	219043	219048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188169
4084	NC_016818	TGCA	2	8	219069	219076	25 %	25 %	25 %	25 %	383188169
4085	NC_016818	CAG	2	6	219091	219096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188169
4086	NC_016818	GCA	2	6	219102	219107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188169
4087	NC_016818	CAC	2	6	219135	219140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188169
4088	NC_016818	TGA	2	6	219182	219187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188169
4089	NC_016818	A	6	6	219187	219192	100 %	0 %	0 %	0 %	383188169
4090	NC_016818	AGC	2	6	219215	219220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188169
4091	NC_016818	GAT	2	6	219225	219230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188169
4092	NC_016818	CTT	2	6	219253	219258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188169
4093	NC_016818	ATT	2	6	219266	219271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188169
4094	NC_016818	ATG	2	6	219290	219295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188169
4095	NC_016818	TGGG	2	8	219341	219348	0 %	25 %	75 %	0 %	383188169
4096	NC_016818	TG	3	6	219360	219365	0 %	50 %	50 %	0 %	383188169
4097	NC_016818	AT	3	6	219439	219444	50 %	50 %	0 %	0 %	383188169
4098	NC_016818	CTG	2	6	219798	219803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188170
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4100	NC_016818	GTT	2	6	219861	219866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188170
4101	NC_016818	CGG	2	6	219884	219889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188170
4102	NC_016818	GGA	2	6	220023	220028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383188170
4103	NC_016818	GCG	2	6	220088	220093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188170
4104	NC_016818	ATGC	2	8	220106	220113	25 %	25 %	25 %	25 %	383188170
4105	NC_016818	AATGT	2	10	220144	220153	40 %	40 %	20 %	0 %	383188170
4106	NC_016818	GC	3	6	220181	220186	0 %	0 %	50 %	50 %	383188170
4107	NC_016818	TCC	2	6	220189	220194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383188170
4108	NC_016818	GC	3	6	220230	220235	0 %	0 %	50 %	50 %	383188170
4109	NC_016818	CTGA	2	8	220251	220258	25 %	25 %	25 %	25 %	383188170
4110	NC_016818	CGG	2	6	220274	220279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188170
4111	NC_016818	CAC	2	6	220353	220358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188170
4112	NC_016818	TCAC	2	8	220378	220385	25 %	25 %	0 %	50 %	383188170
4113	NC_016818	GTGC	2	8	220390	220397	0 %	25 %	50 %	25 %	383188170
4114	NC_016818	TCA	2	6	220478	220483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188170
4115	NC_016818	ATGCCG	2	12	220592	220603	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383188170
4116	NC_016818	CG	3	6	220621	220626	0 %	0 %	50 %	50 %	383188170
4117	NC_016818	TGC	2	6	220672	220677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188170
4118	NC_016818	TGC	2	6	220732	220737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188170
4119	NC_016818	GCG	2	6	220758	220763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188170
4120	NC_016818	CAC	2	6	220767	220772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188170
4121	NC_016818	TGATC	2	10	220853	220862	20 %	40 %	20 %	20 %	383188170
4122	NC_016818	A	6	6	220875	220880	100 %	0 %	0 %	0 %	383188170
4123	NC_016818	CAG	2	6	220947	220952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188170
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4130	NC_016818	CTGA	2	8	221331	221338	25 %	25 %	25 %	25 %	383188170
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4142	NC_016818	CGTG	2	8	221811	221818	0 %	25 %	50 %	25 %	383188171
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4231	NC_016818	GGT	3	9	227306	227314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188175
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4234	NC_016818	CAT	2	6	227384	227389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188175
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4236	NC_016818	CAT	2	6	227507	227512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188175
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4238	NC_016818	CTT	2	6	227717	227722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188175
4239	NC_016818	TTC	2	6	227775	227780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188175
4240	NC_016818	CTGGG	2	10	227838	227847	0 %	20 %	60 %	20 %	383188175
4241	NC_016818	GGT	2	6	227855	227860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188175
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4243	NC_016818	CGG	2	6	228043	228048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188175
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4364	NC_016818	GTT	2	6	235032	235037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188182
4365	NC_016818	CAT	2	6	235098	235103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188182
4366	NC_016818	CTG	2	6	235129	235134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188182
4367	NC_016818	GTC	2	6	235144	235149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188182
4368	NC_016818	GAC	2	6	235151	235156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188182
4369	NC_016818	AGC	2	6	235429	235434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188183
4370	NC_016818	TTC	2	6	235497	235502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188183
4371	NC_016818	GGCA	2	8	235506	235513	25 %	0 %	50 %	25 %	383188183
4372	NC_016818	CTG	2	6	235519	235524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188183
4373	NC_016818	ATA	2	6	235573	235578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188183
4374	NC_016818	CCG	2	6	235579	235584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188183
4375	NC_016818	T	6	6	235628	235633	0 %	100 %	0 %	0 %	383188183
4376	NC_016818	TGGC	2	8	236039	236046	0 %	25 %	50 %	25 %	383188184
4377	NC_016818	GAA	2	6	236085	236090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188184
4378	NC_016818	TCCG	2	8	236107	236114	0 %	25 %	25 %	50 %	383188184
4379	NC_016818	TTC	2	6	236118	236123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188184
4380	NC_016818	CTT	2	6	236152	236157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188184
4381	NC_016818	GC	3	6	236209	236214	0 %	0 %	50 %	50 %	383188184
4382	NC_016818	ATC	2	6	236223	236228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188184
4383	NC_016818	GCG	2	6	236239	236244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188184
4384	NC_016818	GCA	2	6	236307	236312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188184
4385	NC_016818	CT	3	6	236315	236320	0 %	50 %	0 %	50 %	383188184
4386	NC_016818	ATC	2	6	236343	236348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188184
4387	NC_016818	CTGATG	2	12	236433	236444	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383188184
4388	NC_016818	CGG	2	6	236450	236455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188184
4389	NC_016818	GGC	2	6	236504	236509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188184
4390	NC_016818	CGG	2	6	236513	236518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188184
4391	NC_016818	CTG	2	6	236541	236546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188184
4392	NC_016818	TGC	2	6	236560	236565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188184
4393	NC_016818	GGCG	2	8	236684	236691	0 %	0 %	75 %	25 %	383188184
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4397	NC_016818	TCTG	2	8	237041	237048	0 %	50 %	25 %	25 %	383188184
4398	NC_016818	TTC	2	6	237112	237117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188184
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4401	NC_016818	CGT	2	6	237714	237719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188185
4402	NC_016818	TGAT	2	8	237814	237821	25 %	50 %	25 %	0 %	383188185
4403	NC_016818	GCT	2	6	237866	237871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188185
4404	NC_016818	GCC	2	6	238015	238020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188185
4405	NC_016818	CCGT	2	8	238075	238082	0 %	25 %	25 %	50 %	383188185
4406	NC_016818	GC	3	6	238136	238141	0 %	0 %	50 %	50 %	383188185
4407	NC_016818	CGTG	2	8	238186	238193	0 %	25 %	50 %	25 %	383188185
4408	NC_016818	TGT	2	6	238208	238213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188185
4409	NC_016818	AGAA	2	8	238230	238237	75 %	0 %	25 %	0 %	383188185
4410	NC_016818	CGT	2	6	238293	238298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188185
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4413	NC_016818	TCGGT	2	10	238463	238472	0 %	40 %	40 %	20 %	383188185
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4420	NC_016818	ACCA	2	8	238857	238864	50 %	0 %	0 %	50 %	383188185
4421	NC_016818	CGG	2	6	238883	238888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188185
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4427	NC_016818	A	6	6	239220	239225	100 %	0 %	0 %	0 %	383188185
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4457	NC_016818	ATGTC	2	10	240703	240712	20 %	40 %	20 %	20 %	383188186
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4463	NC_016818	ACG	2	6	241047	241052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188186
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4472	NC_016818	GGC	2	6	241439	241444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188186
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4476	NC_016818	GCC	2	6	241591	241596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188186
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4479	NC_016818	GCA	2	6	241685	241690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188186
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4483	NC_016818	GCA	2	6	242001	242006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188187
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4485	NC_016818	GAA	2	6	242035	242040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188187
4486	NC_016818	CCG	2	6	242108	242113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188187
4487	NC_016818	CCG	2	6	242142	242147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188187
4488	NC_016818	ACT	2	6	242201	242206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188187
4489	NC_016818	GCCT	2	8	242254	242261	0 %	25 %	25 %	50 %	383188187
4490	NC_016818	CG	3	6	242270	242275	0 %	0 %	50 %	50 %	383188187
4491	NC_016818	ATCAC	2	10	242318	242327	40 %	20 %	0 %	40 %	383188187
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4498	NC_016818	ATCTGG	2	12	242618	242629	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383188187
4499	NC_016818	GCC	2	6	242697	242702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188187
4500	NC_016818	TGG	2	6	242756	242761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188187

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