MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 86201

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016818	GAT	2	6	25965	25970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383187990
502	NC_016818	GAT	2	6	25974	25979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383187990
503	NC_016818	GCTC	2	8	26083	26090	0 %	25 %	25 %	50 %	383187990
504	NC_016818	CGC	2	6	26109	26114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383187990
505	NC_016818	ACC	2	6	26130	26135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383187990
506	NC_016818	ACGG	2	8	26154	26161	25 %	0 %	50 %	25 %	383187990
507	NC_016818	CGG	2	6	26171	26176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187990
508	NC_016818	CAG	2	6	26255	26260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187990
509	NC_016818	CAA	2	6	26285	26290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383187990
510	NC_016818	TGGC	2	8	26345	26352	0 %	25 %	50 %	25 %	383187990
511	NC_016818	CAC	2	6	26432	26437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383187990
512	NC_016818	CACCCG	2	12	26453	26464	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	383187990
513	NC_016818	ACC	2	6	26475	26480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383187990
514	NC_016818	GAC	3	9	26490	26498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187990
515	NC_016818	ACC	2	6	26571	26576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383187990
516	NC_016818	ATT	2	6	26852	26857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383187991
517	NC_016818	GCA	2	6	26862	26867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187991
518	NC_016818	GC	3	6	26937	26942	0 %	0 %	50 %	50 %	383187991
519	NC_016818	CGC	2	6	26986	26991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383187991
520	NC_016818	GCA	2	6	27030	27035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187991
521	NC_016818	TAT	2	6	27037	27042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383187991
522	NC_016818	TGA	2	6	27053	27058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383187991
523	NC_016818	ACTT	2	8	27235	27242	25 %	50 %	0 %	25 %	383187991
524	NC_016818	CAG	2	6	27244	27249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187991
525	NC_016818	GGC	2	6	27253	27258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187991
526	NC_016818	TCTGG	2	10	27345	27354	0 %	40 %	40 %	20 %	383187991
527	NC_016818	AAG	2	6	27482	27487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383187991
528	NC_016818	CTG	2	6	27496	27501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187991
529	NC_016818	CG	3	6	27576	27581	0 %	0 %	50 %	50 %	383187991
530	NC_016818	A	6	6	27731	27736	100 %	0 %	0 %	0 %	383187992
531	NC_016818	TGG	2	6	27743	27748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383187992
532	NC_016818	GAA	2	6	27760	27765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383187992
533	NC_016818	GCG	2	6	27832	27837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187992
534	NC_016818	GCC	2	6	27868	27873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383187992
535	NC_016818	GC	3	6	28100	28105	0 %	0 %	50 %	50 %	383187992
536	NC_016818	AAC	2	6	28106	28111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383187992
537	NC_016818	TGC	2	6	28112	28117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187992
538	NC_016818	GAT	2	6	28122	28127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383187992
539	NC_016818	CTG	2	6	28219	28224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187992
540	NC_016818	CTG	2	6	28348	28353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187992
541	NC_016818	CTG	2	6	28462	28467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187992
542	NC_016818	GAA	2	6	28468	28473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383187992
543	NC_016818	GGT	2	6	28497	28502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383187992
544	NC_016818	ACG	2	6	28595	28600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187992
545	NC_016818	GCA	2	6	28659	28664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187992
546	NC_016818	GTG	2	6	28687	28692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383187992
547	NC_016818	TTC	3	9	28717	28725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383187992
548	NC_016818	A	6	6	28738	28743	100 %	0 %	0 %	0 %	383187992
549	NC_016818	ACCG	2	8	28816	28823	25 %	0 %	25 %	50 %	383187992
550	NC_016818	CTGG	2	8	28838	28845	0 %	25 %	50 %	25 %	383187992
551	NC_016818	CTG	2	6	28894	28899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187992
552	NC_016818	TGA	2	6	28913	28918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383187992
553	NC_016818	ACG	2	6	28979	28984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187992
554	NC_016818	GAA	2	6	28993	28998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383187992
555	NC_016818	GAAC	2	8	29013	29020	50 %	0 %	25 %	25 %	383187992
556	NC_016818	CGA	2	6	29043	29048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187992
557	NC_016818	GC	3	6	29072	29077	0 %	0 %	50 %	50 %	383187992
558	NC_016818	CGT	2	6	29164	29169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187992
559	NC_016818	GAA	2	6	29236	29241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383187992
560	NC_016818	CG	3	6	29320	29325	0 %	0 %	50 %	50 %	383187992
561	NC_016818	GAA	2	6	29335	29340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383187992
562	NC_016818	GCTG	2	8	29457	29464	0 %	25 %	50 %	25 %	383187992
563	NC_016818	CAA	2	6	29469	29474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383187992
564	NC_016818	CTG	2	6	29512	29517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187992
565	NC_016818	CTG	2	6	29549	29554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187992
566	NC_016818	TGG	2	6	29576	29581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383187992
567	NC_016818	TGC	2	6	29582	29587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187992
568	NC_016818	AAG	2	6	29627	29632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383187992
569	NC_016818	TGG	2	6	29636	29641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383187992
570	NC_016818	GATG	2	8	29694	29701	25 %	25 %	50 %	0 %	383187992
571	NC_016818	GCT	2	6	29733	29738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187992
572	NC_016818	GTT	2	6	29754	29759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383187992
573	NC_016818	GCT	2	6	29781	29786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187992
574	NC_016818	GCTG	2	8	30287	30294	0 %	25 %	50 %	25 %	383187993
575	NC_016818	CTG	2	6	30310	30315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187993
576	NC_016818	GTG	2	6	30316	30321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383187993
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580	NC_016818	CAT	2	6	30474	30479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383187993
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583	NC_016818	CAGCG	2	10	30580	30589	20 %	0 %	40 %	40 %	383187993
584	NC_016818	GGC	2	6	30600	30605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187993
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587	NC_016818	CGC	2	6	30755	30760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383187993
588	NC_016818	CAG	2	6	30820	30825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187993
589	NC_016818	GCA	2	6	30870	30875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187993
590	NC_016818	ACA	2	6	30890	30895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383187993
591	NC_016818	ATG	2	6	30898	30903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383187993
592	NC_016818	TGG	2	6	30911	30916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383187993
593	NC_016818	CAG	2	6	30922	30927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187993
594	NC_016818	CTG	2	6	31400	31405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187994
595	NC_016818	GAAA	2	8	31406	31413	75 %	0 %	25 %	0 %	383187994
596	NC_016818	TAT	2	6	31472	31477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383187994
597	NC_016818	GTGCG	2	10	31519	31528	0 %	20 %	60 %	20 %	383187994
598	NC_016818	GCT	2	6	31552	31557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187994
599	NC_016818	TGA	2	6	31690	31695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383187994
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601	NC_016818	TTA	2	6	31744	31749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383187994
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603	NC_016818	TTA	2	6	31878	31883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383187995
604	NC_016818	ATT	2	6	31888	31893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383187995
605	NC_016818	TATT	2	8	31955	31962	25 %	75 %	0 %	0 %	383187995
606	NC_016818	TGA	2	6	31968	31973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383187995
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608	NC_016818	GGT	2	6	32102	32107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383187995
609	NC_016818	CGG	2	6	32151	32156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187995
610	NC_016818	AAT	2	6	32174	32179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383187995
611	NC_016818	TGC	2	6	32202	32207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187995
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614	NC_016818	AAT	2	6	32255	32260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383187995
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620	NC_016818	TGG	2	6	32430	32435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383187995
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624	NC_016818	CGG	2	6	32539	32544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187995
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993	NC_016818	GCGG	2	8	53691	53698	0 %	0 %	75 %	25 %	383188015
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999	NC_016818	GC	4	8	54015	54022	0 %	0 %	50 %	50 %	383188015
1000	NC_016818	GCTC	2	8	54040	54047	0 %	25 %	25 %	50 %	383188015

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