MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia slovaca 13-B chromosome

Total Repeats: 22999

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016639	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318768
2	NC_016639	GCA	2	6	58	63	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374318768
3	NC_016639	TAT	2	6	182	187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318768
4	NC_016639	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318768
5	NC_016639	T	6	6	293	298	0 %	100 %	0 %	0 %	374318768
6	NC_016639	AATTAT	2	12	325	336	50 %	50 %	0 %	0 %	374318768
7	NC_016639	ATG	2	6	392	397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318768
8	NC_016639	ATA	2	6	433	438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318768
9	NC_016639	GTA	2	6	574	579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318768
10	NC_016639	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318768
11	NC_016639	CAG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374318768
12	NC_016639	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318768
13	NC_016639	AT	3	6	787	792	50 %	50 %	0 %	0 %	374318768
14	NC_016639	A	6	6	801	806	100 %	0 %	0 %	0 %	374318768
15	NC_016639	ATA	2	6	812	817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318768
16	NC_016639	ATA	2	6	1196	1201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318769
17	NC_016639	AAAGTA	2	12	1229	1240	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374318769
18	NC_016639	TGA	2	6	1255	1260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318769
19	NC_016639	GTA	2	6	1293	1298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318769
20	NC_016639	CAA	2	6	1355	1360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374318769
21	NC_016639	A	7	7	1359	1365	100 %	0 %	0 %	0 %	374318769
22	NC_016639	TAA	2	6	1384	1389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318769
23	NC_016639	TCT	2	6	1505	1510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374318770
24	NC_016639	A	6	6	1513	1518	100 %	0 %	0 %	0 %	374318770
25	NC_016639	TC	3	6	1523	1528	0 %	50 %	0 %	50 %	374318770
26	NC_016639	A	6	6	1583	1588	100 %	0 %	0 %	0 %	374318770
27	NC_016639	AT	3	6	1648	1653	50 %	50 %	0 %	0 %	374318770
28	NC_016639	TA	3	6	1766	1771	50 %	50 %	0 %	0 %	374318770
29	NC_016639	ATA	3	9	1769	1777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318770
30	NC_016639	A	7	7	1795	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	374318770
31	NC_016639	GTA	2	6	1835	1840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318770
32	NC_016639	TGA	2	6	1935	1940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318770
33	NC_016639	GAA	2	6	1992	1997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318770
34	NC_016639	AAT	2	6	2022	2027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318770
35	NC_016639	AAG	2	6	2039	2044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318770
36	NC_016639	TTA	2	6	2077	2082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318770
37	NC_016639	CAA	3	9	2140	2148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374318770
38	NC_016639	T	8	8	2172	2179	0 %	100 %	0 %	0 %	374318771
39	NC_016639	A	6	6	2182	2187	100 %	0 %	0 %	0 %	374318771
40	NC_016639	T	6	6	2247	2252	0 %	100 %	0 %	0 %	374318771
41	NC_016639	T	6	6	2307	2312	0 %	100 %	0 %	0 %	374318771
42	NC_016639	T	6	6	2316	2321	0 %	100 %	0 %	0 %	374318771
43	NC_016639	GA	3	6	2334	2339	50 %	0 %	50 %	0 %	374318771
44	NC_016639	AGC	2	6	2392	2397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374318771
45	NC_016639	ATA	2	6	2437	2442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318771
46	NC_016639	A	7	7	2442	2448	100 %	0 %	0 %	0 %	374318771
47	NC_016639	T	7	7	2466	2472	0 %	100 %	0 %	0 %	374318771
48	NC_016639	TA	3	6	2498	2503	50 %	50 %	0 %	0 %	374318771
49	NC_016639	TTTTA	2	10	2538	2547	20 %	80 %	0 %	0 %	374318771
50	NC_016639	ATA	2	6	2575	2580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318771
51	NC_016639	TAA	2	6	2606	2611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318771
52	NC_016639	TG	3	6	2614	2619	0 %	50 %	50 %	0 %	374318771
53	NC_016639	TTAT	2	8	2699	2706	25 %	75 %	0 %	0 %	374318771
54	NC_016639	AT	3	6	2758	2763	50 %	50 %	0 %	0 %	374318771
55	NC_016639	ATG	2	6	2836	2841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318771
56	NC_016639	TAT	2	6	2856	2861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318771
57	NC_016639	TTA	2	6	2870	2875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318771
58	NC_016639	ATTTA	2	10	2891	2900	40 %	60 %	0 %	0 %	374318771
59	NC_016639	TTAT	2	8	2921	2928	25 %	75 %	0 %	0 %	374318771
60	NC_016639	A	6	6	2985	2990	100 %	0 %	0 %	0 %	374318772
61	NC_016639	CTC	2	6	3067	3072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374318772
62	NC_016639	TC	3	6	3071	3076	0 %	50 %	0 %	50 %	374318772
63	NC_016639	ATT	2	6	3078	3083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318772
64	NC_016639	ATT	2	6	3091	3096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318772
65	NC_016639	T	6	6	3134	3139	0 %	100 %	0 %	0 %	374318772
66	NC_016639	ATT	2	6	3204	3209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318772
67	NC_016639	A	7	7	3248	3254	100 %	0 %	0 %	0 %	374318772
68	NC_016639	A	6	6	3265	3270	100 %	0 %	0 %	0 %	374318772
69	NC_016639	AACT	2	8	3304	3311	50 %	25 %	0 %	25 %	374318772
70	NC_016639	CAAA	2	8	3350	3357	75 %	0 %	0 %	25 %	374318772
71	NC_016639	AGA	2	6	3377	3382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318772
72	NC_016639	AGA	2	6	3392	3397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318772
73	NC_016639	AGC	2	6	3407	3412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374318772
74	NC_016639	TGC	2	6	3419	3424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374318772
75	NC_016639	TG	3	6	3439	3444	0 %	50 %	50 %	0 %	374318772
76	NC_016639	A	7	7	3519	3525	100 %	0 %	0 %	0 %	374318772
77	NC_016639	A	7	7	3538	3544	100 %	0 %	0 %	0 %	374318772
78	NC_016639	GA	3	6	3546	3551	50 %	0 %	50 %	0 %	374318772
79	NC_016639	T	6	6	3575	3580	0 %	100 %	0 %	0 %	374318772
80	NC_016639	ATT	2	6	3610	3615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318772
81	NC_016639	TATT	2	8	3617	3624	25 %	75 %	0 %	0 %	374318772
82	NC_016639	GAG	2	6	3687	3692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374318772
83	NC_016639	TCGC	2	8	3747	3754	0 %	25 %	25 %	50 %	374318772
84	NC_016639	A	6	6	3790	3795	100 %	0 %	0 %	0 %	374318772
85	NC_016639	TAT	2	6	3848	3853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318772
86	NC_016639	GCA	2	6	3876	3881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374318772
87	NC_016639	AGA	2	6	3974	3979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318772
88	NC_016639	AT	3	6	4008	4013	50 %	50 %	0 %	0 %	374318772
89	NC_016639	CTA	2	6	4069	4074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318772
90	NC_016639	TAT	2	6	4125	4130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318772
91	NC_016639	TTA	2	6	4131	4136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318772
92	NC_016639	GGTCA	2	10	4138	4147	20 %	20 %	40 %	20 %	374318772
93	NC_016639	TGT	2	6	4151	4156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374318772
94	NC_016639	AT	3	6	4318	4323	50 %	50 %	0 %	0 %	374318772
95	NC_016639	AG	3	6	4337	4342	50 %	0 %	50 %	0 %	374318772
96	NC_016639	ATA	2	6	4345	4350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318772
97	NC_016639	TA	3	6	4425	4430	50 %	50 %	0 %	0 %	374318772
98	NC_016639	GGC	2	6	4596	4601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374318772
99	NC_016639	GCA	2	6	4620	4625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374318772
100	NC_016639	A	6	6	4647	4652	100 %	0 %	0 %	0 %	374318772
101	NC_016639	TA	3	6	4677	4682	50 %	50 %	0 %	0 %	374318772
102	NC_016639	GGA	2	6	4697	4702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374318772
103	NC_016639	GAA	2	6	4719	4724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318772
104	NC_016639	AAG	2	6	4750	4755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318772
105	NC_016639	AAT	2	6	4761	4766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318772
106	NC_016639	GAA	2	6	4767	4772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318772
107	NC_016639	TAA	2	6	4787	4792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318772
108	NC_016639	CTA	2	6	4811	4816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318772
109	NC_016639	TAAAT	2	10	4847	4856	60 %	40 %	0 %	0 %	374318772
110	NC_016639	GAG	2	6	4860	4865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374318772
111	NC_016639	AT	3	6	4869	4874	50 %	50 %	0 %	0 %	374318772
112	NC_016639	CAAAAC	2	12	5072	5083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374318772
113	NC_016639	TCAAT	2	10	5117	5126	40 %	40 %	0 %	20 %	374318772
114	NC_016639	GTAGT	2	10	5173	5182	20 %	40 %	40 %	0 %	374318772
115	NC_016639	AAG	2	6	5203	5208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318772
116	NC_016639	ACG	2	6	5212	5217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374318772
117	NC_016639	ATA	2	6	5239	5244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318772
118	NC_016639	ATT	2	6	5290	5295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318772
119	NC_016639	TAA	2	6	5312	5317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318772
120	NC_016639	AATA	2	8	5318	5325	75 %	25 %	0 %	0 %	374318772
121	NC_016639	GAT	2	6	5331	5336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318772
122	NC_016639	ATTC	2	8	5355	5362	25 %	50 %	0 %	25 %	374318772
123	NC_016639	TGC	2	6	5369	5374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374318772
124	NC_016639	T	6	6	5397	5402	0 %	100 %	0 %	0 %	374318772
125	NC_016639	ATT	2	6	5413	5418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318772
126	NC_016639	TGC	2	6	5426	5431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374318772
127	NC_016639	CTA	2	6	5521	5526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318772
128	NC_016639	AGT	2	6	5558	5563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318772
129	NC_016639	CGC	2	6	5584	5589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374318772
130	NC_016639	A	7	7	5607	5613	100 %	0 %	0 %	0 %	374318772
131	NC_016639	TTG	2	6	5620	5625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374318772
132	NC_016639	TTA	2	6	5649	5654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318772
133	NC_016639	ATA	2	6	5671	5676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318772
134	NC_016639	TAA	2	6	5740	5745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318772
135	NC_016639	ATA	2	6	5763	5768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318772
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137	NC_016639	A	6	6	5786	5791	100 %	0 %	0 %	0 %	374318772
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392	NC_016639	A	6	6	23033	23038	100 %	0 %	0 %	0 %	374318786
393	NC_016639	TAATA	2	10	23044	23053	60 %	40 %	0 %	0 %	374318786
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395	NC_016639	CAAA	2	8	23087	23094	75 %	0 %	0 %	25 %	374318786
396	NC_016639	CAAAG	2	10	23136	23145	60 %	0 %	20 %	20 %	374318786
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