MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia slovaca 13-B chromosome

Total Repeats: 22999

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016639	GAT	2	6	28252	28257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318787
502	NC_016639	TAC	2	6	28277	28282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318787
503	NC_016639	ATT	2	6	28284	28289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318787
504	NC_016639	TCA	2	6	29554	29559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318788
505	NC_016639	T	6	6	29628	29633	0 %	100 %	0 %	0 %	374318788
506	NC_016639	TTC	2	6	29646	29651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374318788
507	NC_016639	T	6	6	29663	29668	0 %	100 %	0 %	0 %	374318788
508	NC_016639	T	7	7	29678	29684	0 %	100 %	0 %	0 %	374318788
509	NC_016639	TCT	2	6	29701	29706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374318788
510	NC_016639	GT	3	6	29752	29757	0 %	50 %	50 %	0 %	374318788
511	NC_016639	AGC	2	6	29769	29774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374318788
512	NC_016639	TCT	2	6	29776	29781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374318788
513	NC_016639	T	7	7	29853	29859	0 %	100 %	0 %	0 %	374318788
514	NC_016639	A	7	7	29881	29887	100 %	0 %	0 %	0 %	374318788
515	NC_016639	ATT	2	6	29932	29937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318788
516	NC_016639	GTA	2	6	29953	29958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318789
517	NC_016639	T	6	6	29986	29991	0 %	100 %	0 %	0 %	374318789
518	NC_016639	AAT	2	6	29993	29998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318789
519	NC_016639	TGC	2	6	30020	30025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374318789
520	NC_016639	TTA	2	6	30030	30035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318789
521	NC_016639	AGC	2	6	30050	30055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374318789
522	NC_016639	T	6	6	30090	30095	0 %	100 %	0 %	0 %	374318789
523	NC_016639	T	8	8	30114	30121	0 %	100 %	0 %	0 %	374318789
524	NC_016639	T	6	6	30151	30156	0 %	100 %	0 %	0 %	374318789
525	NC_016639	T	7	7	30158	30164	0 %	100 %	0 %	0 %	374318789
526	NC_016639	TCTA	2	8	30167	30174	25 %	50 %	0 %	25 %	374318789
527	NC_016639	TTTGT	2	10	30183	30192	0 %	80 %	20 %	0 %	374318789
528	NC_016639	ATTT	2	8	30211	30218	25 %	75 %	0 %	0 %	374318789
529	NC_016639	TGTC	2	8	30275	30282	0 %	50 %	25 %	25 %	374318789
530	NC_016639	TAT	2	6	30283	30288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318789
531	NC_016639	TTC	2	6	30296	30301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374318789
532	NC_016639	A	6	6	30364	30369	100 %	0 %	0 %	0 %	374318789
533	NC_016639	AAT	2	6	30376	30381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318789
534	NC_016639	A	6	6	30430	30435	100 %	0 %	0 %	0 %	374318790
535	NC_016639	A	6	6	30460	30465	100 %	0 %	0 %	0 %	374318790
536	NC_016639	AG	3	6	30555	30560	50 %	0 %	50 %	0 %	374318790
537	NC_016639	AT	3	6	30565	30570	50 %	50 %	0 %	0 %	374318790
538	NC_016639	TAA	2	6	30724	30729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318791
539	NC_016639	A	6	6	30773	30778	100 %	0 %	0 %	0 %	374318791
540	NC_016639	CAT	2	6	30862	30867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318792
541	NC_016639	ATAC	2	8	30872	30879	50 %	25 %	0 %	25 %	374318792
542	NC_016639	CAA	2	6	30916	30921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374318792
543	NC_016639	ATA	2	6	30948	30953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318792
544	NC_016639	TAA	2	6	31013	31018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318792
545	NC_016639	CAT	2	6	31031	31036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318792
546	NC_016639	ATC	2	6	31101	31106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318792
547	NC_016639	A	7	7	31140	31146	100 %	0 %	0 %	0 %	374318792
548	NC_016639	A	6	6	31152	31157	100 %	0 %	0 %	0 %	374318792
549	NC_016639	ATA	2	6	31230	31235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318792
550	NC_016639	TAG	3	9	31240	31248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318792
551	NC_016639	ATAA	2	8	31296	31303	75 %	25 %	0 %	0 %	374318792
552	NC_016639	CACT	2	8	31390	31397	25 %	25 %	0 %	50 %	374318792
553	NC_016639	T	6	6	31535	31540	0 %	100 %	0 %	0 %	374318792
554	NC_016639	TAT	2	6	31586	31591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318793
555	NC_016639	T	6	6	31596	31601	0 %	100 %	0 %	0 %	374318793
556	NC_016639	TAT	2	6	31632	31637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318793
557	NC_016639	ATA	2	6	31645	31650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318793
558	NC_016639	GTT	2	6	31789	31794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374318793
559	NC_016639	TCATT	2	10	31960	31969	20 %	60 %	0 %	20 %	374318794
560	NC_016639	T	6	6	31968	31973	0 %	100 %	0 %	0 %	374318794
561	NC_016639	CTC	2	6	31988	31993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374318794
562	NC_016639	CTG	2	6	32008	32013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374318794
563	NC_016639	GAA	2	6	32060	32065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318794
564	NC_016639	ATT	2	6	32141	32146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318794
565	NC_016639	TTC	2	6	32162	32167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374318794
566	NC_016639	TAA	2	6	32201	32206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318794
567	NC_016639	TATT	2	8	32214	32221	25 %	75 %	0 %	0 %	374318794
568	NC_016639	TTG	2	6	32240	32245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374318794
569	NC_016639	GCA	2	6	32310	32315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374318794
570	NC_016639	TAG	2	6	32329	32334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318794
571	NC_016639	AT	3	6	32376	32381	50 %	50 %	0 %	0 %	374318794
572	NC_016639	T	6	6	32381	32386	0 %	100 %	0 %	0 %	374318794
573	NC_016639	TGA	2	6	32409	32414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318794
574	NC_016639	TAA	2	6	32415	32420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318794
575	NC_016639	ACT	2	6	32454	32459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318794
576	NC_016639	T	6	6	32471	32476	0 %	100 %	0 %	0 %	374318794
577	NC_016639	ATC	2	6	32498	32503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318794
578	NC_016639	T	7	7	32541	32547	0 %	100 %	0 %	0 %	374318794
579	NC_016639	TCA	2	6	32574	32579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318794
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581	NC_016639	TAT	2	6	32687	32692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318794
582	NC_016639	TCT	2	6	32727	32732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374318794
583	NC_016639	ATA	2	6	32749	32754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318794
584	NC_016639	TAA	2	6	32767	32772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318794
585	NC_016639	TAA	2	6	32944	32949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318795
586	NC_016639	ACA	2	6	32958	32963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374318795
587	NC_016639	AAATT	2	10	33070	33079	60 %	40 %	0 %	0 %	374318795
588	NC_016639	TAG	2	6	33128	33133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318795
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591	NC_016639	AGA	2	6	33237	33242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318795
592	NC_016639	TAA	2	6	33428	33433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318795
593	NC_016639	TAG	2	6	33460	33465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318795
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595	NC_016639	CTC	2	6	33552	33557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374318796
596	NC_016639	CTA	2	6	33722	33727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318797
597	NC_016639	CAA	2	6	33776	33781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374318797
598	NC_016639	TAA	2	6	33789	33794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318797
599	NC_016639	AATT	2	8	33848	33855	50 %	50 %	0 %	0 %	374318797
600	NC_016639	T	6	6	33854	33859	0 %	100 %	0 %	0 %	374318797
601	NC_016639	ATC	2	6	33879	33884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318797
602	NC_016639	AT	3	6	33916	33921	50 %	50 %	0 %	0 %	374318797
603	NC_016639	TACC	2	8	33938	33945	25 %	25 %	0 %	50 %	374318797
604	NC_016639	ATT	2	6	33987	33992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318797
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607	NC_016639	CATATA	2	12	34226	34237	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	374318797
608	NC_016639	GTTA	2	8	34320	34327	25 %	50 %	25 %	0 %	374318797
609	NC_016639	A	6	6	34374	34379	100 %	0 %	0 %	0 %	374318797
610	NC_016639	ATT	2	6	34389	34394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318797
611	NC_016639	TGA	2	6	34426	34431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318797
612	NC_016639	ATA	2	6	34433	34438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318797
613	NC_016639	AT	3	6	34474	34479	50 %	50 %	0 %	0 %	374318797
614	NC_016639	CTG	2	6	34520	34525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374318797
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616	NC_016639	T	7	7	34591	34597	0 %	100 %	0 %	0 %	374318797
617	NC_016639	AT	3	6	34623	34628	50 %	50 %	0 %	0 %	374318797
618	NC_016639	ATA	2	6	34685	34690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318797
619	NC_016639	TGA	2	6	34751	34756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318797
620	NC_016639	TAT	2	6	34868	34873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318797
621	NC_016639	TTA	2	6	34909	34914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318797
622	NC_016639	CTT	2	6	34940	34945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374318797
623	NC_016639	TCA	2	6	35002	35007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318797
624	NC_016639	T	6	6	35041	35046	0 %	100 %	0 %	0 %	374318797
625	NC_016639	T	7	7	35066	35072	0 %	100 %	0 %	0 %	374318797
626	NC_016639	TCA	2	6	35287	35292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318797
627	NC_016639	TTA	2	6	35302	35307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318797
628	NC_016639	AAAC	2	8	35747	35754	75 %	0 %	0 %	25 %	374318798
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