MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 86201

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016818	TGA	2	6	158910	158915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188111
3002	NC_016818	TGG	2	6	158921	158926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188111
3003	NC_016818	GC	3	6	158958	158963	0 %	0 %	50 %	50 %	383188111
3004	NC_016818	GCA	2	6	159026	159031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188111
3005	NC_016818	GCC	2	6	159146	159151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188111
3006	NC_016818	CGC	2	6	159162	159167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188111
3007	NC_016818	GCT	2	6	159192	159197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188111
3008	NC_016818	GCCA	2	8	159307	159314	25 %	0 %	25 %	50 %	383188111
3009	NC_016818	A	6	6	159317	159322	100 %	0 %	0 %	0 %	383188111
3010	NC_016818	CG	3	6	159330	159335	0 %	0 %	50 %	50 %	383188111
3011	NC_016818	GCG	2	6	159370	159375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188111
3012	NC_016818	TGC	2	6	159413	159418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188111
3013	NC_016818	CCG	2	6	159534	159539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188111
3014	NC_016818	ATA	2	6	159751	159756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188112
3015	NC_016818	TG	3	6	159775	159780	0 %	50 %	50 %	0 %	383188112
3016	NC_016818	TTC	2	6	159793	159798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188112
3017	NC_016818	ATT	2	6	159821	159826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188112
3018	NC_016818	AGA	2	6	160023	160028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188113
3019	NC_016818	CGG	3	9	160056	160064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188113
3020	NC_016818	TGG	2	6	160127	160132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188113
3021	NC_016818	AAC	2	6	160174	160179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188113
3022	NC_016818	TGC	2	6	160325	160330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188113
3023	NC_016818	TCA	2	6	160346	160351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188113
3024	NC_016818	CGC	2	6	160358	160363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188113
3025	NC_016818	TG	3	6	160374	160379	0 %	50 %	50 %	0 %	383188113
3026	NC_016818	TGA	2	6	160383	160388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188113
3027	NC_016818	CAA	2	6	160426	160431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188113
3028	NC_016818	AGA	2	6	160461	160466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188113
3029	NC_016818	GGC	2	6	160530	160535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188113
3030	NC_016818	TGG	2	6	160589	160594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188113
3031	NC_016818	A	6	6	160606	160611	100 %	0 %	0 %	0 %	383188113
3032	NC_016818	AAAG	2	8	160711	160718	75 %	0 %	25 %	0 %	383188113
3033	NC_016818	TCA	2	6	160721	160726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188113
3034	NC_016818	GCT	2	6	160770	160775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188113
3035	NC_016818	GGC	2	6	160810	160815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188113
3036	NC_016818	GTG	2	6	160858	160863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188113
3037	NC_016818	CCG	2	6	160909	160914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188113
3038	NC_016818	CTG	2	6	160963	160968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188113
3039	NC_016818	CAT	2	6	161052	161057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188113
3040	NC_016818	GTCA	2	8	161107	161114	25 %	25 %	25 %	25 %	383188113
3041	NC_016818	CT	3	6	161122	161127	0 %	50 %	0 %	50 %	383188113
3042	NC_016818	GAT	2	6	161128	161133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188113
3043	NC_016818	GAA	2	6	161172	161177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188113
3044	NC_016818	AGA	2	6	161178	161183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188113
3045	NC_016818	ATC	2	6	161218	161223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188113
3046	NC_016818	A	6	6	161224	161229	100 %	0 %	0 %	0 %	383188113
3047	NC_016818	GGC	2	6	161242	161247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188113
3048	NC_016818	GCA	2	6	161288	161293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188113
3049	NC_016818	CTG	2	6	161302	161307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188113
3050	NC_016818	CGG	2	6	161330	161335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188113
3051	NC_016818	ATC	2	6	161416	161421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188113
3052	NC_016818	CTT	2	6	161423	161428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188113
3053	NC_016818	GGC	2	6	161454	161459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188113
3054	NC_016818	AC	3	6	161797	161802	50 %	0 %	0 %	50 %	383188114
3055	NC_016818	GAA	2	6	161868	161873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188114
3056	NC_016818	TGC	2	6	161944	161949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188114
3057	NC_016818	CCG	2	6	162040	162045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188114
3058	NC_016818	GCT	2	6	162086	162091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188114
3059	NC_016818	GTG	2	6	162141	162146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188114
3060	NC_016818	GACC	2	8	162245	162252	25 %	0 %	25 %	50 %	383188114
3061	NC_016818	CGC	2	6	162505	162510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188114
3062	NC_016818	GC	3	6	162520	162525	0 %	0 %	50 %	50 %	383188114
3063	NC_016818	GCGCC	2	10	162535	162544	0 %	0 %	40 %	60 %	383188114
3064	NC_016818	CGC	3	9	162605	162613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188114
3065	NC_016818	CAC	2	6	162686	162691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188114
3066	NC_016818	TCG	2	6	162778	162783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188114
3067	NC_016818	CCG	2	6	162864	162869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188114
3068	NC_016818	CGG	2	6	163040	163045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188114
3069	NC_016818	ACGGCT	2	12	163048	163059	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383188114
3070	NC_016818	CGG	2	6	163106	163111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188114
3071	NC_016818	CGC	3	9	163133	163141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188114
3072	NC_016818	GGA	2	6	163232	163237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383188114
3073	NC_016818	GAG	2	6	163248	163253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383188114
3074	NC_016818	TCG	2	6	163306	163311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188114
3075	NC_016818	CGCGC	2	10	163322	163331	0 %	0 %	40 %	60 %	383188114
3076	NC_016818	GCG	2	6	163375	163380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188114
3077	NC_016818	CGCAGG	2	12	163414	163425	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	383188114
3078	NC_016818	GCC	2	6	163500	163505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188114
3079	NC_016818	GGT	2	6	163583	163588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188114
3080	NC_016818	GCG	2	6	163624	163629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188114
3081	NC_016818	GGC	2	6	163643	163648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188114
3082	NC_016818	A	6	6	163676	163681	100 %	0 %	0 %	0 %	383188114
3083	NC_016818	AAC	2	6	163803	163808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188114
3084	NC_016818	GGC	2	6	163820	163825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188114
3085	NC_016818	A	6	6	163830	163835	100 %	0 %	0 %	0 %	383188114
3086	NC_016818	CGG	2	6	163846	163851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188114
3087	NC_016818	ACGGC	2	10	163942	163951	20 %	0 %	40 %	40 %	383188114
3088	NC_016818	CGC	2	6	163972	163977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188114
3089	NC_016818	CTTA	2	8	164072	164079	25 %	50 %	0 %	25 %	383188114
3090	NC_016818	TTATTT	2	12	164171	164182	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383188115
3091	NC_016818	CA	3	6	164336	164341	50 %	0 %	0 %	50 %	383188115
3092	NC_016818	AC	3	6	164353	164358	50 %	0 %	0 %	50 %	383188115
3093	NC_016818	GCG	2	6	164409	164414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188115
3094	NC_016818	ACT	2	6	164454	164459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188115
3095	NC_016818	GGT	2	6	164554	164559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188115
3096	NC_016818	CTG	2	6	164595	164600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188115
3097	NC_016818	GAA	2	6	164646	164651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188115
3098	NC_016818	TGCC	2	8	164713	164720	0 %	25 %	25 %	50 %	383188115
3099	NC_016818	TCC	2	6	164732	164737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383188115
3100	NC_016818	TTA	2	6	164828	164833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188115
3101	NC_016818	CGG	2	6	164840	164845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188115
3102	NC_016818	GAA	2	6	164846	164851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188115
3103	NC_016818	GGAA	2	8	164864	164871	50 %	0 %	50 %	0 %	383188115
3104	NC_016818	AGA	2	6	164994	164999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188116
3105	NC_016818	TGT	2	6	165037	165042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188116
3106	NC_016818	TAA	2	6	165140	165145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188116
3107	NC_016818	GGT	2	6	165195	165200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188116
3108	NC_016818	T	6	6	165228	165233	0 %	100 %	0 %	0 %	383188116
3109	NC_016818	ATT	2	6	165235	165240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188116
3110	NC_016818	AT	3	6	165250	165255	50 %	50 %	0 %	0 %	383188116
3111	NC_016818	ATC	2	6	165327	165332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188116
3112	NC_016818	TAAT	2	8	165353	165360	50 %	50 %	0 %	0 %	383188116
3113	NC_016818	GGA	2	6	165363	165368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383188116
3114	NC_016818	TA	3	6	165385	165390	50 %	50 %	0 %	0 %	383188116
3115	NC_016818	T	6	6	165403	165408	0 %	100 %	0 %	0 %	383188116
3116	NC_016818	TGT	2	6	165544	165549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188117
3117	NC_016818	TGG	2	6	165582	165587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188117
3118	NC_016818	TTG	2	6	165728	165733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188117
3119	NC_016818	GGC	2	6	165753	165758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188117
3120	NC_016818	TC	3	6	165761	165766	0 %	50 %	0 %	50 %	383188117
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3122	NC_016818	TTA	2	6	165844	165849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188117
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3483	NC_016818	TGGCG	2	10	184152	184161	0 %	20 %	60 %	20 %	383188133
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3485	NC_016818	TGC	2	6	184187	184192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188133
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3487	NC_016818	ATT	2	6	184289	184294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188133
3488	NC_016818	CGTG	2	8	184340	184347	0 %	25 %	50 %	25 %	383188133
3489	NC_016818	TGC	2	6	184349	184354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188133
3490	NC_016818	GAA	2	6	184395	184400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188133
3491	NC_016818	GCC	2	6	184566	184571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188134
3492	NC_016818	TAT	2	6	184597	184602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188134
3493	NC_016818	TGG	3	9	184637	184645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188134
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3495	NC_016818	AC	3	6	184715	184720	50 %	0 %	0 %	50 %	383188134
3496	NC_016818	T	6	6	184731	184736	0 %	100 %	0 %	0 %	383188134
3497	NC_016818	ATGG	2	8	184761	184768	25 %	25 %	50 %	0 %	383188134
3498	NC_016818	CGG	2	6	184769	184774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188134
3499	NC_016818	GAT	2	6	184779	184784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188134
3500	NC_016818	CGC	2	6	185016	185021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188134

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