MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia slovaca 13-B chromosome

Total Repeats: 22999

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_016639	TTG	2	6	735258	735263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374319414
13502	NC_016639	TGT	2	6	735302	735307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374319414
13503	NC_016639	TAA	2	6	735360	735365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319414
13504	NC_016639	GA	3	6	735536	735541	50 %	0 %	50 %	0 %	374319415
13505	NC_016639	CTT	2	6	735577	735582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319415
13506	NC_016639	TCT	2	6	735600	735605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319415
13507	NC_016639	TTC	2	6	735677	735682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319415
13508	NC_016639	CTG	2	6	735712	735717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319415
13509	NC_016639	TA	3	6	735724	735729	50 %	50 %	0 %	0 %	374319415
13510	NC_016639	TCTT	2	8	735730	735737	0 %	75 %	0 %	25 %	374319415
13511	NC_016639	AAC	2	6	735787	735792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374319415
13512	NC_016639	CTC	2	6	735818	735823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374319415
13513	NC_016639	CATA	2	8	735829	735836	50 %	25 %	0 %	25 %	374319415
13514	NC_016639	TAT	2	6	735878	735883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319415
13515	NC_016639	TCT	2	6	735900	735905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319415
13516	NC_016639	TGT	2	6	735938	735943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374319415
13517	NC_016639	G	6	6	735947	735952	0 %	0 %	100 %	0 %	374319415
13518	NC_016639	T	6	6	735998	736003	0 %	100 %	0 %	0 %	374319415
13519	NC_016639	ATT	2	6	736005	736010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319415
13520	NC_016639	TTAT	2	8	736044	736051	25 %	75 %	0 %	0 %	374319415
13521	NC_016639	TAC	2	6	736147	736152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319415
13522	NC_016639	AGC	2	6	736208	736213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319415
13523	NC_016639	TTA	2	6	736215	736220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319415
13524	NC_016639	TATCAA	2	12	736225	736236	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	374319415
13525	NC_016639	A	6	6	736269	736274	100 %	0 %	0 %	0 %	374319415
13526	NC_016639	AAAT	2	8	736277	736284	75 %	25 %	0 %	0 %	374319415
13527	NC_016639	ATT	2	6	736295	736300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319415
13528	NC_016639	AAT	2	6	736318	736323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319415
13529	NC_016639	TCG	2	6	736360	736365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319415
13530	NC_016639	TAT	3	9	736373	736381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319415
13531	NC_016639	CTC	2	6	736390	736395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374319415
13532	NC_016639	TAT	2	6	736487	736492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319415
13533	NC_016639	CATA	2	8	736522	736529	50 %	25 %	0 %	25 %	374319415
13534	NC_016639	A	6	6	736664	736669	100 %	0 %	0 %	0 %	374319416
13535	NC_016639	TGA	2	6	736694	736699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319416
13536	NC_016639	TA	3	6	736705	736710	50 %	50 %	0 %	0 %	374319416
13537	NC_016639	ATAA	2	8	736722	736729	75 %	25 %	0 %	0 %	374319416
13538	NC_016639	TTTC	2	8	736754	736761	0 %	75 %	0 %	25 %	374319416
13539	NC_016639	GCG	2	6	736786	736791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374319416
13540	NC_016639	A	6	6	736804	736809	100 %	0 %	0 %	0 %	374319416
13541	NC_016639	TATT	2	8	736871	736878	25 %	75 %	0 %	0 %	374319416
13542	NC_016639	ATA	2	6	736885	736890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319416
13543	NC_016639	TGA	2	6	736913	736918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319416
13544	NC_016639	A	7	7	736921	736927	100 %	0 %	0 %	0 %	374319416
13545	NC_016639	AAT	2	6	736931	736936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319416
13546	NC_016639	ACA	2	6	737054	737059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374319416
13547	NC_016639	CTAG	2	8	737064	737071	25 %	25 %	25 %	25 %	374319416
13548	NC_016639	TAT	2	6	737122	737127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319416
13549	NC_016639	AT	3	6	737161	737166	50 %	50 %	0 %	0 %	374319416
13550	NC_016639	T	7	7	737181	737187	0 %	100 %	0 %	0 %	374319416
13551	NC_016639	CGT	2	6	737190	737195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319416
13552	NC_016639	CAG	2	6	737224	737229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319416
13553	NC_016639	ATC	2	6	737266	737271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319416
13554	NC_016639	CCA	2	6	737332	737337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374319416
13555	NC_016639	ATT	4	12	737349	737360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319416
13556	NC_016639	A	6	6	737461	737466	100 %	0 %	0 %	0 %	374319417
13557	NC_016639	AGA	2	6	737471	737476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374319417
13558	NC_016639	TTA	2	6	737543	737548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319417
13559	NC_016639	AGA	2	6	737579	737584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374319417
13560	NC_016639	AAT	2	6	737594	737599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319417
13561	NC_016639	TAA	2	6	737633	737638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319417
13562	NC_016639	GCT	2	6	737639	737644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319417
13563	NC_016639	ATA	3	9	737650	737658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319417
13564	NC_016639	CTC	2	6	737677	737682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374319417
13565	NC_016639	ATTT	2	8	737707	737714	25 %	75 %	0 %	0 %	374319417
13566	NC_016639	GCA	2	6	737751	737756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319417
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13569	NC_016639	CCA	2	6	737834	737839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374319417
13570	NC_016639	AT	3	6	737919	737924	50 %	50 %	0 %	0 %	374319417
13571	NC_016639	ATA	2	6	737935	737940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319417
13572	NC_016639	AAT	2	6	737952	737957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319417
13573	NC_016639	TAA	2	6	737963	737968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319417
13574	NC_016639	ACT	2	6	737976	737981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319417
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13577	NC_016639	TGA	2	6	738056	738061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374319417
13578	NC_016639	ATTTT	2	10	738142	738151	20 %	80 %	0 %	0 %	374319417
13579	NC_016639	TAA	2	6	738163	738168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319417
13580	NC_016639	ACAA	2	8	738238	738245	75 %	0 %	0 %	25 %	374319417
13581	NC_016639	ATA	2	6	738261	738266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319417
13582	NC_016639	TAA	2	6	738275	738280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319417
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13588	NC_016639	CGG	2	6	738740	738745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374319419
13589	NC_016639	AT	3	6	738749	738754	50 %	50 %	0 %	0 %	374319419
13590	NC_016639	TTA	3	9	738760	738768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319419
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13593	NC_016639	A	7	7	738858	738864	100 %	0 %	0 %	0 %	374319419
13594	NC_016639	ATT	2	6	738867	738872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374319419
13595	NC_016639	T	6	6	738946	738951	0 %	100 %	0 %	0 %	374319419
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13597	NC_016639	AAGT	2	8	739002	739009	50 %	25 %	25 %	0 %	374319419
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13599	NC_016639	TAA	2	6	739065	739070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319419
13600	NC_016639	AG	3	6	739090	739095	50 %	0 %	50 %	0 %	374319419
13601	NC_016639	ATCTT	2	10	739117	739126	20 %	60 %	0 %	20 %	374319419
13602	NC_016639	T	6	6	739129	739134	0 %	100 %	0 %	0 %	374319419
13603	NC_016639	CAA	2	6	739361	739366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374319420
13604	NC_016639	CGC	2	6	739367	739372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374319420
13605	NC_016639	AT	3	6	739461	739466	50 %	50 %	0 %	0 %	374319421
13606	NC_016639	TGC	2	6	739499	739504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374319421
13607	NC_016639	TCT	2	6	739557	739562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319421
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13610	NC_016639	TTGCTC	2	12	739699	739710	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	374319421
13611	NC_016639	TAAT	2	8	739746	739753	50 %	50 %	0 %	0 %	374319421
13612	NC_016639	TTC	2	6	739772	739777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374319421
13613	NC_016639	TA	3	6	739810	739815	50 %	50 %	0 %	0 %	374319421
13614	NC_016639	CCTG	2	8	739848	739855	0 %	25 %	25 %	50 %	374319421
13615	NC_016639	AGCA	2	8	739904	739911	50 %	0 %	25 %	25 %	374319421
13616	NC_016639	TAA	2	6	740002	740007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374319421
13617	NC_016639	CAACA	2	10	740063	740072	60 %	0 %	0 %	40 %	374319421
13618	NC_016639	TAC	2	6	740081	740086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374319421
13619	NC_016639	TCC	2	6	740100	740105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374319421
13620	NC_016639	CAG	2	6	740140	740145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374319421
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