MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia japonica YH

Total Repeats: 22440

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_016050	TAT	2	6	277469	277474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273257
5003	NC_016050	ATA	2	6	277480	277485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273257
5004	NC_016050	TC	3	6	277503	277508	0 %	50 %	0 %	50 %	350273257
5005	NC_016050	T	6	6	277572	277577	0 %	100 %	0 %	0 %	350273257
5006	NC_016050	ATA	2	6	277645	277650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273257
5007	NC_016050	ATT	2	6	277656	277661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273257
5008	NC_016050	AC	3	6	277752	277757	50 %	0 %	0 %	50 %	350273258
5009	NC_016050	ATT	2	6	277759	277764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273258
5010	NC_016050	TGA	2	6	277815	277820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273258
5011	NC_016050	AAGT	2	8	277847	277854	50 %	25 %	25 %	0 %	350273258
5012	NC_016050	AGAA	2	8	277871	277878	75 %	0 %	25 %	0 %	350273258
5013	NC_016050	TTA	2	6	277883	277888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273258
5014	NC_016050	A	6	6	277902	277907	100 %	0 %	0 %	0 %	350273258
5015	NC_016050	ATA	2	6	277931	277936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273258
5016	NC_016050	GAC	2	6	278016	278021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273258
5017	NC_016050	CTG	2	6	278027	278032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273258
5018	NC_016050	TAAT	2	8	278041	278048	50 %	50 %	0 %	0 %	350273258
5019	NC_016050	ACC	2	6	280388	280393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	350273259
5020	NC_016050	GGT	2	6	280410	280415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	350273259
5021	NC_016050	CAA	2	6	280462	280467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	350273259
5022	NC_016050	ATA	2	6	280470	280475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273259
5023	NC_016050	ATT	2	6	280477	280482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273259
5024	NC_016050	AGC	2	6	280593	280598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273259
5025	NC_016050	AAT	2	6	280623	280628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273259
5026	NC_016050	TCT	3	9	281008	281016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273260
5027	NC_016050	AGATG	2	10	281040	281049	40 %	20 %	40 %	0 %	350273260
5028	NC_016050	TATCT	2	10	281054	281063	20 %	60 %	0 %	20 %	350273260
5029	NC_016050	CATG	2	8	281151	281158	25 %	25 %	25 %	25 %	350273260
5030	NC_016050	ACG	2	6	281255	281260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273260
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5032	NC_016050	GCG	2	6	281344	281349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350273260
5033	NC_016050	GCA	2	6	281350	281355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273260
5034	NC_016050	GAA	2	6	281455	281460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273260
5035	NC_016050	CGGT	2	8	281522	281529	0 %	25 %	50 %	25 %	350273260
5036	NC_016050	TA	4	8	281585	281592	50 %	50 %	0 %	0 %	350273260
5037	NC_016050	ATA	2	6	281594	281599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273260
5038	NC_016050	GTT	2	6	281629	281634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350273260
5039	NC_016050	GTA	2	6	281711	281716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273260
5040	NC_016050	ATT	3	9	281770	281778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273260
5041	NC_016050	AAGGC	2	10	281803	281812	40 %	0 %	40 %	20 %	350273260
5042	NC_016050	TGA	2	6	281874	281879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273260
5043	NC_016050	AAAG	2	8	281916	281923	75 %	0 %	25 %	0 %	350273260
5044	NC_016050	AGT	2	6	281937	281942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273260
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5046	NC_016050	TGCT	2	8	281996	282003	0 %	50 %	25 %	25 %	350273260
5047	NC_016050	TGA	2	6	282026	282031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273260
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5049	NC_016050	AGT	2	6	282072	282077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273260
5050	NC_016050	TA	3	6	282093	282098	50 %	50 %	0 %	0 %	350273260
5051	NC_016050	ACTA	2	8	282141	282148	50 %	25 %	0 %	25 %	350273260
5052	NC_016050	ATA	2	6	282172	282177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273260
5053	NC_016050	TAT	2	6	282180	282185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273260
5054	NC_016050	GTTG	2	8	282270	282277	0 %	50 %	50 %	0 %	350273260
5055	NC_016050	TTAAAG	2	12	282488	282499	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	350273260
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5058	NC_016050	GAA	2	6	282577	282582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273260
5059	NC_016050	TGG	2	6	282603	282608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	350273260
5060	NC_016050	TGA	2	6	282687	282692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273260
5061	NC_016050	GTA	2	6	282719	282724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273260
5062	NC_016050	TGT	2	6	282737	282742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350273260
5063	NC_016050	TCT	2	6	282743	282748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273260
5064	NC_016050	AGGGTA	2	12	282806	282817	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	350273260
5065	NC_016050	AT	3	6	282830	282835	50 %	50 %	0 %	0 %	350273260
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5070	NC_016050	TTA	2	6	283115	283120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273260
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5073	NC_016050	CCGTG	2	10	283238	283247	0 %	20 %	40 %	40 %	350273260
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5105	NC_016050	GTA	2	6	286785	286790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273263
5106	NC_016050	ATA	2	6	286816	286821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273263
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5110	NC_016050	ACTTA	2	10	286942	286951	40 %	40 %	0 %	20 %	350273264
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5113	NC_016050	TAAT	2	8	287040	287047	50 %	50 %	0 %	0 %	350273264
5114	NC_016050	GTT	2	6	287069	287074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350273264
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5120	NC_016050	GTAT	2	8	287219	287226	25 %	50 %	25 %	0 %	350273264
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5122	NC_016050	AGA	2	6	287272	287277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273264
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5492	NC_016050	TGC	2	6	308253	308258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273280
5493	NC_016050	ACTG	2	8	308298	308305	25 %	25 %	25 %	25 %	350273280
5494	NC_016050	AAG	2	6	308414	308419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273280
5495	NC_016050	GGCAAT	2	12	308516	308527	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	350273280
5496	NC_016050	TTTTG	2	10	308547	308556	0 %	80 %	20 %	0 %	350273280
5497	NC_016050	GCTA	2	8	308572	308579	25 %	25 %	25 %	25 %	350273280
5498	NC_016050	GCA	2	6	308584	308589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273280
5499	NC_016050	GA	3	6	308594	308599	50 %	0 %	50 %	0 %	350273280
5500	NC_016050	A	7	7	308599	308605	100 %	0 %	0 %	0 %	350273280

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