MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia japonica YH

Total Repeats: 22440

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016050	TTG	2	6	249415	249420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350273237
4502	NC_016050	AGC	2	6	249454	249459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273237
4503	NC_016050	T	6	6	249462	249467	0 %	100 %	0 %	0 %	350273237
4504	NC_016050	CAT	2	6	249483	249488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273237
4505	NC_016050	AGT	2	6	249535	249540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273237
4506	NC_016050	T	6	6	249577	249582	0 %	100 %	0 %	0 %	350273237
4507	NC_016050	TAA	2	6	249626	249631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273237
4508	NC_016050	TAATT	2	10	249642	249651	40 %	60 %	0 %	0 %	350273237
4509	NC_016050	TACTTC	2	12	249766	249777	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	350273238
4510	NC_016050	CTA	2	6	249803	249808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273238
4511	NC_016050	T	6	6	249809	249814	0 %	100 %	0 %	0 %	350273238
4512	NC_016050	CAT	2	6	249815	249820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273238
4513	NC_016050	CAG	2	6	249836	249841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273238
4514	NC_016050	TCTTT	2	10	249911	249920	0 %	80 %	0 %	20 %	350273238
4515	NC_016050	AGC	2	6	249927	249932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273238
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4517	NC_016050	TGA	2	6	249996	250001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273238
4518	NC_016050	T	6	6	250028	250033	0 %	100 %	0 %	0 %	350273238
4519	NC_016050	TAAAC	2	10	250042	250051	60 %	20 %	0 %	20 %	350273238
4520	NC_016050	GCA	2	6	250057	250062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273238
4521	NC_016050	T	6	6	250063	250068	0 %	100 %	0 %	0 %	350273238
4522	NC_016050	TCA	2	6	250099	250104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273238
4523	NC_016050	ACC	2	6	250155	250160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	350273238
4524	NC_016050	GCTT	2	8	250194	250201	0 %	50 %	25 %	25 %	350273238
4525	NC_016050	AGG	2	6	250281	250286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350273238
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4527	NC_016050	ATC	2	6	250380	250385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273238
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4529	NC_016050	TAG	2	6	250421	250426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273238
4530	NC_016050	CGAT	2	8	250432	250439	25 %	25 %	25 %	25 %	350273238
4531	NC_016050	CGC	2	6	250454	250459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350273238
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4533	NC_016050	CTT	2	6	250517	250522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273238
4534	NC_016050	AGC	2	6	250545	250550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273238
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4536	NC_016050	T	7	7	250608	250614	0 %	100 %	0 %	0 %	350273238
4537	NC_016050	CTT	2	6	250619	250624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273238
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4541	NC_016050	ATC	2	6	250740	250745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273238
4542	NC_016050	CTA	2	6	250801	250806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273238
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4546	NC_016050	TTG	2	6	251009	251014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350273238
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4550	NC_016050	TTG	2	6	251195	251200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350273238
4551	NC_016050	CAT	2	6	251213	251218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273238
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4553	NC_016050	CAG	2	6	251276	251281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273238
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4555	NC_016050	T	6	6	251291	251296	0 %	100 %	0 %	0 %	350273238
4556	NC_016050	AATG	2	8	251301	251308	50 %	25 %	25 %	0 %	350273238
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4560	NC_016050	GTTA	2	8	251475	251482	25 %	50 %	25 %	0 %	350273238
4561	NC_016050	TAT	2	6	251535	251540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273238
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4563	NC_016050	TATT	2	8	251770	251777	25 %	75 %	0 %	0 %	350273239
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4567	NC_016050	CGAT	2	8	251866	251873	25 %	25 %	25 %	25 %	350273239
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4605	NC_016050	TAT	2	6	253641	253646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273240
4606	NC_016050	CATGG	2	10	253667	253676	20 %	20 %	40 %	20 %	350273240
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4613	NC_016050	CAT	2	6	253982	253987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273241
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4618	NC_016050	AT	3	6	254415	254420	50 %	50 %	0 %	0 %	350273242
4619	NC_016050	TAA	2	6	254435	254440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273242
4620	NC_016050	TTCT	2	8	254446	254453	0 %	75 %	0 %	25 %	350273242
4621	NC_016050	TA	3	6	254480	254485	50 %	50 %	0 %	0 %	350273242
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4623	NC_016050	ATC	2	6	254564	254569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273242
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4995	NC_016050	ACT	2	6	277252	277257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273257
4996	NC_016050	ACG	2	6	277266	277271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273257
4997	NC_016050	TGA	2	6	277326	277331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273257
4998	NC_016050	GTGC	2	8	277354	277361	0 %	25 %	50 %	25 %	350273257
4999	NC_016050	TA	3	6	277362	277367	50 %	50 %	0 %	0 %	350273257
5000	NC_016050	TAA	2	6	277381	277386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273257

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