MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Roseburia hominis A2-183 chromosome

Total Repeats: 46054

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015977	TGA	2	6	35	40	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530299
2	NC_015977	AAG	2	6	175	180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530299
3	NC_015977	TTC	2	6	245	250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347530299
4	NC_015977	CTT	2	6	272	277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347530299
5	NC_015977	TAA	2	6	282	287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347530299
6	NC_015977	AAT	2	6	373	378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347530299
7	NC_015977	GGA	2	6	451	456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347530299
8	NC_015977	TGA	2	6	641	646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530299
9	NC_015977	GAT	2	6	649	654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530299
10	NC_015977	TAT	2	6	663	668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347530299
11	NC_015977	GAA	2	6	688	693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530299
12	NC_015977	CCG	2	6	722	727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347530299
13	NC_015977	ATT	2	6	736	741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347530299
14	NC_015977	GCC	2	6	756	761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347530299
15	NC_015977	GAA	2	6	781	786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530299
16	NC_015977	CGA	2	6	900	905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530299
17	NC_015977	ATC	2	6	1042	1047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347530299
18	NC_015977	TTA	2	6	1082	1087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347530299
19	NC_015977	GAT	2	6	1128	1133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530299
20	NC_015977	GCT	2	6	1230	1235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347530299
21	NC_015977	CGG	2	6	1236	1241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347530299
22	NC_015977	CAT	2	6	1257	1262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347530299
23	NC_015977	AGA	2	6	1274	1279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530299
24	NC_015977	TGT	2	6	1941	1946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347530300
25	NC_015977	GAC	2	6	1971	1976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530300
26	NC_015977	GAT	2	6	2023	2028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530300
27	NC_015977	AAG	2	6	2090	2095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530300
28	NC_015977	TCT	2	6	2111	2116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347530300
29	NC_015977	GAG	2	6	2170	2175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347530300
30	NC_015977	AAG	2	6	2254	2259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530300
31	NC_015977	TTC	2	6	2300	2305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347530300
32	NC_015977	GGA	2	6	2316	2321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347530300
33	NC_015977	CTC	2	6	2430	2435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347530300
34	NC_015977	CAA	2	6	2460	2465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347530300
35	NC_015977	CTC	2	6	2500	2505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347530300
36	NC_015977	ATC	2	6	2530	2535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347530300
37	NC_015977	TTC	2	6	2653	2658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347530300
38	NC_015977	GAG	3	9	2683	2691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347530300
39	NC_015977	GAT	2	6	2737	2742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530300
40	NC_015977	GAT	2	6	2819	2824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530301
41	NC_015977	TCA	2	6	2854	2859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347530301
42	NC_015977	CGG	2	6	2984	2989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347530301
43	NC_015977	TGA	2	6	3094	3099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530302
44	NC_015977	GAT	2	6	3208	3213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530302
45	NC_015977	GAA	2	6	3227	3232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530302
46	NC_015977	GAA	3	9	3292	3300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530302
47	NC_015977	CGG	2	6	3417	3422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347530302
48	NC_015977	GAA	2	6	3598	3603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530302
49	NC_015977	ATC	2	6	3605	3610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347530302
50	NC_015977	CGG	2	6	3676	3681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347530302
51	NC_015977	CGA	2	6	3718	3723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530302
52	NC_015977	GAC	2	6	3803	3808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530302
53	NC_015977	CTG	2	6	3809	3814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347530302
54	NC_015977	CAG	2	6	3860	3865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530302
55	NC_015977	TGC	2	6	3939	3944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347530302
56	NC_015977	GAT	2	6	3947	3952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530302
57	NC_015977	CAG	2	6	3970	3975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530302
58	NC_015977	CTG	2	6	3989	3994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347530302
59	NC_015977	CAT	2	6	4018	4023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347530302
60	NC_015977	TCA	2	6	4276	4281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347530303
61	NC_015977	TGA	2	6	4312	4317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530303
62	NC_015977	GGA	2	6	4381	4386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347530303
63	NC_015977	CGG	2	6	4468	4473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347530303
64	NC_015977	GGC	3	9	4481	4489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347530303
65	NC_015977	CGG	2	6	4504	4509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347530303
66	NC_015977	GCA	2	6	4945	4950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530303
67	NC_015977	ATG	2	6	4965	4970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530303
68	NC_015977	AAT	2	6	4988	4993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347530303
69	NC_015977	ATC	2	6	4994	4999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347530303
70	NC_015977	ATC	2	6	5141	5146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347530303
71	NC_015977	GAG	2	6	5159	5164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347530303
72	NC_015977	AGC	2	6	5241	5246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530303
73	NC_015977	GAA	2	6	5281	5286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530303
74	NC_015977	GCG	2	6	5327	5332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347530303
75	NC_015977	AGA	2	6	5354	5359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530303
76	NC_015977	GAA	2	6	5422	5427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530303
77	NC_015977	CCG	2	6	5457	5462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347530303
78	NC_015977	GAT	2	6	5584	5589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530303
79	NC_015977	ACA	2	6	5643	5648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347530303
80	NC_015977	ATC	3	9	5651	5659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347530303
81	NC_015977	CCG	2	6	5768	5773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347530303
82	NC_015977	GAA	2	6	5788	5793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530303
83	NC_015977	ACG	2	6	5814	5819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530303
84	NC_015977	CAA	3	9	5863	5871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347530303
85	NC_015977	AGC	2	6	5910	5915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530303
86	NC_015977	GAC	2	6	5923	5928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530303
87	NC_015977	TTC	2	6	5980	5985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347530303
88	NC_015977	ACG	2	6	6005	6010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530303
89	NC_015977	ATG	2	6	6169	6174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530304
90	NC_015977	GAA	2	6	6182	6187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530304
91	NC_015977	AAC	2	6	6309	6314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347530304
92	NC_015977	TCG	2	6	6349	6354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347530304
93	NC_015977	GCT	3	9	6492	6500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347530304
94	NC_015977	TGA	2	6	6590	6595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530304
95	NC_015977	TTA	2	6	6712	6717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347530304
96	NC_015977	GAG	2	6	6774	6779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347530304
97	NC_015977	CCG	2	6	6835	6840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347530304
98	NC_015977	CCG	2	6	7076	7081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347530304
99	NC_015977	GAA	2	6	7230	7235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530304
100	NC_015977	AGA	2	6	7245	7250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530304
101	NC_015977	GAA	2	6	7275	7280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530304
102	NC_015977	ATT	2	6	7301	7306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347530304
103	NC_015977	ATA	2	6	7318	7323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347530304
104	NC_015977	GCA	3	9	7348	7356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530304
105	NC_015977	GCT	2	6	7544	7549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347530304
106	NC_015977	GAG	2	6	7563	7568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347530304
107	NC_015977	TTC	2	6	7570	7575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347530304
108	NC_015977	AGA	2	6	7602	7607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530304
109	NC_015977	GGA	2	6	7643	7648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347530304
110	NC_015977	TGA	2	6	7772	7777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530304
111	NC_015977	TGA	2	6	7798	7803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530304
112	NC_015977	TTC	2	6	7827	7832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347530304
113	NC_015977	ATC	2	6	7908	7913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347530304
114	NC_015977	GAA	2	6	8018	8023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530304
115	NC_015977	GAC	2	6	8088	8093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530304
116	NC_015977	GAA	2	6	8108	8113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530304
117	NC_015977	ATA	2	6	8119	8124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347530304
118	NC_015977	GTC	2	6	8247	8252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347530304
119	NC_015977	TGA	2	6	8284	8289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530304
120	NC_015977	TCG	2	6	8401	8406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347530304
121	NC_015977	AAT	2	6	8435	8440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347530304
122	NC_015977	CTT	2	6	8493	8498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347530304
123	NC_015977	GGC	2	6	8630	8635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347530304
124	NC_015977	GCA	2	6	8649	8654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530304
125	NC_015977	GAA	2	6	8663	8668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530304
126	NC_015977	AGC	2	6	8669	8674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530304
127	NC_015977	GAT	2	6	8700	8705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530304
128	NC_015977	TTG	3	9	8956	8964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347530305
129	NC_015977	GCA	3	9	9081	9089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530305
130	NC_015977	TGG	2	6	9156	9161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347530305
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255	NC_015977	CCG	2	6	18867	18872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347530316
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257	NC_015977	CCG	2	6	19021	19026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347530316
258	NC_015977	GCA	2	6	19038	19043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530316
259	NC_015977	GCT	2	6	19053	19058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347530316
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