MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 86201

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016818	GGC	2	6	185054	185059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188134
3502	NC_016818	TGA	2	6	185060	185065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188134
3503	NC_016818	TCTG	2	8	185099	185106	0 %	50 %	25 %	25 %	383188134
3504	NC_016818	CG	3	6	185120	185125	0 %	0 %	50 %	50 %	383188134
3505	NC_016818	AAC	2	6	185129	185134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188134
3506	NC_016818	TCG	2	6	185180	185185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188134
3507	NC_016818	ACG	2	6	185203	185208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188134
3508	NC_016818	CAC	2	6	185325	185330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188134
3509	NC_016818	CAC	2	6	185355	185360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188134
3510	NC_016818	TTGTGG	2	12	185371	185382	0 %	50 %	50 %	0 %	383188134
3511	NC_016818	GTG	2	6	185470	185475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188134
3512	NC_016818	GGC	2	6	185647	185652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188134
3513	NC_016818	ATCTGG	2	12	185666	185677	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383188134
3514	NC_016818	CTG	3	9	185746	185754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188134
3515	NC_016818	TGAT	2	8	185786	185793	25 %	50 %	25 %	0 %	383188134
3516	NC_016818	CAG	2	6	185794	185799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188134
3517	NC_016818	GC	4	8	185829	185836	0 %	0 %	50 %	50 %	383188134
3518	NC_016818	GCT	2	6	185865	185870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188134
3519	NC_016818	CTG	2	6	185893	185898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188134
3520	NC_016818	AGA	2	6	185919	185924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188134
3521	NC_016818	CGG	2	6	186042	186047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188134
3522	NC_016818	CAGCGT	2	12	186049	186060	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383188134
3523	NC_016818	GCG	2	6	186145	186150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188134
3524	NC_016818	GGC	2	6	186178	186183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188134
3525	NC_016818	CGA	2	6	186215	186220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188134
3526	NC_016818	CTG	2	6	186289	186294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188134
3527	NC_016818	CGG	2	6	186300	186305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188134
3528	NC_016818	GC	3	6	186313	186318	0 %	0 %	50 %	50 %	383188134
3529	NC_016818	CGG	2	6	186336	186341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188134
3530	NC_016818	CGT	2	6	186378	186383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188135
3531	NC_016818	GCA	2	6	186393	186398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188135
3532	NC_016818	CGG	2	6	186429	186434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188135
3533	NC_016818	TTC	2	6	186439	186444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188135
3534	NC_016818	GCA	2	6	186528	186533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188135
3535	NC_016818	GC	3	6	186565	186570	0 %	0 %	50 %	50 %	383188135
3536	NC_016818	ATGCC	2	10	186591	186600	20 %	20 %	20 %	40 %	383188135
3537	NC_016818	CAG	2	6	186763	186768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188135
3538	NC_016818	GAA	2	6	186772	186777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188135
3539	NC_016818	TGAC	2	8	186796	186803	25 %	25 %	25 %	25 %	383188135
3540	NC_016818	GC	3	6	186867	186872	0 %	0 %	50 %	50 %	383188135
3541	NC_016818	CCAG	2	8	186876	186883	25 %	0 %	25 %	50 %	383188135
3542	NC_016818	TGC	2	6	187022	187027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188135
3543	NC_016818	GC	3	6	187058	187063	0 %	0 %	50 %	50 %	383188135
3544	NC_016818	TCG	2	6	187064	187069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188135
3545	NC_016818	GC	3	6	187083	187088	0 %	0 %	50 %	50 %	383188135
3546	NC_016818	GCA	2	6	187142	187147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188135
3547	NC_016818	CTC	2	6	187150	187155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383188135
3548	NC_016818	CAG	2	6	187159	187164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188135
3549	NC_016818	CG	3	6	187166	187171	0 %	0 %	50 %	50 %	383188135
3550	NC_016818	GGC	2	6	187306	187311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188135
3551	NC_016818	AGA	2	6	187337	187342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188135
3552	NC_016818	TGC	2	6	187343	187348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188135
3553	NC_016818	GT	3	6	187828	187833	0 %	50 %	50 %	0 %	383188136
3554	NC_016818	ACG	2	6	187856	187861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188136
3555	NC_016818	CGC	2	6	188088	188093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188136
3556	NC_016818	GGC	2	6	188111	188116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188136
3557	NC_016818	AACA	2	8	188140	188147	75 %	0 %	0 %	25 %	383188136
3558	NC_016818	TG	3	6	188165	188170	0 %	50 %	50 %	0 %	383188136
3559	NC_016818	T	6	6	188242	188247	0 %	100 %	0 %	0 %	383188136
3560	NC_016818	GGC	2	6	188564	188569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188137
3561	NC_016818	CGG	2	6	188638	188643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188137
3562	NC_016818	CGT	2	6	188645	188650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188137
3563	NC_016818	CCGAAT	2	12	188651	188662	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383188137
3564	NC_016818	CTG	2	6	188747	188752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188137
3565	NC_016818	GC	4	8	188881	188888	0 %	0 %	50 %	50 %	383188137
3566	NC_016818	GCA	2	6	188986	188991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188137
3567	NC_016818	CCG	2	6	189017	189022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188137
3568	NC_016818	CAG	2	6	189071	189076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188137
3569	NC_016818	TTC	2	6	189153	189158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188138
3570	NC_016818	CAC	2	6	189207	189212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188138
3571	NC_016818	GCC	2	6	189247	189252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188138
3572	NC_016818	ATC	2	6	189322	189327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188138
3573	NC_016818	TGC	2	6	189483	189488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188139
3574	NC_016818	T	6	6	189502	189507	0 %	100 %	0 %	0 %	383188139
3575	NC_016818	TCA	2	6	189577	189582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188139
3576	NC_016818	CAG	2	6	189633	189638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188139
3577	NC_016818	CTG	2	6	189659	189664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188139
3578	NC_016818	GGC	2	6	189714	189719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188139
3579	NC_016818	GT	3	6	189748	189753	0 %	50 %	50 %	0 %	383188139
3580	NC_016818	GAA	2	6	189797	189802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188140
3581	NC_016818	TGA	2	6	189835	189840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188140
3582	NC_016818	CAG	2	6	189884	189889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188140
3583	NC_016818	GCA	2	6	189892	189897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188140
3584	NC_016818	GCAG	2	8	189903	189910	25 %	0 %	50 %	25 %	383188140
3585	NC_016818	CCG	2	6	189939	189944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188140
3586	NC_016818	GCGCC	2	10	189951	189960	0 %	0 %	40 %	60 %	383188140
3587	NC_016818	CCG	2	6	189963	189968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188140
3588	NC_016818	GAA	2	6	190004	190009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188140
3589	NC_016818	ATC	2	6	190032	190037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188140
3590	NC_016818	TGG	3	9	190084	190092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188140
3591	NC_016818	CAG	2	6	190235	190240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188140
3592	NC_016818	CGA	2	6	190318	190323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188140
3593	NC_016818	ATC	2	6	190365	190370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188140
3594	NC_016818	ACC	2	6	190371	190376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188140
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3596	NC_016818	AGGT	2	8	190386	190393	25 %	25 %	50 %	0 %	383188140
3597	NC_016818	CGCC	2	8	190471	190478	0 %	0 %	25 %	75 %	383188140
3598	NC_016818	ATC	2	6	190520	190525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188140
3599	NC_016818	AAT	2	6	190592	190597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188140
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3601	NC_016818	AC	3	6	190655	190660	50 %	0 %	0 %	50 %	383188140
3602	NC_016818	TAAT	2	8	190756	190763	50 %	50 %	0 %	0 %	383188140
3603	NC_016818	A	6	6	190911	190916	100 %	0 %	0 %	0 %	383188140
3604	NC_016818	CAG	2	6	190919	190924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188140
3605	NC_016818	TAA	2	6	190942	190947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188140
3606	NC_016818	TTA	2	6	191126	191131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188141
3607	NC_016818	GAA	2	6	191155	191160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188141
3608	NC_016818	ATA	2	6	191214	191219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188141
3609	NC_016818	ATA	2	6	191271	191276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188141
3610	NC_016818	CTG	2	6	191382	191387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188141
3611	NC_016818	CCGCA	2	10	191395	191404	20 %	0 %	20 %	60 %	383188141
3612	NC_016818	TCA	2	6	191428	191433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188141
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3614	NC_016818	CCGG	2	8	191733	191740	0 %	0 %	50 %	50 %	383188142
3615	NC_016818	ATA	2	6	191773	191778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188142
3616	NC_016818	CATAT	2	10	191797	191806	40 %	40 %	0 %	20 %	383188142
3617	NC_016818	ATA	2	6	191939	191944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188142
3618	NC_016818	TATT	2	8	192144	192151	25 %	75 %	0 %	0 %	383188143
3619	NC_016818	TG	3	6	192157	192162	0 %	50 %	50 %	0 %	383188143
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3621	NC_016818	CAA	2	6	192194	192199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188143
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3853	NC_016818	A	6	6	204934	204939	100 %	0 %	0 %	0 %	383188156
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3879	NC_016818	GCTG	2	8	206283	206290	0 %	25 %	50 %	25 %	383188156
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3886	NC_016818	TG	3	6	206624	206629	0 %	50 %	50 %	0 %	383188157
3887	NC_016818	AAG	2	6	206630	206635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188157
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3895	NC_016818	GCT	2	6	207051	207056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188157
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3973	NC_016818	CCGGC	2	10	211926	211935	0 %	0 %	40 %	60 %	383188162
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3983	NC_016818	AAT	2	6	212414	212419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188162
3984	NC_016818	AATA	2	8	212435	212442	75 %	25 %	0 %	0 %	383188162
3985	NC_016818	TG	3	6	212621	212626	0 %	50 %	50 %	0 %	383188163
3986	NC_016818	A	6	6	212730	212735	100 %	0 %	0 %	0 %	383188163
3987	NC_016818	CAT	2	6	213355	213360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188164
3988	NC_016818	GGA	2	6	213409	213414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383188164
3989	NC_016818	GAC	2	6	213458	213463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188164
3990	NC_016818	TGG	2	6	213465	213470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188164
3991	NC_016818	CGGCC	2	10	213541	213550	0 %	0 %	40 %	60 %	383188164
3992	NC_016818	GTT	2	6	213610	213615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188164
3993	NC_016818	TCGGT	2	10	213621	213630	0 %	40 %	40 %	20 %	383188164
3994	NC_016818	AGT	2	6	213652	213657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188164
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3996	NC_016818	A	6	6	213718	213723	100 %	0 %	0 %	0 %	383188164
3997	NC_016818	CTG	2	6	213758	213763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188164
3998	NC_016818	TA	3	6	213840	213845	50 %	50 %	0 %	0 %	383188164
3999	NC_016818	GTC	2	6	213898	213903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188164
4000	NC_016818	TTA	2	6	213917	213922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188164

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