MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 86201

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016818	ATT	2	6	327234	327239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188257
6002	NC_016818	A	6	6	327330	327335	100 %	0 %	0 %	0 %	383188257
6003	NC_016818	CCAA	2	8	327366	327373	50 %	0 %	0 %	50 %	383188257
6004	NC_016818	CGT	2	6	327440	327445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188257
6005	NC_016818	GCT	2	6	327500	327505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188257
6006	NC_016818	GTTAC	2	10	327541	327550	20 %	40 %	20 %	20 %	383188257
6007	NC_016818	AAC	2	6	327616	327621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188257
6008	NC_016818	AAT	2	6	327763	327768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188257
6009	NC_016818	GAA	2	6	327870	327875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188258
6010	NC_016818	GCA	2	6	327888	327893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188258
6011	NC_016818	CAG	2	6	327936	327941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188258
6012	NC_016818	GAG	2	6	328014	328019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383188258
6013	NC_016818	TTA	3	9	328057	328065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188259
6014	NC_016818	GAA	2	6	328106	328111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188259
6015	NC_016818	GC	3	6	328150	328155	0 %	0 %	50 %	50 %	383188259
6016	NC_016818	TG	3	6	328200	328205	0 %	50 %	50 %	0 %	383188259
6017	NC_016818	GAA	3	9	328343	328351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188259
6018	NC_016818	ATT	2	6	328401	328406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188259
6019	NC_016818	CTG	2	6	328421	328426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188259
6020	NC_016818	TCAT	2	8	328482	328489	25 %	50 %	0 %	25 %	383188259
6021	NC_016818	GCTG	2	8	328530	328537	0 %	25 %	50 %	25 %	383188259
6022	NC_016818	TGA	2	6	328564	328569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188259
6023	NC_016818	TGG	2	6	328578	328583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188259
6024	NC_016818	TGT	2	6	328597	328602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188259
6025	NC_016818	TGC	3	9	328705	328713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188260
6026	NC_016818	TGA	2	6	328871	328876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188260
6027	NC_016818	AAT	2	6	329058	329063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188260
6028	NC_016818	TGG	2	6	329092	329097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188260
6029	NC_016818	GAC	2	6	329163	329168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188260
6030	NC_016818	CAT	2	6	329177	329182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188260
6031	NC_016818	TGAG	2	8	329233	329240	25 %	25 %	50 %	0 %	383188260
6032	NC_016818	ATTC	2	8	329474	329481	25 %	50 %	0 %	25 %	383188261
6033	NC_016818	GCCC	2	8	329651	329658	0 %	0 %	25 %	75 %	383188261
6034	NC_016818	TTC	2	6	329706	329711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188261
6035	NC_016818	GC	3	6	329754	329759	0 %	0 %	50 %	50 %	383188261
6036	NC_016818	ATC	2	6	329799	329804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188261
6037	NC_016818	GTT	2	6	329834	329839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188261
6038	NC_016818	GTGG	2	8	329850	329857	0 %	25 %	75 %	0 %	383188261
6039	NC_016818	CGA	2	6	329948	329953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188261
6040	NC_016818	TTG	2	6	329968	329973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188261
6041	NC_016818	CCA	2	6	330010	330015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188261
6042	NC_016818	AACA	2	8	330048	330055	75 %	0 %	0 %	25 %	383188261
6043	NC_016818	GCT	2	6	330062	330067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188261
6044	NC_016818	GTT	2	6	330110	330115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188261
6045	NC_016818	CGG	2	6	330170	330175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188261
6046	NC_016818	GAA	2	6	330207	330212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188261
6047	NC_016818	CAC	2	6	330245	330250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188261
6048	NC_016818	CGG	2	6	330254	330259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188261
6049	NC_016818	ATC	2	6	330300	330305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188261
6050	NC_016818	CTGG	2	8	330321	330328	0 %	25 %	50 %	25 %	383188261
6051	NC_016818	TCA	2	6	330352	330357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188261
6052	NC_016818	ATCA	2	8	330372	330379	50 %	25 %	0 %	25 %	383188261
6053	NC_016818	ATATC	2	10	330383	330392	40 %	40 %	0 %	20 %	383188261
6054	NC_016818	GCT	2	6	330416	330421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188261
6055	NC_016818	GCC	4	12	330474	330485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188261
6056	NC_016818	TGA	2	6	330496	330501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188261
6057	NC_016818	GAA	2	6	330567	330572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188261
6058	NC_016818	G	6	6	330612	330617	0 %	0 %	100 %	0 %	383188261
6059	NC_016818	TTCACG	2	12	331283	331294	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383188262
6060	NC_016818	CGC	2	6	331297	331302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188262
6061	NC_016818	ATG	2	6	331317	331322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188262
6062	NC_016818	CGC	2	6	331384	331389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188262
6063	NC_016818	GCCCG	2	10	331461	331470	0 %	0 %	40 %	60 %	383188262
6064	NC_016818	AGC	2	6	331477	331482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188262
6065	NC_016818	GCA	2	6	331547	331552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188262
6066	NC_016818	TG	3	6	331700	331705	0 %	50 %	50 %	0 %	383188262
6067	NC_016818	AGC	2	6	331762	331767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188262
6068	NC_016818	GCA	2	6	331817	331822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188262
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6070	NC_016818	CCGTCA	2	12	331955	331966	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383188262
6071	NC_016818	ACA	2	6	332012	332017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188262
6072	NC_016818	CAG	2	6	332025	332030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188262
6073	NC_016818	GTG	2	6	332044	332049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188262
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6080	NC_016818	GA	3	6	332284	332289	50 %	0 %	50 %	0 %	383188262
6081	NC_016818	TCA	2	6	332333	332338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188262
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6083	NC_016818	CG	3	6	332377	332382	0 %	0 %	50 %	50 %	383188262
6084	NC_016818	TAA	2	6	332398	332403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188262
6085	NC_016818	CG	3	6	332434	332439	0 %	0 %	50 %	50 %	383188262
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6088	NC_016818	TCC	2	6	332602	332607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383188262
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6091	NC_016818	CGG	2	6	332772	332777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188262
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6102	NC_016818	CAG	2	6	333243	333248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188262
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6114	NC_016818	CGTG	2	8	334608	334615	0 %	25 %	50 %	25 %	383188264
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6118	NC_016818	GCGCC	2	10	334654	334663	0 %	0 %	40 %	60 %	383188264
6119	NC_016818	CCA	2	6	334790	334795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188264
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6480	NC_016818	CAGC	2	8	352399	352406	25 %	0 %	25 %	50 %	383188279
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6483	NC_016818	GCGG	2	8	352508	352515	0 %	0 %	75 %	25 %	383188279
6484	NC_016818	GAG	2	6	352541	352546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383188279
6485	NC_016818	ATG	2	6	352574	352579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188279
6486	NC_016818	GCCT	2	8	352610	352617	0 %	25 %	25 %	50 %	383188279
6487	NC_016818	GCG	2	6	352630	352635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188279
6488	NC_016818	TGG	2	6	352638	352643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188279
6489	NC_016818	CGC	2	6	352656	352661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188279
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6491	NC_016818	GTTT	2	8	352865	352872	0 %	75 %	25 %	0 %	383188280
6492	NC_016818	GATGG	2	10	352947	352956	20 %	20 %	60 %	0 %	383188280
6493	NC_016818	GTC	2	6	352991	352996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188280
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6499	NC_016818	CGGT	2	8	353330	353337	0 %	25 %	50 %	25 %	383188280
6500	NC_016818	T	6	6	353341	353346	0 %	100 %	0 %	0 %	383188280

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