MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia japonica YH

Total Repeats: 22440

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016050	ATTG	2	8	308661	308668	25 %	50 %	25 %	0 %	350273280
5502	NC_016050	AGGT	2	8	308679	308686	25 %	25 %	50 %	0 %	350273280
5503	NC_016050	A	6	6	308852	308857	100 %	0 %	0 %	0 %	350273280
5504	NC_016050	GAT	2	6	308862	308867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273280
5505	NC_016050	AGT	2	6	308904	308909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273280
5506	NC_016050	ACT	2	6	308926	308931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273280
5507	NC_016050	AAG	2	6	308936	308941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273280
5508	NC_016050	TAT	2	6	308942	308947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273280
5509	NC_016050	AGA	2	6	308976	308981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273280
5510	NC_016050	TAT	2	6	309093	309098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273281
5511	NC_016050	A	7	7	309145	309151	100 %	0 %	0 %	0 %	350273281
5512	NC_016050	AAT	2	6	309211	309216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273281
5513	NC_016050	GGAA	2	8	309299	309306	50 %	0 %	50 %	0 %	350273281
5514	NC_016050	T	7	7	312249	312255	0 %	100 %	0 %	0 %	350273282
5515	NC_016050	TTGTTC	2	12	312264	312275	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	350273282
5516	NC_016050	TCT	2	6	312385	312390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273282
5517	NC_016050	ATTT	2	8	312398	312405	25 %	75 %	0 %	0 %	350273282
5518	NC_016050	TTCT	2	8	312452	312459	0 %	75 %	0 %	25 %	350273282
5519	NC_016050	ATC	2	6	312516	312521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273282
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5521	NC_016050	CAG	2	6	312536	312541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273282
5522	NC_016050	AT	3	6	312545	312550	50 %	50 %	0 %	0 %	350273282
5523	NC_016050	T	8	8	312550	312557	0 %	100 %	0 %	0 %	350273282
5524	NC_016050	TGC	2	6	312561	312566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273282
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5527	NC_016050	GCA	2	6	314092	314097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273283
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5529	NC_016050	GAG	2	6	314140	314145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350273283
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5534	NC_016050	A	6	6	314266	314271	100 %	0 %	0 %	0 %	350273283
5535	NC_016050	TGG	2	6	314352	314357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	350273283
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5538	NC_016050	TAT	2	6	314438	314443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273283
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5544	NC_016050	TTA	2	6	314669	314674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273283
5545	NC_016050	GCT	2	6	314761	314766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273283
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5547	NC_016050	AAGT	2	8	314855	314862	50 %	25 %	25 %	0 %	350273283
5548	NC_016050	TAC	2	6	314887	314892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273283
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5551	NC_016050	TAC	3	9	314949	314957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273283
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5553	NC_016050	GGGA	2	8	315098	315105	25 %	0 %	75 %	0 %	350273283
5554	NC_016050	AGC	2	6	315111	315116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273283
5555	NC_016050	TTG	2	6	315128	315133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350273283
5556	NC_016050	TGC	2	6	315153	315158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273283
5557	NC_016050	GAA	2	6	315232	315237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273283
5558	NC_016050	GAA	2	6	315370	315375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273283
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5561	NC_016050	GAAGAT	2	12	315527	315538	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	350273284
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5567	NC_016050	GCTTG	2	10	315731	315740	0 %	40 %	40 %	20 %	350273284
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5587	NC_016050	CTG	2	6	316785	316790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273285
5588	NC_016050	CCG	2	6	316811	316816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350273285
5589	NC_016050	TAC	2	6	316828	316833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273285
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5592	NC_016050	TAC	2	6	316969	316974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273285
5593	NC_016050	TTC	2	6	317002	317007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273285
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5601	NC_016050	AAT	2	6	317228	317233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273285
5602	NC_016050	TGA	3	9	317293	317301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273285
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5604	NC_016050	AGAA	2	8	317379	317386	75 %	0 %	25 %	0 %	350273285
5605	NC_016050	AGA	2	6	317408	317413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273285
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5611	NC_016050	ATCT	2	8	317478	317485	25 %	50 %	0 %	25 %	350273285
5612	NC_016050	TGCG	2	8	317544	317551	0 %	25 %	50 %	25 %	350273285
5613	NC_016050	CTG	2	6	317610	317615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273285
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5994	NC_016050	TTG	2	6	335585	335590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350273301
5995	NC_016050	GAT	2	6	335653	335658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273301
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