MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia japonica YH

Total Repeats: 22440

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016050	ATG	2	6	93988	93993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273120
1502	NC_016050	TTGATT	2	12	94019	94030	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	350273120
1503	NC_016050	TAA	2	6	94143	94148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273120
1504	NC_016050	TAT	2	6	94178	94183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273120
1505	NC_016050	GAA	3	9	94189	94197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273120
1506	NC_016050	CGCAT	3	15	94265	94279	20 %	20 %	20 %	40 %	350273120
1507	NC_016050	TTTA	2	8	94280	94287	25 %	75 %	0 %	0 %	350273120
1508	NC_016050	TAGC	2	8	94421	94428	25 %	25 %	25 %	25 %	350273120
1509	NC_016050	ATA	2	6	94650	94655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273121
1510	NC_016050	TTA	2	6	94659	94664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273121
1511	NC_016050	GTAT	2	8	94685	94692	25 %	50 %	25 %	0 %	350273121
1512	NC_016050	TATT	2	8	94699	94706	25 %	75 %	0 %	0 %	350273121
1513	NC_016050	TGA	2	6	94756	94761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273121
1514	NC_016050	AT	3	6	94826	94831	50 %	50 %	0 %	0 %	350273121
1515	NC_016050	CCAAAG	2	12	94918	94929	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	350273121
1516	NC_016050	TGA	2	6	94942	94947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273121
1517	NC_016050	ATA	2	6	94980	94985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273121
1518	NC_016050	ATA	2	6	95012	95017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273121
1519	NC_016050	AAT	2	6	95069	95074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273121
1520	NC_016050	GAAGCA	2	12	95111	95122	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	350273121
1521	NC_016050	AAG	2	6	95127	95132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273121
1522	NC_016050	A	6	6	95143	95148	100 %	0 %	0 %	0 %	350273121
1523	NC_016050	TGT	2	6	95173	95178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350273121
1524	NC_016050	A	6	6	95189	95194	100 %	0 %	0 %	0 %	350273121
1525	NC_016050	GAC	2	6	95204	95209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273121
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1527	NC_016050	TG	3	6	95303	95308	0 %	50 %	50 %	0 %	350273121
1528	NC_016050	AAG	2	6	95512	95517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273122
1529	NC_016050	CAA	2	6	95581	95586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	350273122
1530	NC_016050	ACGT	2	8	95608	95615	25 %	25 %	25 %	25 %	350273122
1531	NC_016050	TTA	2	6	95643	95648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273122
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1533	NC_016050	ACC	2	6	95731	95736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	350273122
1534	NC_016050	GCA	2	6	95850	95855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273122
1535	NC_016050	TTA	2	6	95898	95903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273122
1536	NC_016050	GGA	2	6	95906	95911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350273122
1537	NC_016050	ATT	2	6	95950	95955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273122
1538	NC_016050	TAA	2	6	95971	95976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273122
1539	NC_016050	ACC	2	6	96047	96052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	350273122
1540	NC_016050	CGG	2	6	96158	96163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350273122
1541	NC_016050	ATT	2	6	96168	96173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273122
1542	NC_016050	TTA	2	6	96187	96192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273122
1543	NC_016050	TGC	2	6	96194	96199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273122
1544	NC_016050	TAC	2	6	96203	96208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273122
1545	NC_016050	A	7	7	96351	96357	100 %	0 %	0 %	0 %	350273122
1546	NC_016050	GGTT	2	8	96403	96410	0 %	50 %	50 %	0 %	350273122
1547	NC_016050	GA	3	6	96419	96424	50 %	0 %	50 %	0 %	350273122
1548	NC_016050	TAA	2	6	96518	96523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273122
1549	NC_016050	TAAA	2	8	96613	96620	75 %	25 %	0 %	0 %	350273122
1550	NC_016050	TGA	2	6	96674	96679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273122
1551	NC_016050	ATT	2	6	96690	96695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273122
1552	NC_016050	GAA	2	6	96699	96704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273122
1553	NC_016050	ATG	2	6	96723	96728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273122
1554	NC_016050	TCGC	2	8	96782	96789	0 %	25 %	25 %	50 %	350273122
1555	NC_016050	ATT	2	6	96813	96818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273122
1556	NC_016050	CAA	2	6	96843	96848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	350273122
1557	NC_016050	AGA	2	6	96857	96862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273122
1558	NC_016050	AAT	2	6	96870	96875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273122
1559	NC_016050	A	6	6	96900	96905	100 %	0 %	0 %	0 %	350273122
1560	NC_016050	AGT	2	6	96995	97000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273122
1561	NC_016050	TAT	2	6	97037	97042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273122
1562	NC_016050	CGTT	2	8	97065	97072	0 %	50 %	25 %	25 %	350273122
1563	NC_016050	AAG	2	6	97111	97116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273122
1564	NC_016050	ATTT	2	8	97130	97137	25 %	75 %	0 %	0 %	350273122
1565	NC_016050	TAGT	2	8	97168	97175	25 %	50 %	25 %	0 %	350273122
1566	NC_016050	T	6	6	97188	97193	0 %	100 %	0 %	0 %	350273122
1567	NC_016050	ATA	2	6	97207	97212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273122
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1570	NC_016050	TTA	2	6	97311	97316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273122
1571	NC_016050	AGT	2	6	97323	97328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273122
1572	NC_016050	CAAA	2	8	97371	97378	75 %	0 %	0 %	25 %	350273122
1573	NC_016050	ATGT	2	8	97414	97421	25 %	50 %	25 %	0 %	350273122
1574	NC_016050	TGAAA	2	10	97508	97517	60 %	20 %	20 %	0 %	350273122
1575	NC_016050	A	6	6	97515	97520	100 %	0 %	0 %	0 %	350273122
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1581	NC_016050	TCA	2	6	97713	97718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273122
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1583	NC_016050	AAT	2	6	98922	98927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273123
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1596	NC_016050	TTGAT	2	10	99693	99702	20 %	60 %	20 %	0 %	350273123
1597	NC_016050	AT	3	6	99777	99782	50 %	50 %	0 %	0 %	350273123
1598	NC_016050	TCC	2	6	99812	99817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350273123
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1608	NC_016050	AAG	2	6	100557	100562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273124
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1622	NC_016050	AT	3	6	101197	101202	50 %	50 %	0 %	0 %	350273125
1623	NC_016050	TCT	2	6	101237	101242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273125
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1995	NC_016050	AGA	2	6	117108	117113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273136
1996	NC_016050	A	8	8	117151	117158	100 %	0 %	0 %	0 %	350273136
1997	NC_016050	TAT	2	6	117173	117178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273136
1998	NC_016050	GCAAA	2	10	117187	117196	60 %	0 %	20 %	20 %	350273136
1999	NC_016050	CAT	2	6	117337	117342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273136
2000	NC_016050	TTA	2	6	117461	117466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273136

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