MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Roseburia hominis A2-183 chromosome

Total Repeats: 1412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015977	ATTTGA	2	12	2358	2369	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347530300
2	NC_015977	GATATT	2	12	2599	2610	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347530300
3	NC_015977	CCGATG	2	12	5664	5675	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347530303
4	NC_015977	ACAGGC	2	12	7412	7423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530304
5	NC_015977	CAGAAG	2	12	10605	10616	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	347530307
6	NC_015977	ATCGGT	2	12	11181	11192	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347530307
7	NC_015977	GCGAAC	2	12	13702	13713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530310
8	NC_015977	AATGAG	2	12	17343	17354	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	347530315
9	NC_015977	GCAGGA	2	12	19603	19614	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	347530317
10	NC_015977	GCTGTC	2	12	21861	21872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347530319
11	NC_015977	AATGAA	2	12	22701	22712	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347530320
12	NC_015977	TTTGTG	2	12	35507	35518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347530326
13	NC_015977	GGACTG	2	12	38386	38397	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	347530328
14	NC_015977	TGACAG	2	12	39053	39064	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347530329
15	NC_015977	AACAGA	2	12	42497	42508	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	347530330
16	NC_015977	AACTGC	2	12	45974	45985	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	347530334
17	NC_015977	TATAAG	2	12	46205	46216	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347530334
18	NC_015977	TATGAT	2	12	49889	49900	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347530337
19	NC_015977	ACCGGC	2	12	52772	52783	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	347530339
20	NC_015977	TGACTG	2	12	53695	53706	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347530340
21	NC_015977	TGCCAG	2	12	56690	56701	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347530343
22	NC_015977	GATATT	2	12	56769	56780	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347530343
23	NC_015977	TGATAA	2	12	60239	60250	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347530345
24	NC_015977	GGCGAA	2	12	65598	65609	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	347530353
25	NC_015977	GGTGCC	2	12	73015	73026	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	347530359
26	NC_015977	GATCGG	2	12	80445	80456	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	347530364
27	NC_015977	GGAAAA	2	12	85768	85779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530368
28	NC_015977	AAAAAG	2	12	87489	87500	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	347530370
29	NC_015977	GTGGCG	2	12	89444	89455	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	347530372
30	NC_015977	GAATCT	2	12	91166	91177	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	347530374
31	NC_015977	CGGCAT	2	12	96363	96374	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347530378
32	NC_015977	AGACGG	2	12	103763	103774	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	347530382
33	NC_015977	GCTTGC	2	12	106399	106410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347530386
34	NC_015977	CGGCAG	2	12	106425	106436	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	347530386
35	NC_015977	TATTGG	2	12	107590	107601	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	347530387
36	NC_015977	CTTGCG	2	12	108976	108987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347530388
37	NC_015977	CATCGA	2	12	113756	113767	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	347530392
38	NC_015977	TACTCG	2	12	122978	122989	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347530400
39	NC_015977	TCCAGA	2	12	123460	123471	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	347530401
40	NC_015977	TGCGAG	2	12	123771	123782	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	347530401
41	NC_015977	TCATTG	2	12	135861	135872	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	347530412
42	NC_015977	ACGATT	2	12	136359	136370	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	347530413
43	NC_015977	TTTCTG	2	12	138877	138888	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	347530415
44	NC_015977	ACAGGC	2	12	140375	140386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530416
45	NC_015977	GCACCG	2	12	140995	141006	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	347530416
46	NC_015977	GGAAAA	2	12	147873	147884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530423
47	NC_015977	GACGGT	2	12	150066	150077	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	347530426
48	NC_015977	GTGCGC	2	12	153962	153973	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	347530430
49	NC_015977	CAGAGA	2	12	154230	154241	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	347530431
50	NC_015977	CTGATC	2	12	155231	155242	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347530431
51	NC_015977	TTCGGA	2	12	162136	162147	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347530436
52	NC_015977	TGCGAG	2	12	162723	162734	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	347530437
53	NC_015977	GCCGGT	2	12	163573	163584	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	347530438
54	NC_015977	ATCTGC	2	12	171601	171612	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347530444
55	NC_015977	TGCGGT	2	12	171922	171933	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	347530445
56	NC_015977	GGGCAG	2	12	172098	172109	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	347530445
57	NC_015977	AGGCGA	2	12	179885	179896	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	347530452
58	NC_015977	TTTGCG	2	12	181795	181806	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	347530454
59	NC_015977	CATTCT	2	12	183092	183103	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	347530455
60	NC_015977	TGATCG	2	12	183732	183743	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347530456
61	NC_015977	GATGCG	2	12	185637	185648	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	347530457
62	NC_015977	GGAAAG	2	12	192715	192726	50 %	0 %	50 %	0 %	347530463
63	NC_015977	CAAACC	2	12	193740	193751	50 %	0 %	0 %	50 %	347530463
64	NC_015977	AGCGCA	2	12	196227	196238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530466
65	NC_015977	GAAAAA	2	12	199289	199300	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	347530469
66	NC_015977	AGATTC	2	12	202925	202936	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	347530471
67	NC_015977	AAAAGG	2	12	207511	207522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530476
68	NC_015977	TGCTGA	2	12	210313	210324	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347530479
69	NC_015977	AGCTTC	2	12	216991	217002	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347530486
70	NC_015977	AAGGTT	2	12	219207	219218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530489
71	NC_015977	GGCTTA	2	12	219243	219254	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347530489
72	NC_015977	AAGGTC	2	12	222101	222112	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347530492
73	NC_015977	CAATGT	2	12	231114	231125	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	347530494
74	NC_015977	ACCGGA	2	12	231516	231527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530494
75	NC_015977	GGAACC	2	12	233764	233775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530494
76	NC_015977	ACGGCA	2	12	234286	234297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530494
77	NC_015977	ACAGCG	2	12	235798	235809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530494
78	NC_015977	CAATAA	2	12	239953	239964	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	347530496
79	NC_015977	GCAGGA	2	12	242621	242632	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	347530501
80	NC_015977	AAGCCG	2	12	242694	242705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530501
81	NC_015977	CGGCGT	2	12	249811	249822	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	347530507
82	NC_015977	GGCAAA	2	12	250954	250965	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	347530508
83	NC_015977	GATGCC	2	12	253089	253100	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347530509
84	NC_015977	ATCTTG	2	12	255291	255302	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	347530511
85	NC_015977	GAGACA	2	12	257858	257869	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	347530512
86	NC_015977	CGTGAC	2	12	258013	258024	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347530512
87	NC_015977	GGCACT	2	12	259780	259791	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347530513
88	NC_015977	GGTTCA	2	12	262648	262659	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347530516
89	NC_015977	TGCAGG	2	12	273517	273528	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	347530527
90	NC_015977	TGGCGG	2	12	275849	275860	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	347530529
91	NC_015977	CGCCTA	2	12	276383	276394	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	347530530
92	NC_015977	CGAGAG	2	12	277588	277599	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	347530531
93	NC_015977	GATTGA	2	12	282577	282588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530537
94	NC_015977	GAAGGT	2	12	288451	288462	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	347530543
95	NC_015977	GCGATT	2	12	295120	295131	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347530550
96	NC_015977	CCGTCA	2	12	295942	295953	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	347530552
97	NC_015977	CTGCAT	2	12	300039	300050	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347530556
98	NC_015977	AATCGG	2	12	300588	300599	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347530556
99	NC_015977	GCAACG	2	12	302551	302562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530557
100	NC_015977	GGAAGC	2	12	303932	303943	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	347530559
101	NC_015977	GAAAAA	2	12	306320	306331	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	347530560
102	NC_015977	TCTATT	2	12	307657	307668	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	347530561
103	NC_015977	AATGTA	2	12	308098	308109	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347530561
104	NC_015977	AGGCAG	2	12	316532	316543	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	347530569
105	NC_015977	GCTGAT	2	12	318107	318118	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347530570
106	NC_015977	TCAGCT	2	12	320584	320595	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347530572
107	NC_015977	CGGAGA	2	12	321882	321893	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	347530573
108	NC_015977	TTGTGG	2	12	322707	322718	0 %	50 %	50 %	0 %	347530575
109	NC_015977	AGCCAG	2	12	329432	329443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530582
110	NC_015977	GATCAA	2	12	334565	334576	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	347530589
111	NC_015977	GATGCG	2	12	336583	336594	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	347530593
112	NC_015977	TCCGGT	2	12	337191	337202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347530594
113	NC_015977	GATGCA	2	12	337232	337243	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347530594
114	NC_015977	TGTTGC	2	12	342441	342452	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	347530601
115	NC_015977	GCGCAG	2	12	343386	343397	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	347530601
116	NC_015977	ACAGGC	2	12	347853	347864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530607
117	NC_015977	CAGTAC	2	12	347881	347892	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	347530607
118	NC_015977	GCAAGG	2	12	348377	348388	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	347530607
119	NC_015977	GCCACC	2	12	349338	349349	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	347530608
120	NC_015977	CCTTGG	2	12	351538	351549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347530608
121	NC_015977	CCAGCT	2	12	357414	357425	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	347530614
122	NC_015977	TAAAAA	2	12	363615	363626	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	347530618
123	NC_015977	GCCGGA	2	12	373326	373337	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	347530627
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127	NC_015977	CCCCGC	2	12	377175	377186	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	347530632
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131	NC_015977	TTGATG	2	12	385297	385308	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	347530642
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133	NC_015977	GAGAAA	2	12	391574	391585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530648
134	NC_015977	TCTTAT	2	12	394412	394423	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	347530651
135	NC_015977	GTAGCT	2	12	396260	396271	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347530652
136	NC_015977	ATTGCC	2	12	397991	398002	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347530653
137	NC_015977	TTGGCG	2	12	398353	398364	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	347530654
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182	NC_015977	TCTGTA	2	12	501899	501910	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	347530754
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220	NC_015977	GTTGCA	2	12	601481	601492	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347530844
221	NC_015977	GTAAAC	2	12	601520	601531	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	347530844
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223	NC_015977	GGAAAA	2	12	604840	604851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530848
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226	NC_015977	GAAAAA	2	12	616792	616803	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	347530860
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228	NC_015977	GAAAAT	2	12	620345	620356	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347530864
229	NC_015977	CTTCAG	2	12	624033	624044	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347530870
230	NC_015977	TATCTG	2	12	632723	632734	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	347530872
231	NC_015977	AGAAAG	2	12	634708	634719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530874
232	NC_015977	GAGGCG	2	12	640861	640872	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	347530879
233	NC_015977	GCTGAA	2	12	641350	641361	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347530880
234	NC_015977	GGATAT	2	12	641890	641901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530881
235	NC_015977	CCTTGG	2	12	647858	647869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347530887
236	NC_015977	TCCGGT	2	12	648192	648203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347530888
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253	NC_015977	GTGCAG	2	12	675242	675253	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	347530911
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300	NC_015977	ATCAGC	2	12	830531	830542	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	347531058
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302	NC_015977	TTACGA	2	12	834172	834183	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	347531063
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321	NC_015977	GAGCCG	2	12	865062	865073	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	347531090
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324	NC_015977	ACTTGG	2	12	871427	871438	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347531095
325	NC_015977	TCGGCG	2	12	874562	874573	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	347531098
326	NC_015977	ATCTTT	2	12	888392	888403	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	347531111
327	NC_015977	GCACTG	2	12	889584	889595	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347531112
328	NC_015977	GGCAAA	2	12	891911	891922	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	347531115
329	NC_015977	TCGGTG	2	12	893344	893355	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	347531115
330	NC_015977	GTACTC	2	12	896178	896189	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347531117
331	NC_015977	CTGGCA	2	12	899493	899504	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347531119
332	NC_015977	AGGTGC	2	12	902996	903007	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	347531122
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334	NC_015977	CGCTTG	2	12	905489	905500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347531124
335	NC_015977	AGGAAC	2	12	912403	912414	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	347531133
336	NC_015977	GATGCA	2	12	916225	916236	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347531137
337	NC_015977	CCGGAT	2	12	919939	919950	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347531141
338	NC_015977	GACGGT	2	12	925599	925610	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	347531145
339	NC_015977	ATTTTC	2	12	926686	926697	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	347531145
340	NC_015977	AGACAA	2	12	937277	937288	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	347531157
341	NC_015977	CCAGCT	2	12	938602	938613	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	347531159
342	NC_015977	CCGGTT	2	12	938785	938796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347531159
343	NC_015977	TCCTCA	2	12	938874	938885	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	347531159
344	NC_015977	TTCCAG	2	12	939407	939418	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347531159
345	NC_015977	GATTGC	2	12	940246	940257	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347531160
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434	NC_015977	TGTATC	2	12	1153940	1153951	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	347531345
435	NC_015977	AGGATG	2	12	1154153	1154164	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	347531345
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437	NC_015977	TTCCTA	2	12	1162933	1162944	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	347531353
438	NC_015977	CCGATA	2	12	1165668	1165679	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	347531354
439	NC_015977	TTTCAT	2	12	1166345	1166356	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	347531354
440	NC_015977	GATTGT	2	12	1167746	1167757	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	347531356
441	NC_015977	GCGCTG	2	12	1169099	1169110	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	347531358
442	NC_015977	TGCTTG	2	12	1174272	1174283	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	347531362
443	NC_015977	GAGGAA	2	12	1176109	1176120	50 %	0 %	50 %	0 %	347531363
444	NC_015977	GATCCG	2	12	1177433	1177444	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347531364
445	NC_015977	ATTCTG	2	12	1178405	1178416	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	347531365
446	NC_015977	GGATGC	2	12	1181687	1181698	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	347531369
447	NC_015977	CGCAAG	2	12	1181816	1181827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347531369
448	NC_015977	ATTTGC	2	12	1183765	1183776	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	347531372
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450	NC_015977	CGGCGA	2	12	1185713	1185724	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	347531374
451	NC_015977	CGGAAG	2	12	1189955	1189966	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	347531377
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