MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 86201

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016818	TGG	2	6	296989	296994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188232
5502	NC_016818	GC	3	6	297014	297019	0 %	0 %	50 %	50 %	383188232
5503	NC_016818	CTGA	2	8	297036	297043	25 %	25 %	25 %	25 %	383188232
5504	NC_016818	GAA	2	6	297225	297230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188232
5505	NC_016818	CGA	2	6	297263	297268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188232
5506	NC_016818	GAA	2	6	297366	297371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188232
5507	NC_016818	GTG	2	6	297454	297459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188232
5508	NC_016818	TGA	2	6	297520	297525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188232
5509	NC_016818	AGA	3	9	297602	297610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188232
5510	NC_016818	TTA	2	6	297731	297736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188233
5511	NC_016818	GAC	2	6	297766	297771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188233
5512	NC_016818	TGG	2	6	297777	297782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188233
5513	NC_016818	GCA	2	6	297811	297816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188233
5514	NC_016818	TGA	2	6	297852	297857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188233
5515	NC_016818	TCG	2	6	297910	297915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188233
5516	NC_016818	GCA	2	6	297988	297993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188233
5517	NC_016818	TCAG	2	8	298005	298012	25 %	25 %	25 %	25 %	383188233
5518	NC_016818	GCA	2	6	298021	298026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188233
5519	NC_016818	TGG	2	6	298030	298035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188233
5520	NC_016818	GGT	2	6	298075	298080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188233
5521	NC_016818	TGG	2	6	298198	298203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188233
5522	NC_016818	TAT	2	6	298279	298284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188233
5523	NC_016818	GCC	2	6	298352	298357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188233
5524	NC_016818	GCTG	2	8	298369	298376	0 %	25 %	50 %	25 %	383188233
5525	NC_016818	ATG	2	6	298454	298459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188233
5526	NC_016818	GAT	2	6	298463	298468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188233
5527	NC_016818	CAT	2	6	298519	298524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188233
5528	NC_016818	CCGA	2	8	298565	298572	25 %	0 %	25 %	50 %	383188233
5529	NC_016818	GTG	2	6	298703	298708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188233
5530	NC_016818	TGG	2	6	298713	298718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188233
5531	NC_016818	CGC	2	6	298723	298728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188233
5532	NC_016818	CAG	2	6	298756	298761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188233
5533	NC_016818	AGA	2	6	298795	298800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383188233
5534	NC_016818	ACC	2	6	298874	298879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188233
5535	NC_016818	ATT	2	6	298916	298921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383188233
5536	NC_016818	GGA	2	6	298964	298969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383188233
5537	NC_016818	CAG	2	6	299027	299032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188233
5538	NC_016818	CCGG	2	8	299429	299436	0 %	0 %	50 %	50 %	383188234
5539	NC_016818	TCA	2	6	299612	299617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188234
5540	NC_016818	ATA	2	6	299642	299647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188234
5541	NC_016818	GCA	2	6	299769	299774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188234
5542	NC_016818	CGC	2	6	299782	299787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188234
5543	NC_016818	GCAG	2	8	299794	299801	25 %	0 %	50 %	25 %	383188234
5544	NC_016818	CGC	2	6	299826	299831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188234
5545	NC_016818	GCG	2	6	299888	299893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188234
5546	NC_016818	CGG	2	6	299908	299913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188234
5547	NC_016818	TGC	2	6	300036	300041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188234
5548	NC_016818	AGC	2	6	300162	300167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188234
5549	NC_016818	TCA	2	6	300209	300214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188234
5550	NC_016818	GCA	2	6	300348	300353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188234
5551	NC_016818	TTC	2	6	300380	300385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188234
5552	NC_016818	CGC	2	6	300390	300395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188234
5553	NC_016818	GCC	2	6	300406	300411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188234
5554	NC_016818	TCA	2	6	300507	300512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188234
5555	NC_016818	GTC	2	6	300547	300552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188234
5556	NC_016818	TAA	2	6	300603	300608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188234
5557	NC_016818	GAT	2	6	300655	300660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188234
5558	NC_016818	CCA	2	6	300766	300771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188234
5559	NC_016818	GTG	2	6	300785	300790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188234
5560	NC_016818	TCA	2	6	300791	300796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188234
5561	NC_016818	TCT	2	6	300911	300916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188234
5562	NC_016818	TGG	2	6	300962	300967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188234
5563	NC_016818	CGG	2	6	300990	300995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188234
5564	NC_016818	CGC	2	6	301277	301282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188235
5565	NC_016818	TCCAT	2	10	301303	301312	20 %	40 %	0 %	40 %	383188235
5566	NC_016818	CGC	2	6	301328	301333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188235
5567	NC_016818	AAT	2	6	301334	301339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188235
5568	NC_016818	CAG	2	6	301404	301409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188235
5569	NC_016818	TGA	2	6	301486	301491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188235
5570	NC_016818	TGGC	2	8	301514	301521	0 %	25 %	50 %	25 %	383188235
5571	NC_016818	TGG	3	9	301547	301555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383188235
5572	NC_016818	CAA	2	6	301614	301619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188235
5573	NC_016818	GCA	2	6	301630	301635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188235
5574	NC_016818	AGT	2	6	301700	301705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188235
5575	NC_016818	ACG	2	6	301744	301749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188235
5576	NC_016818	ATC	2	6	301807	301812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188235
5577	NC_016818	TGTT	2	8	301873	301880	0 %	75 %	25 %	0 %	383188235
5578	NC_016818	CAG	2	6	301965	301970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188235
5579	NC_016818	CCA	2	6	301979	301984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383188235
5580	NC_016818	CAG	2	6	301995	302000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188235
5581	NC_016818	CAA	2	6	302033	302038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188235
5582	NC_016818	CTG	2	6	302040	302045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188235
5583	NC_016818	TGA	2	6	302086	302091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188235
5584	NC_016818	GCG	2	6	302224	302229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188236
5585	NC_016818	CATT	2	8	302268	302275	25 %	50 %	0 %	25 %	383188236
5586	NC_016818	T	6	6	302292	302297	0 %	100 %	0 %	0 %	383188236
5587	NC_016818	CTT	2	6	302343	302348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383188236
5588	NC_016818	GCG	2	6	302356	302361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188236
5589	NC_016818	GCC	2	6	302482	302487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188236
5590	NC_016818	ATC	2	6	302492	302497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188236
5591	NC_016818	GC	3	6	302508	302513	0 %	0 %	50 %	50 %	383188236
5592	NC_016818	GCC	2	6	302531	302536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383188236
5593	NC_016818	TCG	2	6	302567	302572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188236
5594	NC_016818	TCA	2	6	302786	302791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188237
5595	NC_016818	CTTC	2	8	302856	302863	0 %	50 %	0 %	50 %	383188237
5596	NC_016818	TG	3	6	302875	302880	0 %	50 %	50 %	0 %	383188237
5597	NC_016818	TAA	2	6	302890	302895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383188237
5598	NC_016818	TGTC	2	8	302971	302978	0 %	50 %	25 %	25 %	383188237
5599	NC_016818	GTC	2	6	303016	303021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188237
5600	NC_016818	GTC	2	6	303050	303055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188237
5601	NC_016818	AGT	2	6	303090	303095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383188237
5602	NC_016818	GCT	2	6	303180	303185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188237
5603	NC_016818	CGG	2	6	303519	303524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188238
5604	NC_016818	CAA	2	6	303563	303568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188238
5605	NC_016818	GATACT	2	12	303656	303667	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383188238
5606	NC_016818	GCA	2	6	303700	303705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188238
5607	NC_016818	TTG	2	6	303719	303724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383188238
5608	NC_016818	GCG	2	6	303745	303750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188238
5609	NC_016818	GAG	2	6	303772	303777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383188238
5610	NC_016818	CCCG	2	8	303824	303831	0 %	0 %	25 %	75 %	383188238
5611	NC_016818	GCG	2	6	303832	303837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383188238
5612	NC_016818	ACG	2	6	303860	303865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188238
5613	NC_016818	AAAG	2	8	303878	303885	75 %	0 %	25 %	0 %	383188238
5614	NC_016818	GC	3	6	303922	303927	0 %	0 %	50 %	50 %	383188238
5615	NC_016818	GCA	2	6	303937	303942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188238
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5618	NC_016818	CGT	2	6	304202	304207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188238
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5620	NC_016818	GGCT	2	8	304318	304325	0 %	25 %	50 %	25 %	383188238
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5736	NC_016818	GT	3	6	310786	310791	0 %	50 %	50 %	0 %	383188243
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5739	NC_016818	C	7	7	311074	311080	0 %	0 %	0 %	100 %	383188243
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5985	NC_016818	TCA	2	6	325905	325910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383188256
5986	NC_016818	GATG	2	8	325915	325922	25 %	25 %	50 %	0 %	383188256
5987	NC_016818	CGA	2	6	325980	325985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383188256
5988	NC_016818	TGC	2	6	326013	326018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383188256
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5990	NC_016818	T	6	6	326599	326604	0 %	100 %	0 %	0 %	383188257
5991	NC_016818	ACA	2	6	326680	326685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383188257
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